iamnull0000的博客

BLUPF90号称遗传评估领域的三剑客之一(另外两个分别是ASREML和DMU), 其应该是最先开发了支持基因组数据的模块, 并且里面的基因组数据过滤筛选非常友好。除了上述优势外，BLUPF90还具有以下功能： SSGWAS：之前的GWAS都是基于G矩阵或SNP数据, 现在可以同时利用系谱和SNP信息； PCA分析：之前的PCA都是基于G矩阵或者SNP数据, 现在可以利用H矩阵来进行群体划分； 亲子鉴定：BLUPF90的seekparents模块在进行系谱矫正、亲子鉴定分析时, 速度非常快! 重复样本和异常样本检查：BLUPF90的模块在检查样本可能存在的重复或者异常现象时使用方便； H逆矩阵的输出与再利用：BLUPF90输出的H逆矩阵，在DMU和ASREML中同样适用。