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原创 挫折中前行-aspera下载数据

最开始时使用wget、axel 、crul,受网速的限制下载较慢。后续看到相关文章说通过此种方式下载可能会导致下载的原始数据缺失,所以不推荐以上方式下载。一、通过aspera工具进行下载1.1安装aspera工具#通过conda安装aspera工具conda install -y -c hcc aspera-cli#解压tar -zxvf ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz#运行安装包bash ibm-aspera-co

2020-11-30 16:43:52 899 3

原创 挫折中前行,学习笔记

R包的下载:一、设置镜像:rm(list = ls())options()$reposoptions()$BioC_mirroroptions(BioC_mirror='https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/')options('repos' = c(CRAN = 'https://mirrors.tunaa.tsinghua.edu.cn/CRAN/'))options()$BioC_mirror或者直接通过Rstudio设置镜像:Tools->Glo

2020-11-29 11:22:03 121

原创 (在线)设计引物

方法一、通过primer bank1、输入需要设计引物的基因或者序列(here),选择相应的基因名类型以及物种名,然后点击submit2、尽量选择含有Validation Results的引物选项(有实验验证),Tm值在60左右点开Validation Results查看实验结果,图示单峰值可用于后续验证,多峰值则无法使用!!!3、合适的序列然后在NCBI中进行blast-->Nucleotide把一条引物序列输入后,查看是否有选项需要改变,然后blast

2020-11-18 20:40:20 3542

原创 Python中的OS标准库学习

**OS库**一、基本介绍os库提供通用的,基本的操作系统交互功能路径操作:os.path子库,处理文件路径及信息进程管理:启动系统中其他程序环境参数:获得系统软硬件信息等环境参数二、常用命令os.path子库指令用途os.path.normpath(path)归一化path的表示形式,统一用\分隔路径os.path.abspath(path)返回path在当前系统中的绝对路径os.path.relpath(path)返回当前程序与文件之间的相对路

2020-11-17 11:31:00 154

原创 砥砺前行-Linux学习随笔^-^!

Linux:免费、开源、安全高效、稳定、处理高及并发强的一种操作系统**一、**主要发行版本:CentOS(目前已被Redhat公司收购,暂时还是完全免费),Red hat(部分免费),Ubantu(更新较快,桌面制作较好),Suse,红旗Linux…**二、对于操作系统的一般输入路径:人-应用软件-shell层-操作系统-硬件**三、**Linux中的目录信息(Linux中各种文件的存储是以’/'为‘根’的树形图):/Linux中根目录/dev管理设备/media目录

2020-11-16 20:17:11 78

空空如也

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