前言
病毒的爆发并不单单只有中国这人口大国,纵观整个地球,2020 年,还有很多国家也在“水深火热”中努力进行着“自救”。美国,近几个月来爆发了非常致命的流感--乙型流感病毒,据相关数据统计,到目前为止全美范围已经有超 1300 万人感染了该病毒, 12 万人住院治疗,死亡人数可能高达 6600 多人;波兰,2019 年 12 月 31 日至 2020 年 1 月 4 日,该国卢布林省和大波兰省发生 8 起 H5N8 亚型高致病性禽流感,此次疫情可能导致多达 4 万只禽类被宰杀,方圆3公里多达 35 万只家禽受到威胁;中国,农业农村新闻办公室 2 月 1 日发布,湖南省邵阳市双清区发生一起家禽 H5N1 亚型高致病性禽流感疫情,养殖户存栏肉鸡 7850 只,发病死亡 4500 只,疫情发生后,当地按照有关预案和防治技术规范要求切实做好疫情处置工作,已扑杀家禽 17828 只,全部病死和扑杀家禽均已无害化处理......
在病毒面前,人类真的很脆弱,此次新型冠状病毒虽然致死率低,但传染性极强,如果传播过程中发生了可怕的变异,导致致死率提升,那么造成的后果难以估量。如果大家早期能够认识到病毒的危害,提高自我防范意识,那么就能有效的控制疫情的蔓延。此次春节在家,发现大多数的长辈都对此次疫情不以为然,依旧到处串门喝茶聊天,进出人群密集的地方时,不戴口罩,多番劝阻无果,很是无奈,依旧有部分人不了解病毒的危害。
此篇文章就以 HIV 病毒为例,采用 2/3D 结合的可视化效果,直观展示病毒的微观世界。补充说明:人类免疫缺陷病毒 ( Human Immunodeficiency Virus;abbe:HIV ),即艾滋病 ( AIDS,获得性免疫缺陷综合症) 病毒,属逆转录病毒的一种。
效果预览:
动态案例预览地址:https://www.hightopo.com/demos/index.html
HIV 活性实验台
该模块主要模拟在不同环境不同试剂的情况下,病毒活性的变化。
功能点1:左侧为实验控制台,可拖拽其值进度条来改变数值,通过一定的计算公式进而去动态修改 3D 场景中病毒的活性面板的相关显示值。
功能实现:监听 2D 图纸的交互器,在图元拖拽中进行去进行相关参数值的修改( addInteractorListener,简写为 mi ),接着通过模型中 Data 元素属性变化监听器( addDataPropertyChangeListener,简写为 md )去监听每一次参数的变化,然后通过一定的计算公式去计算活性面板的最终显示值,最后以数据驱动方式去修改活性面板的数据。
主要代码:
// 获取病毒图元
this._virusNode = virus2D.dm().getDataByTag('virusNode');
// 对图元进行缩放
function setScale(value) {
this._virusNode.setScale(value, value);
}
this.g2d.dm().mp(function (e) {
if (e.property === "a:virusScale") {
if (this.virus2D) {
setScale(e.newValue);
this._virusNode.setScale(value, value);
}
}
}, this);
功能点2:放大镜查看。
功能实现:根据放大镜左侧倍数控制器的值去动态设置放大镜中图元的缩放值。
主要代码:
let params = {
duration: 10000, // 动画周期毫秒数,默认采用`ht.Default.animDuration`
easing: (t) => { return t }, // 动画缓动函数,默认采用`ht.Default.animEasing`
action: (v, t) => {
this.virus.forEach((i, index) => {
let count = 0;
if (i.a('count')) {
count = i.a('count');
} else {
count = 0;
}
count += 0.5;
let scale = this.virusScales[index] +
0.1 *
Math.cos(
(((count % 36) * Math.PI) / 180) * 10 +
((360 / this.virus.length) * index * Math.PI) /
180
);
i.eachChild(data => {
data.setScale3d(scale, scale, scale);
});
i.a('count', count)
})
},
finishFunc: () => {
if (this._continuous) {
this.breating();
}
}, // 动画结束后调用的函数。
}
功能点3:病毒成分剖面示意图及其 RNA 链。 2D 及 3D 的效果展示,使微观病毒更加具象化,帮助人们更加清晰的认识病毒。
功能点4: 3D 场景中病毒的呼吸效果。
功能实现:使用 HT 的动画功能,不断的去设置病毒图元自身的缩放值。
主要代码:
let params = {
duration: 10000, // 动画周期毫秒数,默认采用`ht.Default.animDuration`
easing: (t) => { return t }, // 动画缓动函数,默认采用`ht.Default.animEasing`
action: (v, t) => {
this.virus.forEach((i, index) => {
let count = 0;
if (i.a('count')) {
count = i.a('count');
} else {
count = 0;
}
count += 0.5;
let scale = this.virusScales[index] +
0.1 *
Math.cos(
(((count % 36) * Math.PI) / 180) * 10 +
((360 / this.virus.length) * index * Math.PI) /
180
);
i.eachChild(data => {
data.setScale3d(scale, scale, scale);
});
i.a('count', count)
})
},
finishFunc: () => {
if (this._continuous) {
this.breating();
}
}, // 动画结束后调用的函数。
}
免疫系统侵入演示
动画步骤描述:
① 病毒侵入,免疫激活
开始:场景中只有三个白细胞(两个小的白细胞离大号的较远);
过程:病毒渐显(粉色颗粒,上面无附着抗体标记);
结束:场景中只存在三个白细胞和病毒
② 白细胞释放趋化因子和增值化学物质
开始:画面中有三个白细胞和六个病毒;
过程:趋化因子从大号白细胞内部释放出来,渐显,而后另外两个白细胞向大号靠近到一定距离,然后趋化因子渐渐消失
结束:场景中存在三个白细胞(两个小的白细胞靠近大号的)、六个病毒
③ 白细胞产生抗体标记靶向细菌/病毒
开始:场景中有三个白细胞(两个小的白细胞靠近大号的)和六个病毒;
过程:抗体标记从大号白细胞里渐显飞出,最后附着在病毒上,此时出现提示面板(内容:病毒/细菌被白细胞标记抗体),最后面板渐隐
结束:场景中存在三个白细胞(两个小的白细胞靠近大号的)、六个病毒和抗体标记(附着在病毒上)
④ 白细胞吞噬靶向细胞/病毒
开始:场景中存在三个白细胞(两个小的白细胞靠近大号的)、六个病毒和抗体标记(附着在病毒上)
过程:大号白细胞出现提示面板(内容:白细胞被吸引到标记抗体处,面板渐显渐隐后,大号白细胞移动至四个病毒区域,二号白细胞移动至两个病毒区域,三号朝病毒区域中心移动轻微移动一小段,稍微停顿后,白细胞恢复初始位置,病毒、抗体标记消失
结束:场景中只存在三个白细胞
⑤ HIV 病毒侵入进入白细胞
开始:场景中存在三个白细胞
过程:出现几个病毒,然后HIV病毒渐显,再然后进入到一号白细胞内部
结束:场景中存在三个白细胞,一个 HIV 病毒,两三个粉色病毒
⑥ HIV 病毒在白细胞内复制,白细胞死亡
开始:场景中存在三个白细胞,一个 HIV 病毒(在一号白细胞内部),两三个粉色病毒
过程:HIV 病毒开始复制(体现在数量增多),然后三个白细胞同时缩小到原来的一半
结束:场景中存在三个白细胞(体积缩小),三个 HIV 病毒
⑦ HIV 病毒跑出,细菌增生免疫系统破坏成功
开始:场景中存在三个白细胞(体积缩小),三个 HIV 病毒
过程:HIV病毒跑出一号白细胞,同时白细胞渐隐直至消失,而后粉色病毒增多
结束:场景中只存在三个 HIV 病毒,多个粉色病毒
动画实现:ht.Default.startAnim 的动画函数,示例代码如下:
ht.Default.startAnim({
frames: 12, // 动画帧数
interval: 10, // 动画帧间隔毫秒数
easing: function(t){ return t * t; }, // 动画缓动函数,默认采用`ht.Default.animEasing`
finishFunc: function(){ console.log('Done!') }, // 动画结束后调用的函数。
action: function(v, t){ // action函数必须提供,实现动画过程中的属性变化。
...
}
});
除了以上动画外,该模块还新增了两个控制项:控制动画播放速度(修改动画的 duration 参数值)及 3D 场景的视角(修改 eye)。
实现代码:
function getPositionByZoom(arr, zoom) {
return [arr[0] * zoom, arr[1] * zoom, arr[2] * zoom];
}
this.g2d.dm().mp(function (e) {
if (e.property === 'a:stepIndex') {
// 做演示动画
this.stepIndex = e.newValue;
this['anim' + (e.newValue + 1)]();
} else if (e.property === 'a:screenZoom') {
let value = e.newValue;
if (this._eye) {
let newEye = getPositionByZoom(this._eye, value);
this.g3d.setEye(newEye);
}
} else if (e.property === 'a:playSpeed') {
this.speed = 1 / e.newValue;
}
})
药物抑制原理演
该模块主要演示生物酶抑制剂和化学消毒/去污药剂对病毒活性的影响。通过改变试剂的用量来模拟计算出病毒的活性率、复制速度、感染性、突变几率。动画演示中涉及的 3D 图元的位移方法。通过绘制一条管道轨迹线来实现。
// 偏移动画
let g3d = this.g3d;
let params = {
frames: 100, // 动画帧数
interval: 30, // 动画帧间隔毫秒数
easing: (t) => { return t }, // 动画缓动函数,默认采用`ht.Default.animEasing`
action: (v, t) => {
let pipe;
this.moveNodes.forEach((i, index) => {
if (index < 2) {
pipe = this.pipe1;
} else {
pipe = this.pipe2;
}
let length = g3d.getLineLength(pipe),
offset = g3d.getLineOffset(
pipe,
length * t
),
point = offset.point,
px = point.x,
py = point.y,
pz = point.z,
tangent = offset.tangent,
tx = tangent.x,
ty = tangent.y,
tz = tangent.z;
i.p3(px, py, pz);
i.lookAt([px + tx, py + ty, pz + tz], 'right');
i.a('angle', t * Math.PI * 120);
})
},
finishFunc: () => {
if (this._continuous) {
this.move();
}
}, // 动画结束后调用的函数。
}
this.anim = ht.Default.startAnim(params);
结语
这个春节,一场突如其来的疫情防控阻击战,在中华大地骤然打响,这是一场没有硝烟的战争,无论是医护人员,还是基础工作者,他们在疫情爆发的那一刻,就拿起了“武器”奔赴“战场一线”。病毒并不会因为他们是医护人员而“网开一面”,岁月静好,是因为有人在为我们负重前行,感谢那些在疫情中为我们奔赴前行的人,在疫情面前,我们没有一个人能置身事外。“宅”在家,这是对自己负责,对他人负责,更是对社会、对国家最大的支持。中华儿女从不畏惧任何困难,不会退缩,我们坚信这场战争我们肯定能赢,也必须要赢。
上期我也分享了关于科技早班车:HTML5 WebGL 实现 3D 地图,助力疫情实时数据可视化的内容,助大家更为直观了解疫情蔓延的分布趋势。有兴趣的可以了解一下~