COAWST耦合模式介绍及其安装

1 COAWST 模式简介

COAWST 模型是由美国地质调查局(U.S. Geological Survey)和美国伍兹霍尔海洋研究所(The Woods Hole Oceanographic Institution)联合开发的海洋-大气-波浪-泥沙耦合模型。COAWST由多个模型组成，包括区域海洋模型(ROMS)、天气研究和预报模式(WRF)、浅海波浪模型(SWAN)，和泥沙输运模型(CSTMS)等。由于实际的海洋动力环境十分复杂，潮流、波浪、沉积物时刻耦合，并有各自的时空运动尺度，而 COAWST 模型的优势之一就是这些子模型进行不同的组合和嵌套，通过数据交换耦合器(MCT)进行耦合，来提高整体模型的时空分辨率，增加模拟物理过程的复杂性，从而可以将海气交互，浪流相互作用考虑在内，使得模拟结果与实际海洋环境更加吻合。

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2 安装依赖软件

• Zlib 

• HDF5 

• NetCDF-C 

• NETCDF-FORTRAN 

• Openmpi 

• MCT 

3 下载 COAWST 代码

mkdir COAWST

cd COAWST svn checkout --username 用户名https://coawstmodel.sourcerepo.com/coawstmodel/COAWST .

4 安装软件

4.0 设置相关环境变量

vim ~/.bashrc 

export SRC=安装包所在目录

export DIR=软件库安装位置

export CC=icc export CXX=icpc

export FC=ifort

export F90=ifort

export F77=ifort

export PATH=$DIR/hdf5-1.10.5/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=$DIR/hdf5-1.10.5/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export HDF5_HOME=$DIR/hdf5-1.10.5

export HDF5_INCDIR=$HDF5_HOME/include

export HDF5_LIBDIR=$HDF5_HOME/lib

export PATH=$DIR/netcdf4.4/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=$DIR/netcdf4.4/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export NETCDF=$DIR/netcdf4.4 export NETCDF_INC=$NETCDF/include

export NETCDF_LIB=$NETCDF/lib

export NETCDF_INCDIR=$NETCDF/include

export NETCDFPATH=$NETCDF

export MCT_LIBDIR=$DIR/MCT/lib

export MCT_INCDIR=$DIR/MCT/include

export LD_LIBRARY_PATH=$DIR/openmpi/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export LIBRARY_PATH=$DIR/openmpi/lib:$LIBRARY_PATH

export PATH=$DIR/openmpi/bin:$PATH

保存 退出 

source ~/.bashrc 

4.1 安装 ZLIB

cd $SRC

wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/zlib-1.2.8.tar.gz

tar -xzf zlib-1.2.8.tar.gz

cd zlib-1.2.8

./configure --prefix=$DIR/zlib-1.2.8

make

make install

4.2 安装 HDF5 

cd $SRC

wget http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/hdf5-1.10.5.tar.gz

tar -zxf hdf5-1.10.5.tar.gz

cd hdf5-1.10.5

./configure --prefix=$DIR/hdf5-1.10.5 --with-zlib=$DIR/zlib-1.2.8

make

make install

4.3 安装 NetCDF-C

编译netcdf与编译coawst必须使用相同的编译器，即在configure之后加上FC=ifort F77=ifort F90=ifort CXX=icpc CC=icc 。

cd $SRC

wget https://github.com/Unidata/netcdf-c/archive/v4.4.0.tar.gz

tar -xzf v4.4.0.tar.gz

cd netcdf-c-4.4.0

./configure --prefix=$DIR/netcdf4.4 --enable-netcdf-4 --enable-shared FC=ifort F77=ifort F90=ifortCXX=icpc CC=icc CPPFLAGS="-I$DIR/hdf5-1.10.5/include -I$DIR/zlib-1.2.8/include -I$DIR/netcdf4.4/include" LDFLAGS="-L$DIR/hdf5-1.10.5/lib -L$DIR/zlib-1.2.8/lib -L$DIR/netcdf4.4/lib"

make

make install

./nc-config --all

4.4 安装 NETCDF-FORTRAN

cd $SRC

wget https://github.com/Unidata/netcdf-fortran/archive/v4.4.3.tar.gz

tar -xzf v4.4.3.tar.gz

cd netcdf-fortran-4.4.3

export LD_LIBRARY_PATH=$DIR/netcdf4.4/lib:$LD_LIBRARY_PATH

./configure --prefix=$DIR/netcdf4.4 --enable-shared FC=ifortF77=ifort F90=ifort CXX=icpc CC=icc CPPFLAGS="-I$DIR/hdf5-1.10.5/include -I$DIR/netcdf4.4/include" LDFLAGS="-L$DIR/hdf5- 1.10.5/lib -L$DIR/netcdf4.4/lib"

make

make install

./nf-config --all

4.5 安装Openmpi 

cd $SRC

wget https://www.open-mpi.org/software/ompi/v2.0/downloads/openmpi-2.0.2.tar.gz

tar xvf openmpi-2.0.2.tar.gz

cd openmpi-2.0.2

./configure --prefix=$DIR/openmpiCC=icc CXX=icpc FC=ifort F90=ifort F77=ifort

make

make install

4.6 安装 MCT

cd ~/COAWST/Lib/MCT

./configure --prefix=$DIR/MCTMPIHEADER=-I$DIR/openmpi/include

make

make install

5 编译 Inlet_test 

Inlet算例是测试ROMS和SWAN之间相互耦合的理想算例。模型域为一个15x14 km的矩形，初始深度均为4 m。该区域被分为两个区域:向海(顶部)和后屏障(底部)区域。朝向大海的区域是开放的，西部、北部和东部边缘都有辐射条件。后屏障区域由四面墙围合，并通过一个2公里宽的入口与向海区域相连。该模型受潮汐和波浪的影响。在北侧边界施加一个振荡水位，潮汐振幅为1米。北侧也有波浪，高度为1米，向南的波浪周期为10秒。

                    模拟0.5天的流场和有效波高

cd  ~/COAWST/Projects/Inlet_test/Coupled 

将COAWST目录下的coawst.bash拷贝至该目录下 

编辑 coawst.bash ，然后编译

vim coawst.bash

COAWST_APPLICATION=INLET_TEST

export MY_ROOT_DIR=~/COAWST

export USE_MPI=on

export USE_MPIF90=on

export which_MPI=openmpi

export FORT=ifort

export USE_NETCDF4=on

export MY_HEADER_DIR=${PWD}

export MY_ANALYTICAL_DIR=${PWD}

#保存退出coawst.bash

#编译，若生成 coawstM，编译成功 ./coawst.bash -j 4

6 编辑 ocean_inlet_test.in

VARNAME = ~/COAWST/ROMS/External/varinfo.dat

GRDNAME = inlet_test_grid.nc 

SPOSNAM = stations_inlet_test.in

SPARNAM = sediment_inlet_test.in

7 编辑 swan_inlet_test.in

更改网格、水深文件路径 

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8 运行 

mpirun -n 2 ./coawstM coupling_inlet_test.in

作者简介：王程浩 交通运输部天津水运工程科学研究院， 研究领域为海洋沉积动力学。

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