蛋白质互作工具开发笔记(一)——整体计划实施

项目是依据《基于支持向量机的线虫蛋白质相互作用判别》中第四章内容开发一个通过给定的互作文件和DIP(Database of Interacting Protein,DIP)给出的数据得到互作信息并生成可供向量机处理的向量。


操作系统:Windows

开发环境:Visual C++ 2010、Visual C++ 6.0


整体计划:

(1)准备阶段(5天)

开发出各个部分的子程序

子程序包括:

  • DipToAmino ——分析互作文件得到氨基酸序列
  • TransferAmino ——根据参数确定物化性质并将氨基酸序列处理成只含L/M/H三种字符的序列
  • VectorConstructor ——向量构建器,根据任一L/M/H序列得到特征向量
  • 出错管理程序
  • GUI界面

(2)整合阶段(3天)

调试通过各个子程序的功能并在Visual Studio中用工程来完成,然后加上界面。

(3)测试与修改阶段(1周)




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