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原创 生信宝典:生物信息学习系列教程、视频、资源

欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需...

2018-01-31 10:02:40 10616 3

转载 药物三元复合物结构预测:人大高瓴黄文炳团队与浙大杨易团队、UCLA邓炜先团队合作在《自然-通讯》发表文章

近日,中国人民大学高瓴人工智能学院副教授黄文炳团队与浙江大学杨易团队、加州大学洛杉矶分校(UCLA)邓炜先团队合作在《自然-通讯》(Nature Communications)发表了题为“SE(3)-Equivariant Ternary Complex Prediction Towards Target Protein Degradation”的文章,该研究构建了一种基于SE(3)-等变图神经网络的端到端结构预测方法——DeepTernary,可直接预测 PROTAC 和分子胶诱导的三元复合物结构。

2025-07-08 21:02:07 20

转载 酵母中开发萜类化合物合成的通用平台

效应,利用葡萄糖生产化学物质的工程酿酒酵母常常受到自身固有发酵代谢的阻碍,因为大多数葡萄糖被分流给产物乙醇,这大大阻碍了其他目标产物(除乙醇以外)的生产。介导的的前体合成平台,作者在酵母菌株中设计萜类合成途径,目标是将细胞内中间浓度的提高转化为萜类合成的增加。作者在生产萜烯前体的菌株中,以不同的摩尔比分别饲喂异戊二醇和丙烯醇。与下游萜类前体形成途径的组合,建立了一个通用、高效的酵母平台,用于各种萜类产品的生物合成。表达对天然下游途径的影响(尤其是磷酸丙烯醇的合成),作者测定了细胞内的中间代谢物的量,包括。

2025-07-07 21:01:35 49

转载 iMetaOmics | 高引论文10篇 (2025.6)

目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2025-07-06 21:02:53 126

转载 陈润生:在科学上做一些别人没想也没做的事情 | 吾家吾国

因为在解好这个序列里面,找不同的学科、不同的专家们想出了很多的办法,比方说物理学家想出非线性的办法,数学家用了复杂度的定义,把一段基因看成一个复杂的花样,那我在想我能够用什么学来看什么花样呢?在这个没有完整图例比对的拼图游戏里,信息传递的带上加了很多混淆的东西,而其中真正有意义的东西只是一小部分,密码学其实就是在这个传递的密码带上找出真正有意义的那部分。

2025-07-05 21:01:00 37

转载 新闻资讯|未来十年,英格兰将对所有新生儿进行全基因组测序

Francis Crick研究所的遗传学家Robin Lovell-Badge指出,基因信息的收集只是第一步,真正的关键在于如何解读这些信息,以及如何与家属进行有效沟通。这项举措是NHS十年战略的一部分,旨在将医疗服务从“诊断与治疗”转型为“预测与预防”,以缓解日益加重的医疗资源压力。英国卫生大臣Wes Streeting表示,这项技术的引入将帮助NHS从“治疗疾病”的机构,转变为一个“预测与防控疾病”的健康服务体系。高颜值免费 SCI 在线绘图。最全植物基因组数据库IMP。点击图片直达文字对应教程。

2025-07-04 21:02:08 24

转载 MicrobiomeStatPlots | 蜂窝图教程Hexbin Plot

蜂窝图的主要目的是更好的呈现高密度区域的数据趋势,并减少在这些区域可能出现的重叠。结果表明,与历史上的爪哇人和已灭绝的犀牛基因组相比,现在的犀牛基因组表现出显著较低的GWH(单因素方差分析,n=8,F=7.4,p=0.04)。图3.c,坍塌的DNA链在模拟耗竭、凝聚素耗竭和凝聚素耗竭的提取物中保持在一起的时间,其中纯化的凝聚素预加载到DNA上。与粘着蛋白缺失的提取物相比,在模拟缺失的提取物中,坍塌的姐妹DNA保持显著且可重复的关联时间更长,这表明粘着蛋白有助于子链的物理关联。高颜值免费 SCI 在线绘图。

2025-07-02 21:01:21 24

转载 iMeta 讲坛20 | 李长超-如何打造高影响力论文:第一作者的全流程攻略

李长超,香港理工大学杰出博士后研究员,香港研资局新晋学者计划研究员。目前发表学术论文四十篇,其中以第一作者在Nature、The Innovation、iMeta、Environmental Science & Technology、Water Research等国际权威期刊上发表论文十余篇。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!

2025-07-02 21:01:21 55

转载 第十四届全国生物信息学与系统生物学学术大会(第二轮通知)

本次大会将围绕生物信息学与系统生物学的最新研究进展和热点问题,设置大会主旨报告、大会报告、分会场报告、专题论坛、墙报展示等多种形式的学术交流活动。会议将邀请生物信息学各个前沿方向的学术大师、国内外杰出专家学者做大会报告,大会投稿评选出的学者作分论坛报告,分享他们在该领域的最新研究成果和前沿动态。个专委会各组织一个分会场(每个分会场时长半天),这些专委会体现了当今生物信息学各个前沿方向,并特设“东盟。论坛的主题分别如下所示。评审讨论,择优收录大会摘要集,并遴选分会场报告、墙报交流、闭幕式评奖。

2025-07-02 21:01:21 60

转载 iMetaOmics | 杨光/贾书磊等发布 BioMGCore:在复杂微生物组中批量提取生物代谢基因簇

如果基因簇内的基因与其他无关基因分开,则“-g”参数可以设置间隔的基因数量,在连锁的基因组中表现为≥2个基因(基因间间隔 ≤ 10)均可作为候选基因簇。本研究基于关键词匹配和基因邻近原则开发了一个基因簇提取工具包—BioMGCore,可识别并批量提取微生物核心代谢基因簇(metabolic gene clusters, MGCs),该工具包能够从gutSMASH或antiSMASH注释结果中批量提取MGCs,实现数据的降维,有助于探索微生物中的初级和次级代谢物,从而提高分析效率并发掘潜在的微生物代谢物。

2025-07-01 21:03:46 36

转载 GPB专访 | 全球人类肠道微生物菌株遗传多样性解析

虽然许多结论,过去研究也多有报道,比如菌株在不同地域人群间的差异,菌株在人与人之间的传播,以及特定的菌株分类与宿主健康的关联等等,但是本研究提供了一个更全面更深度的分析,并在技术和数据上提供了一些创新。不同研究工作的基本数据可能是共同的,而研究方向及侧重不同,所以在保证合作的基础上,又希望团队的个人有各自的专注和技术特长。在肠道菌群研究过去前十几年的蓬勃发展中,随着测序技术的广泛应用,对菌群的定义的精准性基本都在菌种水平上,也重新刷新了许多菌种的定义,比如前些年Segata教授团队就将。

2025-07-01 21:03:46 30

转载 关于申报2025年度道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室开放课题(第二批)的通知

以实现道地药材的可持续发展和利用为目标,支持道地药材品质保障及评价、道地药材遗传规律及形成机制、道地药材生态种植及产品研发、道地药材活性成分合成调控研究、珍稀濒危中药资源保护与生产、动物药、外来药与新资源研究、本草考古、疫病中药防治、大健康产品开发、学科建设及人才培养等。面向中药资源持续利用的国家战略需求,凝聚国内外优势力量,拟开展药用资源调查技术规范制定、资源信息收集、边境资源调查、重点资源评估等研究,从而促进中药和各国民族药、传统药物的研究与开发。全国征集,与中国中医科学院中药资源中心联合申报。

2025-06-30 21:00:44 380

转载 欢迎与我联系 | 中国中医科学院中药资源中心2025年“呦呦鹿鸣”暑期夏令营活动方案

中心有国家中医药管理局4个高水平重点学科,道地药材生态遗传、中药资源遥感监测与区划2个重点研究室,中药资源生态、生药分子鉴定2个三级实验室,“一带一路”药用植物资源开发与利用基地。11. 硕士研究生还需提交代表性学术成果证明材料(任意2项及以上),中文期刊论文右上角标注CJCR影响因子和期刊属性(“中医药科技期刊分级目录T1级期刊/T2级期刊”或“中国科技期刊卓越行动计划入选期刊”或“当年中国科技期刊引证报告CJCR影响因子0.3以上的核心期刊”),并提供当年CJCR影响因子查询结果证明;

2025-06-30 21:00:44 50

转载 Nature 6.19 | 饶毅教授专访;胎儿流产基因组研究;致癌突变遭遇克星

每一次活产都是在克服重重困难的情况下发生的,因为在人类繁殖过程中,许多事情都可能—而且经常—出错。自然流产在人类中非常常见,影响了大约15%的临床认可的妊娠,还有相当一部分在临床认可之前就已经流产。尽管存在这种普遍性和几种已知的早期流产原因,但许多流产仍然无法解释,这加剧了父母的痛苦,并阻碍了对未来怀孕的准确风险评估。在大约55%的病例中确定了可能的遗传原因,说明了遗传在生殖和早期发育过程中可能出错的许多方式。《科学新时代中,开放透明的合作仍是关键》《适应性措施下的气候变化对全球农业影响》

2025-06-29 21:02:00 34

转载 iMetaOmics | 先进院戴磊组-解析菊粉干预期间肠道菌群的个体化动态特征

点击蓝字 关注我们纵向分析揭示人类肠道微生物组对菊粉的时序性及个性化响应iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70029● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70029● 2025年6月15日,中国科学院深圳先进技术研究院戴磊、美国布莱根妇女医院和哈佛医学院刘洋彧等在iMetaOmics在线发表

2025-06-29 21:02:00 98

转载 我们为什么行远路? | 张泽民校长在2025届学生毕业典礼上的讲话

我还在网上翻看了同学们的毕业感悟,看到有同学说“入学时的白大褂从崭新变得斑驳,自己也从新手小白逐渐游刃有余”,有同学说“在解剖刀下读懂了生命的重量,白大褂里仍怀揣着最初的炽热”,还有同学说“从遗憾的泪洒,到坦然的接受,相信自己可以成为称职的医者”……同学们,这路怎能不远。在瞻仰钱惪教授捐赠纪念展时,我在一张泛黄的手稿前久久伫立,感慨万千,那是钱惪先生在1987年因当时卧病已久写下的,题目叫“我的希望”,他是这么写的:“回顾过去几十年,我做了应做、能做的事,大致问心自安,似乎应该做得再好些,重医应该再好些”

2025-06-28 21:03:01 120

转载 喜讯 |《中医药科学(英文)》入选“中国科技期刊提能拓展计划”

中国科技期刊提能拓展计划”锚定2035年建成科技强国战略目标,遴选支持一批对我国未来科技创新和产业发展具有战略意义、学术水平较高、发展潜力较大的学会主办科技期刊,培育中国科技期刊卓越行动计划后备梯队,为我国科技期刊梯次进阶、集约发展、整体提升奠定基础,推动更多一流期刊脱颖而出。入选“中国科技期刊提能拓展计划”,不仅是对既往奋斗的肯定,更是对未来征程的期许。在主编、编委和作者的大力支持下,《中医药科学(英文)》的影响力不断提升。项目资助额度为10万元/年,连续支持3年。《中医药科学(英文)》的快速发展。

2025-06-27 21:01:23 31

转载 Science:耗时十年,地球生物基因组计划推进全球生物测序新纪元

如果EBP能够完成167万物种的基因组测序,将彻底改变我们对地球生物多样性的认识,为子孙后代留下宝贵的科学遗产。此外,生物多样性热点区域(如亚马逊雨林和东南亚)的科研资源不足,也限制了测序工作的推进。然而,EBP并非一路坦途。例如,智利的千人基因组计划通过公众投票选出首个测序物种,并在高中推广基因组学教育。)、动物到真菌和原生生物,EBP的初步目标是构建一个生物多样性基因组数据库,为基础研究与应用科学提供关键数据支持。尽管目标调整,EBP仍在稳步推进,并致力于以更低的成本实现全球物种基因组的高质量测序。

2025-06-26 21:03:11 47

转载 Nature专访饶毅教授:中国如何能够成为生物科技超级大国?

1980 年代,饶毅在美国开启职业生涯,2007 年,他辞去美国西北大学终身教职,全职回国,出任北京大学生命科学学院院长,他引入了多项举措,使中国生命科学研究重焕生机,其中包括采用终身教职制度和同行评审来评估学者的学术成就。例如,1950 年,中华人民共和国刚刚成立,具有国际教育背景的中国博士学者还很少,从中国科学院到北京大学和清华大学,许多担任科学和教育领导职务的人都在国外获得了博士学位。中国在精准医疗方面落后于美国,因为中国在人类遗传学研究方面较为薄弱,而在意义不大的 DNA 测序方面却过于泛滥。

2025-06-26 21:03:11 114

转载 8月3日相聚新疆库尔勒 | 第一届植物生物技术前沿论坛!(第二轮会议通知)

请填写住宿预定回执表,并邮件形式发至订房联系人,收到订房确认邮件后为预定成功。通过银行汇款的参会代表请在缴费后尽快通过个人中心提交汇款凭证和是否需要开具发票的信息,以便核对查询。注册费报销凭证将以电子发票(全电发票)的形式发送至预留邮箱,请务必正确填写邮箱信息,请在交费后。前沿技术领域的最新成果和进展,加强相关领域科研人员之间的交流与合作,促进研究成果转化和应用。欢迎大家积极参会,有意愿作报告的各位专家和优秀学者,请和各分会召集人或金双侠教授直接联系。人,以收到注册费先后为序,额满为止,请参会代表在网站。

2025-06-25 21:03:43 62

转载 北京大学临床医学高等研究院陈扬课题组博士后招聘启事

如国家资助博士后研究人员计划,香江学者计划、澳门青年学者计划、国际交流计划学术交流项目和医学部博雅博士后等项目,以及国家自然科学基金、北京市自然科学基金、中国博士后科学基金等。2024年9月21日上午,2025届全国普通高校毕业生就业促进周双选活动将在提子科技大学思群广场举行。2024年9月21日上午,2025届全国普通高校毕业生就业促进周双选活动将在提子科技大学思群广场举行。2024年9月21日上午,2025届全国普通高校毕业生就业促进周双选活动将在提子科技大学思群广场举行。

2025-06-24 21:02:35 54

转载 学科前沿 | 北京大学叶敏团队与合作者在植物芹糖基转移酶研究中取得新进展

将其与在欧芹中挖掘得到的PcApiGT和甘草GuApiGT比较分析,利用获得的1套PcApiGT/UDP和2套PcApiGT/UDP/糖受体复合物结构,结合理论计算与定点突变实验,阐明了CaApiGT为代表的黄酮3-O-糖苷芹糖基转移酶与GuApiGT/PcApiGT为代表的黄酮7/4′-O-糖苷芹糖基转移酶的糖受体选择性机制,发现了蛋白活性口袋中一个关键α-helix发挥的重要作用。如有侵犯作者著作权,请及时与我们联系(Tel:025-83271227,或直接在微信平台留言),我们将及时更正或删除。

2025-06-24 21:02:35 42

转载 连载 | 基因组如何进化?(5) 基因共线性

注意,虽然匹配的索引序列 (红色标记)的顺序相同,但小鼠谱系中的DNA。在随后的反应中,单链DNA拷贝的进一步处理导致L1元件的新双链DNA拷贝的产生,该拷贝插入到初始切口的位置。这种类型的净损失,在所有这些区域都是典型的,其解释了小鼠基因组中的DNA比人类基因组少14%的事实。因此,我们的基因组大小,被认为与人类和小鼠的最后一个共同祖先的基因组大小几乎没有变化,而小鼠的基因组只小了约。靶DNA时,L1元件 (红色)的转位开始。正如预期的那样,人类与黑猩猩的基因组比人类与小鼠的基因组更相似,尽管这三个。

2025-06-23 21:01:32 57

转载 Nature专访饶毅教授:中国如何能够成为生物科技超级大国?团结起来共享数据

1980 年代,饶毅在美国开启职业生涯,2007 年,他辞去美国西北大学终身教职,全职回国,出任北京大学生命科学学院院长,他引入了多项举措,使中国生命科学研究重焕生机,其中包括采用终身教职制度和同行评审来评估学者的学术成就。例如,1950 年,中华人民共和国刚刚成立,具有国际教育背景的中国博士学者还很少,从中国科学院到北京大学和清华大学,许多担任科学和教育领导职务的人都在国外获得了博士学位。中国在精准医疗方面落后于美国,因为中国在人类遗传学研究方面较为薄弱,而在意义不大的 DNA 测序方面却过于泛滥。

2025-06-23 21:01:32 123

转载 连载 | 基因组如何进化?(6) 基因组大小与重复序列

蛋白的人类和河豚基因的基因组序列比较。这两个基因 (红线)都包含67个短外显子,它们以 1:1 的对应关系排列;虽然最初是一个谜,但我们现在对较类似生物体之间基因组大小的巨大差异有了一个简单的解释:因为所有脊椎动物都经历了。的脊椎动物中,基因组大小可能会有很大差异,但显然对生物体或其基因的数量无显著影响。在很长一段时间内,这会导致从这种鱼类基因组中,),又名河豚、艇巴,鲀形目-鲀科-东方鲀,属硬骨鱼。在大多数研究良好的脊椎动物的基因组中,占据了很大一部分。,产于黄海、渤海和东海,北太平洋西部,为暖水性。

2025-06-22 21:01:38 47

转载 iMeta期刊2024影响因子再创新高(全球Top 0.3%,全国第5)

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,2025年6月获影响因子33.2,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2025-06-21 21:00:57 297

转载 国自然基金委:下一步,在青年科学基金A类中为35岁以下科研人员单设赛道!

然而,科学基金团队类项目的资助强度高,存在一定程度的“论资排辈”现象,与“大牛”领衔的大团队相比,优秀的青年团队难有机会获得资助。“这项技术是全球竞争的制高点,我们的相关发现实现了世界首次”“希望用 5 到 10 年弄通原理,10 到 15 年实现产业化应用”“此前我们已形成良好的交叉合作研究基础,将以各自所长继续服务于这一课题”……,打破以往“台阶式”的人才成长路径,及早发现有潜力的优秀青年人才,给予最长 20 年的高强度稳定支持,使其能够“十年磨一剑”开展高水平基础研究。有没有证据支持你们的学术假说?

2025-06-21 21:00:57 116

转载 连载 | 基因组如何进化?(7) 推断古基因组序列

此外,在5个位置中,只有1个位置的核苷酸差异会导致编码氨基酸的差异 (V>M)。因此,可以合理地假设,现代马蹄蟹的基因组在保留对功能至关重要的特征的同时,一定与 (我们仅通过化石记录所知的)其已灭绝的祖先的基因组,有很大不同。中重建出来,揭示了我们人类的祖先与欧洲的尼安德特人杂交,且现代人从他们那里继承了特定的基因 (下图。进化与自然的选择,必然保持了马蹄蟹基因组的关键功能特性,以导致其谱系在形态上的稳定性。亿年前的共同祖先的大部分基因组序列,此祖先即为狗、鼠、兔、犰狳和人类等如此多样化物种的前体 (

2025-06-19 21:02:13 26

转载 iMeta  近3年植物类文章合集(25.06更新)

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,目标是成为影响因子大于15的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!iMeta 近3年植物类文章合集(25.06更新)

2025-06-18 21:02:33 86

转载 hLife | 一滴指尖血,打造快速便捷的免疫检测新模式

论文共同通讯作者、深圳先进院研究员杨慧表示,“未来我们将结合蛋白探针的理性设计、人工智能分类算法等新兴技术,持续提升平台的通用性、检测灵敏度和信息解析能力,推动其发展为传染病防控体系的核心技术单元(图5)。研究团队正在进一步开发高稳定性的样本保存方案和适应基层环境的简化操作流程,将结合蛋白探针的理性设计、人工智能分类算法等新兴技术,持续提升平台的通用性、检测灵敏度和信息解析能力,推动其发展为传染病防控体系的核心技术单元。”谭骁天表示,“相比需要数天周期的传统方法,该平台显著提升了检测速度与效率(图4)。

2025-06-17 21:02:49 96

转载 iMeta | 南农土壤生态实验室-解析噬菌体介导的全球沙门氏菌毒力基因传播

点击蓝字 关注我们全球病毒组介导沙门氏菌毒力基因传播和宿主反馈机制iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70042● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70042● 2025年5月20日,南京农业大学孙明明和加泰罗尼亚水研究所Jose Luis Balcazar等在iMeta在线发表了题

2025-06-16 21:01:36 78

转载 文献速递 | Cell 2025.5.29 面向临床医生的微生物组研究;疾病相关蛋白质组;拟南芥单细胞

Cell》为半月刊,由美国细胞出版社发行,聚焦分子生物学、细胞生物学等微观领域的原创性研究;其以深度挖掘生命科学机制见长,论文多涉及基因调控、信号通路等微观层面的突破。通过UKBB、Finngen或GNPC等大规模研究或小型研究产生的血浆蛋白质组,可以使用本研究中提出的新方法进行分析,以确定。蛋白质组学研究的进展加深了我们对疾病生物学的理解。,这些蛋白质以后可用于鉴定新的生物标志物,以及复杂特征和疾病的原因及药物靶点。,并为在不同疾病的血浆蛋白质组学中更广泛的应用铺平道路。

2025-06-16 21:01:36 31

转载 iMetaOmics期刊 第2卷第2期 在线正式发布

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!以深邃的宇宙为背景,主视觉中一轮日食悬于天际,外围炽热的日冕光晕与暗影交织,象征高海拔地区强烈的紫外线对皮肤菌群的塑造与挑战。两人指尖微距间的悬停状态,隐喻微生物的研究与开发利用仍处于一片蓝海。原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70022。

2025-06-15 21:00:48 82

转载 hLife | VarEPS-MPXV: 猴痘病毒变异预警系统助力精准防控

系统通过整合基因组学、结构生物学、环境与社会因素,实现了对已观测变异和潜在虚拟变异的双重预警,为猴痘疫情的精准防控提供科学工具,为全球公共卫生决策提供了多维数据支撑(图2)。该系统不仅支持在线检索、数据下载与交互式可视化,还提供基于变异位点的在线分析工具,包括变异识别、时空追踪、多维度评估、环境及社会因素注释,助力研究人员快速锁定高风险变异,为早期干预与疫苗策略优化提供关键依据。未来,随着数据的持续积累与方法的迭代优化,这一平台或可进一步深化对病毒演化规律的理解,并为公共卫生决策提供更具前瞻性的支持。

2025-06-14 21:01:48 60

转载 iMeta期刊 第4卷第3期 在线正式发布

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!六一儿童节的欢快脚步渐近,膳食纤维、益生菌、益生元、合生元与后生元悄然集结,宛若无形的"微生态哨兵",编织成一面透明的防护盾,借短链脂肪酸的魔法星尘,为肠道镀上天然守护光,将牛奶、鸡蛋等九大食物过敏原悄然阻隔。所有过敏的忧虑都消融在精灵们编织的梦幻气泡里,孩童的笑声在阳光下恣意绽放。

2025-06-13 21:02:09 81

转载 Nature 5.22~29 | CAR-T可能损害大脑;通用科学AI;丹尼索瓦人之谜;CRISPR人体试验

Nature》为周刊,隶属于英国自然出版集团,涵盖自然科学全领域,并设有专门的生命科学板块;关于定居东亚并在今天的人们身上留下遗传遗产的"幽灵氏族"的线索,正在出现。联合国海洋会议,为各国提供修正海洋健康发展路径的契机。上的人们从丹尼索瓦人那里继承了4~6%的遗传物质。美国人才外流:《自然》指南:吸引科学家出国的举措。接受CAR-T细胞治疗的人的大脑显示出炎症迹象。中发现,与东亚各地的化石发现有关。与人类复杂特征相关的细胞的空间 (分辨)映射。最早羊膜动物足迹重新校准四足动物演化时间线。

2025-06-13 21:02:09 57

转载 Cell Research 一作冯桂海专访 | 不以短期的文章产出为目标

我们在构建模型时候考虑,现代生命科学发展了近百年的时间,产生的诸如基因家族定义、启动子区等信息,一定是对模型是有帮助的,而加入哪些知识、如何加入是我们需要人为干预的,在这个选择的过程中,我们通过与生命科学领域专家深入交流,最后选定了加入的知识及加入方式,尤其通过。1)训练数据模态,除了单细胞转录组数据,空间转录组、单细胞表观组甚至文献信息等数据也包含了丰富信息,因此,在未来的 GeneCompass 版本,除了训练数据数据量的提升,我们也计划增加数据模态的多样性,使得模型具有更大的应用范围。

2025-06-11 21:02:40 67

转载 NC | 中科院植物所在木兰类植物比较基因组学研究及苄基异喹啉生物碱的起源演化方面取得新进展

这类天然化合物主要分布于防己科、罂粟科等基部真双子叶及木兰类植物,具抗炎、镇痛、免疫调节、抗肿瘤和抗病毒等多种活性,在传统医药和现代药物研发领域均具有重要应用价值。)事件进化历史,首次推测了木兰类植物的祖先染色体核型,并进一步阐明了染色体结构和重排的历史。),开展了系统的比较基因组学分析,揭示了木兰类植物在进化过程中的全基因组加倍(,但只有基部真双子叶植物和木兰类植物通过选择性保留这些重复基因而维持了。的生物合成途径已有了较为全面的认识,但木兰类植物中。合成途径的起源和演化历史。点击图片直达文字对应教程。

2025-06-11 21:02:40 54

转载 快讯 | 基因表达也论“出身”和“长相”?中山大学骆观正课题组新文章揭示RNA修饰调控等位基因表达的新机制

尤为引人注目的是,在已知的印记基因中发现了m6A修饰的亲源效应。课题组与中科院动物研究所的李伟研究员、周琪院士团队合作完成的“孤雄小鼠”(仅有父源遗传物质的小鼠),正是通过对关键印记基因进行精准的编辑修正,才突破了哺乳动物单性生殖的屏障(详情见:https://doi.org/10.1016/j.stem.2025.01.005)。正如印记基因的表达受到亲源的严格控制,那么,在更广泛的基因中,那些来自父母双方的、序列可能存在细微差异的等位基因,它们的表达又是如何被精确调控的呢?也可能受到更为复杂的。

2025-06-10 21:01:47 65

转载 第六届全国表观遗传信息学大会(第二轮通知)

毕雪华、陈加余、陈盛泉、陈兴、陈颖丽、程郢、邓伍兰、冯会娟、冯智星、郭帆、郭向前、郭振兴、韩俊伟、韩涟漪、胡秀珍、黄恺、姜宁、蒋岚、靳文菲、赖洪燕、李富义、李茹姣、李笑雨、刘国庆、刘嘉琦、刘君、刘赟、吕昊、罗翔宇、马丽佳、孟佳、宁琳、乔云波、秦玉芳、邱育珊、任间、邵振、盛欣、沈一飞、史偈君、孙宝发、孙晓波、王先龙、魏刚、文波、吴旭东、向云龙、谢芃、邢永强、熊旭深、徐锦、宣成昊、严海丹、严健、颜光玗、杨磊、杨旸、杨扬、叶远浓、张春龙、张帆、张俊鹏、张乃千、张绍军、张伟伟、张杨、赵宏宇、郑辉、周猛、邹欣。

2025-06-09 21:01:59 104

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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