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原创 生信宝典：生物信息学习系列教程、视频、资源
欢迎关注天下博客：http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么参数需...
2018-01-31 10:02:40
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原创 那些年，顶级期刊和国风碰撞过的“图说”
两者在统计规则上或许有些许出入，不过大方向上的文章数量是值得参考的。(想到了电影“百鸟朝凤”，一种守望与执著，是我辈的信仰，也是科研人的信仰)缺陷型肺腺癌具有很强的可塑性，即使在高度失调的氧化刺激下，这些肺腺癌也会经历系统性的重编程向鳞状细胞癌的转移获得耐药性。2019年的暑假，“烟熏妆”哪吒以一种颠覆的姿态重新讲述了关于“我命由我不由天”的故事。一直以外，我们的科研路是荣誉与争议共存，道阻且长的，值此新世代之始，我们想通过简单回顾。的碰撞，来一起触碰往期优秀科研成果，谨以次告示珍惜当下的“余庆”。
2026-01-01 21:01:09
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转载 PBJ|南京农大高志红团队构建梅图形泛基因组解析柠檬酸积累分子调控机制
本研究得到了国家自然科学基金项目（32502637和32372670），江苏省种业振兴项目（JBGS [2021] 019），中央高校基本科研业务费专项资金（KYZZ2025006），中国博士后科学基金面上项目（2023M731734），江苏省卓越博士后项目（2023ZB729）和江苏省高等教育机构优势学科项目（PAPD）的资助和支持。该研究的发表，不仅填补了梅泛基因组研究的空白，更首次揭示了结构变异调控果实有机酸积累的全新机制，为分子设计育种提供了关键靶点。的表达，催生出大量柠檬酸。
2025-12-31 21:03:05
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转载 2026 年2月 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战
为满足广大读者进一步学习的需求，易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划，筹备和专家研讨，现组织和开展临床基因组学专题培训课程，以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术，手把手带您快速入门，节约宝贵的时间，助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具，绘制常用生信相关图形，包括：热图 (变异水平)，maftools图 (基因水平)，基因的结构、变异位置及结构域标记 (棒棒糖图)，基因组Circos图，IGV基因组浏览器，PPI网络图，基因功能的富集结果图。
2025-12-31 21:03:05
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转载 InstaDeep团队提出多物种基因组基础模型Nucleotide Transformer v3，在植物分子表型预测中表现卓越
模型不仅掌握了物种间共享的调控语法，还能有效利用长程上下文解析复杂调控关系，为农业与医学中的跨物种基因组分析提供了可靠工具。模型家族在功能轨迹预测和基因组注释两大任务类别上均取得领先，且性能随模型规模扩大（从8M到650M参数）持续提升。仅8M参数的NTV3小模型所达到的预测精度，已优于此前训练于植物基因组、参数高达10亿的专用模型AgroNT。在多项基准测试中，NTV3在功能轨迹预测与基因组注释任务上均达到。实现单碱基token化与1 Mb上下文的建模，在保持碱基分辨率的同时大幅提升计算效率。
2025-12-30 21:00:52
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转载 iMeta高引论文 | 浙江省农业科学院李有贵团队揭示桑黄多酚抗结肠炎肠道分子机制
点击蓝字 关注我们肠道菌群—芳香烃受体（AhR）轴介导桑黄多酚抗结肠炎作用iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 文章被引（Dimensions截至2025年12月28日）：53● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.180● 2024年3月11日，浙江省农业科学院李有贵、天津中医药大学吴崇明和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队在iMeta在线联合发表了题为 “The
2025-12-30 21:00:52
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转载 iMeta高引论文 | 安医大徐建光/张亨国组-口腔微生物工程化在心血管疾病治疗中的应用与前景
点击蓝字 关注我们工程口腔微生物在心血管疾病治疗中的应用与前景iMeta主页：http://www.imeta.science综述论文● 期刊：iMeta（IF 33.2，中科院双一区Top）● 文章被引（截至2025年12月21日）：69● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.197● 2024年5月9日，安徽医科大学徐建光和张亨国团队在iMeta在线发表了题为 “Cardiovascular disease therapeutics via engineered
2025-12-29 21:02:42
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转载 iMeta高引论文 | 河南农业大学姚文组开发绘制Circos图的交互式Web应用程序
点击蓝字 关注我们shinyCircos‐V2.0: 易用性提高和功能增强的Circos图绘制工具iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 文章被引（截至2025年12月19日）: 78● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.109● 2023年5月8日，河南农业大学姚文团队在 iMeta 在线发表了题为 “shinyCircos-V2.0: Leveraging the
2025-12-28 21:01:46
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转载 NC综述|药用植物基因组研究进展与挑战
此外，通过借鉴作物基因组学研究的许多重要经验，包括种质资源的系统收集和表型评估、大规模的重测序以及泛基因组构建，药用植物的群体基因组学研究将迎来新机遇；单细胞组学技术能够以前所未有的分辨率研究细胞水平上的次生代谢过程，揭示特异代谢物的时空分布和复杂合成途径，利用如单细胞组学这类的新技术将为药用植物研究提供新的视角。水平）药用植物基因组，发现存在关键生物合成基因的缺失或注释不准确的问题，这表明当前多数基因组拼接质量和注释准确性可能仍会制约关键基因的挖掘。余个药用植物基因组（来自。点击图片直达文字对应教程。
2025-12-28 21:01:46
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转载 Targetome 主编郝海平校长和王洪教授原创文章 | 水飞蓟宾+卡维地洛协同靶向Wnt4/β连环蛋白信号通路抗肝纤维化
最新发表的中国药科大学校长郝海平教授、 王洪 教授团队实验性研究，以“解决临床痛点”为核心，通过严谨的“筛选-验证-机制-转化”全链条设计，首次证实“水飞蓟宾+卡维地洛”组合可通过靶向Wnt4/β-连环蛋白信号通路，协同阻断肝星状细胞（ HSCs）活化，且50:1的体内固定配比能剂量依赖性逆转肝纤维化，为临床转化提供了兼具科学性与实用性的实验依据。细胞层面：以原代 HSCs（pHSCs）和人源 HSCs （LX-2细胞）为模型，验证组合对 HSCs活化标志物（α-SMA、COL1A1）的抑制作用；
2025-12-26 21:03:12
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转载 蛋白质组学差异表达分析？雄霸来了
（A）蜘蛛图展示案例研究4中LimROTS（蓝色）和limma（红色）在5种指标上的性能差异：F1分数、标准化马修相关系数（nMCC）、5%假阳性率下的部分ROC曲线下面积（pAUC5%）、几何均值（G-mean）和平衡准确率；（D）每种方法识别的独特差异表达蛋白的主成分分析（PCA）图，红色和蓝色圆点分别代表对照组和阿尔茨海默病（AD）组，每个PCA图上方显示通过广义线性模型（GLM）拟合第1主成分（PC1）得到的克拉格-乌勒伪R²（r²CU）；最全1000+植物核基因组数据库IMP。
2025-12-26 21:03:12
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转载 Adv Sci | 湖北中医药大学黄伟课题组 杂泛性植物O-甲基转移酶的工程改造与SAM再生平台构建
湖北中医药大学硕士研究生熊希然、博士后宋军、硕士研究生李诗涵为论文共同第一作者，李翔教授和李娟教授为论文共同通讯作者，黄伟副教授为论文最后通讯作者，湖北中医药大学为第一通讯单位。组织表达谱显示，大多数基因在根、茎、叶中转录水平较低，仅有三个基因在根中表达较高。种不同结构底物的甲基化，涵盖黄酮类、香豆素类、苯乙酮类、白藜芦醇及蒽醌类化合物。因此，实现精准、高效的甲基化已成为药物研发与天然产物合成中的关键挑战之一。的依赖，为合成高价值甲基化化合物提供了一个可扩展、经济高效的生物催化平台。
2025-12-25 21:02:48
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转载 iMeta高引论文 | 印遇龙院士/郑大魏勇军等综述益生菌发酵中草药的研究进展
点击蓝字 关注我们益生菌发酵中草药的研究进展iMeta主页：http://www.imeta.science综述论文● 期刊：iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 文章被引（截至2025年12月23日）: 67● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.93● 本文综述了使用益生菌发酵中草药的优点、发酵技术、益生菌菌株，并展望了中草药发酵的未来发展。先进的微生物组学和合成生物学工具能够利用微生物细胞工厂以低成本生产大量中草
2025-12-25 21:02:48
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转载 Nat. Biotechnol. | 盘点 2025: Nature Biotechnology 评选的十大生物技术新闻
今年最受关注的新闻，充分展现了生物技术的创造力，也值得被铭记与庆祝：从在极短时间内治愈罕见遗传病患儿“baby KJ”的基因编辑突破，到诱导 HIV“现身”并被清除的双特异性分子；从巴西实现本土低成本 CAR-T 生产，到监管机构推动减少部分药物的动物实验要求。研究人员开发的双特异性 T 细胞受体分子，能够识别并清除 HIV 感染的 T 细胞，为彻底清除病毒储库、实现功能性治愈带来希望。从玉米到香蕉，基因编辑作物结合精准杀虫剂和微生物工程，有望推动可持续农业发展，但如何让最需要的人群受益仍是挑战。
2025-12-24 21:01:20
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转载 Plant J ||广州中医药大学中药学院沈奇团队：艾蒿的比较基因组分析揭示了萜合酶的不对称扩增和青蒿素生物合成的保守性
艾草的核型为 2n=34，属于同源四倍体，在其物种特异性全基因组复制（WGD-3）之前发生了配子染色体融合事件。WGD-3 后的不对称演化是其显著特征，主要表现为等位基因丢失不平衡以及广泛的基因新功能化。（2n=34），揭示其作为同源四倍体的独特进化轨迹——先发生配子染色体融合，再经历物种特异性全基因组复制（WGD-3），且WGD-3后呈现不对称进化特征，表现为等位基因丢失不平衡与广泛新功能化；本研究组装了一个 7.88Gb 的染色体水平单倍型解析基因组，揭示了其独特的演化历程。
2025-12-24 21:01:20
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转载 2025 年12月马上开课 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战
为满足广大读者进一步学习的需求，易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划，筹备和专家研讨，现组织和开展临床基因组学专题培训课程，以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术，手把手带您快速入门，节约宝贵的时间，助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具，绘制常用生信相关图形，包括：热图 (变异水平)，maftools图 (基因水平)，基因的结构、变异位置及结构域标记 (棒棒糖图)，基因组Circos图，IGV基因组浏览器，PPI网络图，基因功能的富集结果图。
2025-12-23 21:02:35
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转载 第一名来自中国 | Science公布2025年10大年度突破
这些努力刷新了此前基因改造猪肾的记录，此前的记录是由一个经过10项基因改造的器官创造的，该器官曾帮助一名女性维持了4个月的生命，今年2月衰竭。今年六月，一项长期实验报告称，与之前的预测相反，一种名为μ子的粒子的磁性并不比标准模型预测的更强，这或许是新谜团最令人期待的迹象。今年，研究人员终于揭开了我们一位失散多年的亲戚的面容——通过 DNA 证据证实，一个被称为“龙人”的 146,000 年前的头骨属于丹尼索瓦人，丹尼索瓦人是已灭绝的人类谱系，他们和尼安德特人一样，曾经与现代人类共同生活在地球上。
2025-12-23 21:02:35
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转载 iMeta | 长春科技学院李春义组-多成骨机制协同支撑鹿茸超快速生长
点击蓝字 关注我们干/祖细胞池、血管系统以及混合型成骨共同驱动鹿茸骨质每日厘米级生长iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 英文题目: A vaststem-progenitor cell pool, richly vascular system and hybrid ossification drive the daily centimeter-scale elongation of bony antlers
2025-12-22 21:01:41
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转载 [精读]Plant J. ||西北农林麻鹏达教授团队联合杨子松教授：阐述丹参中丹参酮和酚酸的生物合成及调控机制
2025年7月28日，西北农林科技大学生命科学学院麻鹏达教授团队联合阿坝师范学院杨子松教授团队在国际经典权威学术期刊The Plant Journal上在线发表了题为“Biosynthesis and regulatory mechanism of tanshinones and phenolic acids in Salvia miltiorrhiza”的综述文章，系统总结了丹参（Salvia miltiorrhiza）中丹参酮和酚酸活性成分的合成途径及其调控机制的最新研究进展。丹参作为重要传统中药，其活
2025-12-21 21:01:12
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转载 近20年来各大985高校两院院士当选人数排名一览！来看看你的高校排第几？
同时，从近4届院士增选，也就是从2019年至今的这4届当中，清华大学和北京大学也是仅有的2所院士新增人数突破20大关的，这个数字甚至比很多高校在这20年的时间里新增的院士还要多，可见清北在院士新增当中绝对是全国最顶尖的水平！也就是说每一届院士评选，清华大学平均下来都有5位院士能够当选，这样稳定且持续的院士输出，确实是很大其他985高校所不能比拟的能力，所以就目前来说，清华大学在院士新增的长河当中，绝对算的上是最高的山，最长的河了！最全1000+植物核基因组数据库IMP。高颜值免费 SCI 在线绘图。
2025-12-20 21:01:53
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原创 千万次使用的高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程
想了一下，确实没表达清楚意思，没把自己的完整意思都说出来，直说要发，没说发了之后做什么。生物信息分析部分包括常见的分析工具如 WGCNA共表达网络分析、LEfSe 特征物种鉴定、Limma 差异基因/物种分析、多序列比对、FASTA 处理、RNA 翻译、正则匹配和空间关系等工具，更多工具也在不断完善中。目前支持 16 种基本图形，包括热图、箱线图、富集分析泡泡图、柱状图、火山图、PcOA 分析、Venn 图、直方图、线图等。常见数据格式转换，如宽矩阵转长矩阵、长矩阵转宽矩阵、合并矩阵、矩阵膨胀等功能。
2025-12-20 21:01:53
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转载 iMetaMed | Gokhan Zengin/张谦/李梦尧揭示山梨酸钾通过干扰细胞间通讯诱导急性肾损伤的分子机制
点击蓝字 关注我们山梨酸钾通过调控细胞间通讯诱发肾损伤：一项整合网络毒理学、机器学习、分子对接与单细胞RNA测序的研究iMetaMed主页：https://onlinelibrary.wiley.com/journal/3066988x研究论文● 原文：iMetaMed● 英文题目：Potassium Sorbate Triggers Kidney Injury via Dysregulated Intercellular Communication: A Study Combining Network T
2025-12-19 21:01:54
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转载 PBJ |兰科植物多组学数据库OrchidMD正式上线，解锁我国传统兰花基因挖掘与分子育种新路径
该数据库整合213个兰科物种的 329.40 Gb多组学数据，开发18种专业化分析工具，通过“数据整合 – 工具创新–工功能验证”的研究思路，不仅实现了兰科植物多维度数据的高效检索与交互式分析，更通过 ARF 基因家族鉴定、CRISPR 基因编辑靶点设计两个典型案例，证实其在兰科基因挖掘与基因编辑的实用价值，为兰科植物基础研究、分子育种与资源保护提供了全新的一站式研究平台。该案例证实，OrchidMD可高效完成基因家族筛选、表达模式分析，为功能基因验证提供精准靶点，显著缩短研究周期。
2025-12-18 21:01:46
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转载 iMetaOmics | 北京理工大学罗爱芹组-微生物-肠-脑轴器官芯片构建及应用
点击蓝字 关注我们微生物-肠-脑轴微流控器官芯片构建及其在药物评价中的应用iMetaOmics主页：https://onlinelibrary.wiley.com/journal/29969514综述论文● 原文: iMetaOmics● 英文题目：Microbiota-Gut-Brain Axis Multi-Organ Chip Construction and Applications in Drug Evaluation● 中文题目：微生物-肠-脑轴微流控器官芯片构建及其在药物评价中的应用● 原文链
2025-12-18 21:01:46
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转载 iMeta | 中国药科大学顾丰组-解析黄葵治疗糖尿病肾病机制
点击蓝字 关注我们单细胞和空间转录组学揭示了黄葵治疗糖尿病肾病的潜在分子机制iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 英文题目: Single-cell and spatial transcriptomics reveals potential molecular mechanisms of Abelmoschus manihot (L.) Medic in treating diabetic kidney d
2025-12-17 21:01:44
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转载 iMetaMed | 中山大学唐海林组-五达颗粒通过肠-脑轴改善比格犬胃肠运动
点击蓝字 关注我们五达颗粒通过肠-脑轴改善比格犬胃肠运动iMetaMed主页：https://onlinelibrary.wiley.com/journal/3066988x研究论文● 期刊：iMetaMed● 英文题目：Wuda granule improves the gastrointestinal motility via gut-brain axis in beagle dogs● 中文题目：五达颗粒通过肠-脑轴改善比格犬胃肠运动● 原文链接：https://onlinelibrary.wiley
2025-12-16 21:02:30
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转载 NAR | 非CG甲基化可促进TF结合！福农朱方捷/上交九院黄晶解析WRKY顺式元件组
（1）对于不同WRKY结合模式，其亲和力对甲基化的响应不同（图2A）：尽管WRKY识别的非甲基化、甲基化基序中均含有C（或G），但对于非甲基化时WRKY识别的基序，相关序列甲基化时亲和力减弱；然而，甲基化条件下，WRKY识别的顺式元件仍靶向WRKY的经典功能（SA通路、免疫反应等），因此推测植物基因组中的甲基化顺式元件也参与构建了WRKY下游的转录调控网络，对WRKY行使正常生理功能具有重要意义。11类单体基序中，类别1-5为非甲基化时WRKY的识别基序，类别6-11为甲基化时WRKY的识别基序，表明。
2025-12-15 21:01:50
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转载 iMetaOmics | 阿姆斯特丹大学李时佳-用于微生物组时间序列数据分析的R包
2022年2月正式创刊！在体外水生微生物组数据集中，MicrobTiSDA揭示了八个独立重复实验的水生微生物组的时间动态丰度变化（图S2-S10），推断了物种间的相互作用，并识别出可能调控群落动态的关键物种（图S11）。最后，利用随机森林分类模块，我们识别出了能够有效区分因感染致病性大肠杆菌引发败血症的早产儿与匹配的对照早产儿的微生物标志物，并比较了两组被试生物标志物的时间动态丰度模式（图S15和图S16）。然而，在数据处理与分析，尤其是物种间相互作用的推断和微生物特征丰度时间模式的表征方面仍具有挑战性。
2025-12-14 21:01:03
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转载 单菌基因组数据分析文献和教程集锦
细菌分型(3) | 可移动元件分型，质粒分型，噬菌体分型，转座子，抗生素耐药性分型，血清型预测，WGS分析平台，展望与总结。细菌基因组组装、注释与应用-snpEff利用FASTA和(eggnog-mapper的)GFF文件从头建库(2)Cell 10-2 | 史前牲畜与人传染病的细菌基因组研究；蛋白-蛋白互作新模型。细菌基因组测序、组装、进化 | 最新文献目录期刊 2025/8/1~11/28 (中) 200篇。细菌基因组测序、组装、进化 | 最新文献目录 2025/8/1~11/28 (上) 200篇。
2025-12-14 21:01:03
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转载 2025年中国生命科学十大进展公布！
通过施用4-硝基苯酚可以明显降低合成酶的活性，阻断4VA的合成，实现了对蝗虫聚集行为的精准调控。马骏、孙颖作为主席，牵头中国-美国-欧洲的专业协会，制定了《国际鼻咽癌放疗靶区勾画指南及图谱》，全球推广应用，实现了中国鼻咽癌临床研究从“跟跑”到“领跑”的跨越，推动鼻咽癌治疗由“保生存”迈向“优生存”新时代。邀请入选项目专家编写和出版科普书籍，举办交流会暨面向青少年的科普报告会，向公众揭示生命科学的新奥秘，为生命科学新技术的开发、医学新突破和生物经济的发展提供新的思路，提高生命科学的社会影响力。
2025-12-13 21:01:17
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转载 iMeta被OARL正式收录
期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！4. 该页面包括iMeta期刊创刊年、出版社、学科、关键词、目标与定位、录用率（8%）、影响因子（33.2）等信息。” 子刊，专注于医学、健康和生物技术领域，目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊，欢迎投稿！
2025-12-12 21:01:51
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转载 【Science】曹晓风/张宪省/赵忠等点评！杨卫兵研究团队破解植物干细胞命运的“细胞壁密码”
这项研究不仅深化了我们对植物干细胞微环境稳态机制的认识，更重要的是，它揭示了一种跨越转录与翻译层级的、高度整合的时空调控模式，为理解生命体如何通过精准的分子程序实现复杂的形态建成，提供了极具启发性的研究范例。该工作突破了传统生化信号转导范式，将细胞壁动态、果胶化学修饰与 mRNA区室化有机整合，系统阐释了细胞壁结构调控干细胞命运决定的新机制，为理解植物细胞全能性与命运可塑性提供了新的理论依据。近年来的研究逐渐发现，细胞壁的成分，特别是果胶的修饰很可能参与了植物的发育调控。然而近年来的研究表明，
2025-12-12 21:01:51
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转载 iMeta 热点及高被引论文合集(25.11更新)
目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述，重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！” 子刊，专注于医学、健康和生物技术领域，目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊，欢迎投稿！iMeta文章4篇入选热点论文(Top 0.1%)，35篇入选高被引论文(Top 1%)
2025-12-11 21:00:53
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转载 跟着iMeta学作图 | 箱线图展示α多样性差异
对应的前面具有显著分组的是 "SLL"-"MLL"),"MLL"-"SVLL", "HL"-"MLL","SLL"-"SVLL","HL"-"SVLL"，对应在前面定义的my_comparisons 中的位置是第2、3、4、5、6个位置的分组，因此下面选择这三个分组进行显著性标注。对应的前面具有显著分组的是"MLL"-"SVLL", "SLL"-"SVLL","HL"-"SVLL"，对应在前面定义的my_comparisons 中的位置是第3、5、6个位置的分组，因此下面选择这三个分组进行显著性标注。
2025-12-11 21:00:53
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转载 交大医学院 | VHL综合征家系致病基因研究克服WES/芯片检测小片段CNV的技术缺陷
作者: Yang Y, Ren X, Xia C, Zhang Y, Song X, Tang X, Du C, Xu W, Weng W. 上海交通大学。研究结果为该家系提供了明确的遗传学诊断依据，也为VHL综合征的机制研究提供了新的数据支持。探针设计、杂交连接、PCR扩增、NGS测序，结合了MLPA的特异性和NGS的高通量优势。图5：探针位置与拷贝数示意图展示3批探针在VHL基因上的分布及对应的拷贝数变化，直观呈现缺失区域。)，是检测CNV的“金标准”，但通量低、依赖毛细管电泳，操作复杂。
2025-12-10 21:02:19
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转载 华盛顿、斯坦福团队 | IGVF-Catalog知识图谱如何重塑基因组变异解读
王艇教授是美国圣路易斯华盛顿大学遗传系Sanford and Karen Loewentheil Distinguished Professor of Medicine，系主任，同时也是计算机科学与工程的教授，兼任McDonnell Genome Institute的科研主任。数据覆盖的完整性、部分交互功能的性能、数据来源的标签清晰度以及用户文档，都是其正在持续优化的方向。将分散的、描述性的生物学知识，转化为可查询、可推理、可验证的因果网络模型。基因测序技术的飞速发展，为我们积累了海量的基因组变异数据。
2025-12-10 21:02:19
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转载 iMeta | 国防科大朱律韵组-解析新型选择性剪接调控因子介导细胞内源性免疫调控机制
点击蓝字 关注我们全基因组CRISPR筛选揭示新型选择性剪接调控因子作为新型免疫治疗候选新靶点iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 英文题目: Genome-wide CRISPR screen reveals an uncharacterized spliceosome regulator as new candidate immunotherapy target● 中文题目: 全基因组CRISPR筛选揭
2025-12-09 21:01:00
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转载 文献分享 | NC | 古老基因簇如何操控植物天然产物的手性翻转
研究发现了一个极其古老的基因簇，可以追溯到龙胆目的共同祖先（约1.35亿年前），甚至与葡萄中的基因组区块共线性。其活性口袋的特定残基（如 V176）控制了氧化脱氢活性，而不同物种间的关键氨基酸突变（如 C173A）影响了 FAD 辅因子的结合方式和底物范围。（氧化酶/还原酶对），还通过比较基因组学揭示了这些酶背后的古老基因簇进化历史，解析了植物如何通过基因簇复制和功能分化来扩展其化学多样性。展示了植物如何通过“复制-修饰”古老的基因组模块（BGCs），来快速获得新的化学防御武器（如利血平）。
2025-12-09 21:01:00
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转载 Nature Synthesis | 华东理工蔡孟浩联合北京大学乔雪、叶敏及上海交大瞿旭东实现植物牡荆素类黄酮苷高效从头合成
总体而言，该研究突破了植物牡荆素类衍生黄酮苷的微生物合成能力限制，将黄酮苷从头合成水平从传统的每升毫克水平提升至每升二十克以上，为其他类型后修饰黄酮分子及其他复杂结构植物天然产物的高效生物制造提供了参考解决方案。微生物异源合成虽具潜力，但受限于糖基供体不足、毒性中间体累积、植物酶在微生物宿主中活性低、糖苷水解酶引发产物降解、代谢流分配失衡等诸多问题，其从头生物合成能力长期停滞在每升毫克级水平。初步成本核算表明，该研究开发的酵母发酵制备黄酮苷体系，相比目标分子高含量优势植物的提取路线，展现了良好的成本优势。
2025-12-08 21:02:53
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转载 中医药研究首次进入中国科学院与科睿唯安发布的《研究前沿》
网络药理学在中医药现代化研究中扮演了革命性的角色，因为它完美地契合了中医药整体性、系统性的核心哲学思想，为理解中药复方“多成分、多靶点、整体调节”的作用特点提供了强大的理论工具和研究范式。《2025研究前沿》报告采用文献计量学中的共被引分析方法，基于2019～2024年论文数据，遴选出2025年自然科学和社会科学的11个大学科领域的前十名热点前沿和18个新兴前沿，分析上述研究前沿的发展趋势，并对31个重点前沿（包括热点前沿和新兴前沿）进行详细解读。高颜值免费 SCI 在线绘图。
2025-12-07 21:01:13
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