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原创 生信宝典:生物信息学习系列教程、视频、资源

欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需...

2018-01-31 10:02:40 12059 3

原创 FusionESP:用投影对齐改进酶-底物配对预测

本文提出 FusionESP,这是一种多模态架构,整合蛋白语言模型和化学语言模型,并通过两个独立投影头和一种对比学习策略来预测酶-底物配对。本文测试了 ESM-2-35M、ESM-2-650M、ESM-2-3B 三种模型,输出维度分别为 480、1280、2560。因此,作者没有继续堆叠更复杂的融合编码器,而是保留 ESM-2 和 MoLFormer 的预训练知识,用两个独立投影头学习酶和分子在同一空间中的匹配关系。模型方面,可以把反应类型、EC 编号、活性位点、蛋白结构、底物构象或反应中心加入投影空间。

2026-05-28 21:00:00 350

转载 Cell Reports Methods | 从序列解析细胞身份:ATACompass实现scATAC-seq跨物种细胞类型注释

但对于基因注释不完善、调控信息积累不足的非模式物种,这些方法的适用性和泛化能力明显受限,也难以实现稳健的跨物种零样本细胞类型注释。通过在卵巢和睾丸数据集中引入人、猴、小鼠、猪、山羊等代表性物种数据后发现,相比仅使用人类数据训练,逐步加入更多物种能够进一步提高跨物种预测准确率,并减少部分细胞类型中的错误信号干扰。该方法不依赖物种基因注释或高质量scRNA-seq参考数据,而是直接从scATAC-seq开放染色质峰对应的DNA序列中学习细胞类型相关的调控信息,实现了跨物种场景下稳健的细胞类型注释。

2026-05-27 21:00:00 91

转载 hLife | DrosGB:35种果蝇多组学数据助力直系同源推断与比较基因组研究

在网站功能上,DrosGB 设计了五大模块,集成基因检索、同源 ID 映射、BLAST 比对、基因树构建、序列获取、共线性分析、三维结构浏览等多种在线分析工具,同时支持原始数据下载,让研究者可以从“查数据”到“做分析”一步到位。综上所述,DrosGB 系统整合了35种果蝇的基因组、转录组、功能注释以及蛋白三维结构数据,并通过多种同源预测方法交叉验证,构建了高可信的直系同源基因集,弥补了现有数据库在跨物种整合方面的不足,为果蝇属的比较基因组和功能研究打下了更加扎实的数据基础。2024年5月被DOAJ收录;

2026-05-27 21:00:00 85

转载 Nature Method 蛋白质表征的不确定性如何量化?

RNS 的思想清晰,实现成本较低,并通过结构预测、接触图预测、二级结构预测、跨模型比较和人类变异效应预测建立了较完整的证据链。它的核心贡献是提出 embedding 级别的不确定性量化方法,使 protein embedding 从可直接使用的向量表示,转变为可被筛选、可被诊断、可被追踪质量的模型输出。尤其是低同源蛋白、无序蛋白、未知宏基因组蛋白、人工设计蛋白和长尾蛋白家族,模型可能给出看似合理的 embedding,但研究者无法判断这些 embedding 是否落入模型未充分学习的区域。

2026-05-26 21:00:00 47

转载 iMeta短视频 | 南农沈其荣院士团队-基于微生物社会性行为构建植物促生型合成菌群

期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!荀卫兵、Polonca Stefanic、杨天杰、缪有志、张楠、姚燕来、张瑞福。

2026-05-26 21:00:00 59

转载 npj Digit Med | 龙尔平/庞军玲团队:把健康档案写成“句子”,解码疾病分型、重构共病网络、预测患病风险

尤为重要的是,该模型挖掘出上千组此前未被报道的候选共病关系,例如低血小板障碍与痛风、Graves病与心肌炎,这些关联在生物学上具有合理性,值得进一步研究。同一个模型表征可以同时用于疾病内部分型、共病网络构建和后续患病风险预测,其代表的“健康语言化”思路,为利用日常医疗数据开展精准医学研究打开了一扇新的大门。这样一来,个体的全部健康档案就被组织成一段“描述健康的文章”,大模型读懂这些“文章”后,就可以用于疾病分型、共病分析和风险预测等多种任务。共病研究的新意义:从“两两关联”走向“疾病社区”

2026-05-25 21:00:00 50

转载 iMeta短视频 | 国际宏蛋白质组学倡议- 全球专家手把手教你用好宏蛋白质组学

2022年2月正式创刊!本综述由宏蛋白质组学倡议(Metaproteomics Initiative, www.metaproteomics.org)撰写,介绍了宏蛋白质组学所必需的关键原理、系统阐述宏蛋白质组学的核心原理、前沿技术及关键分析流程,涵盖实验设计、样本制备、质谱技术、数据分析策略与统计方法等全链条研究要素,旨在为微生物组学和蛋白质组学研究人员提供实践指南。相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!

2026-05-25 21:00:00 50

转载 iMeta | 北大人民医院徐涛组-类器官多组学解析尿路上皮癌免疫抵抗机制

点击蓝字 关注我们患者来源类器官-免疫共培养体系结合多组学分析技术解析尿路上皮癌免疫治疗耐药机制iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 英文题目: Patient-derived organoid-immune co-cultures integrated with multi-omics reveal immunotherapy resistance mechanisms in urothelial carc

2026-05-24 21:00:00 64

转载 【热点论文】浙中医大学曹岗、韩欣团队发表紫杉叶素通过肝细胞-星状细胞相互作用调节NDRG1在Thr328位点的磷酸化减轻肝纤维化研究论文

(C–F) Western/qPCR:NDRG1-KO 后 Cleaved-Caspase-3/9、HMGB1、NLRP3、IL-1β 表达下降,Taxifolin 失去调控能力。本研究旨在探讨紫杉叶素(TAX)对肝纤维化的治疗作用及其分子机制,重点关注其是否通过调控 NDRG1 蛋白的磷酸化状态(特别是 T328 位点)来发挥抗纤维化效应,并且围绕紫杉叶素(Taxifolin)、肝纤维化、NDRG1、T328 磷酸化、肝星状细胞、RNA-Seq、分子对接、CCl₄ 小鼠模型等关键词展开研究。

2026-05-23 21:00:00 55

转载 Adv Sci | 李敏团队:AI 赋能蛋白质功能注释

作者从三方面指出未来面临的机遇与发展趋势,包括“统一高效的生物数据表征建模”、“复杂生物环境建模”以及“领域专家大模型智能体。面对日益复杂的算法模型,作者通过对数据模态和模型架构的深度剖析,将现有方法划分为“六大建模范式”的系统性框架,为理解 AI 在该领域的作用机理提供了统一视角:序列驱动范式。然而,随着测序技术的爆发,受限于高昂的实验成本,只有不到 0.1% 的已知序列得到了功能验证。在此基础上,文章针对GO和EC这两个互补的功能注释体系进行了全方位的介绍与比较:从代表性算法的演进到针对不同应用场景。

2026-05-23 21:00:00 36

转载 国家生物信息中心高远团队研发RNA转录本水平剪接调控预测模型HELIX

以长读长转录组为代表的测序技术发展促进了同一基因中不同RNA转录本间相对比例的准确定量,以及关键组织及细胞类型中特异表达转录本全长的识别,是研究人类转录组复杂性的重要手段。人工智能技术是解决这一难题的潜在最佳途径,但目前已有模型仅能实现对个别样品中剪接位点强度的预测,难以用于转录本水平的预测,且缺乏对于未见组织及细胞类型的扩展能力。该研究不仅加深了人们对组织特异性和疾病相关剪接机制的认识,也为癌症分型、致病变异解释以及精准医学研究提供了重要的方法学支撑。剪接与转录本使用模式的高精度预测。

2026-05-22 21:00:00 38

转载 iMeta | 2026年4月数据分析报告:单月下载量超5万次

2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!美国和印度下载量分别为27.70万次和5.58万次,位居第二和第三;相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2026-05-22 21:00:00 70

转载 Nature Communications | 小鼠环境表观基因组数据中心

王艇教授长期领导大型国际项目例如ENCODE,Roadmap,4DN,TaRGET以及当前最新的人类泛基因组计划(Human Pangenome Project),Multi-Omics for Health and Disease (MOHD*) 和IGVF(Impact of Genetics Variation on Function)。实验室一直求贤若渴,如有精通前端后端开发,数据库,AI算法等的人才想加入实验室,请和李道丰教授(dli23@wustl.edu)联系。高颜值免费 SCI 在线绘图。

2026-05-21 21:00:00 33

转载 iMeta 5卷2期封底:哪吒破鼎焕活肌能

目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2026-05-20 21:00:00 37

转载 李力/张明亮/周雍进等合作Nat Com | 山梨酸的高效异源生物合成

—酿酒酵母为底盘细胞,开展了系统的代谢工程改造与发酵工艺优化。通过全基因组测序与功能验证,团队成功解析了山梨酸的微生物生物合成途径,鉴定出由高还原型聚酮合酶(SoaA)、水解酶(SoaB)及酰胺转移酶(SoaC)构成的关键基因簇,并构建了仅依赖 SoaA 与 SoaB 的精简高效合成路径,从分子层面阐明了其生物合成机制。该研究首次从微生物中完整解析了山梨酸的生物合成途径,并以酿酒酵母为底盘细胞构建了高效细胞工厂,实现了山梨酸的高水平生物合成,为食品防腐剂的绿色制造开辟了新路径。点击图片直达文字对应教程。

2026-05-20 21:00:00 46

转载 iMeta | 山东大学冯世庆/周恒星组-脊髓损伤引发急性微生物组休克及多器官转录组重编程

点击蓝字 关注我们脊髓损伤引发急性微生物组休克及多器官转录组重编程iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊:iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 英文题目: Spinal cord injury induces acute microbiome shock and system-wide transcriptomic reprogramming● 中文题目:脊髓损伤引发急性微生物组休克及多器官转录组重编程● 原文链接:https://onlinelib

2026-05-19 21:00:00 54

转载 NCBI新的Taxonomy(物种分类学)官网,将于2026年秋季正式发布 (附:物种的参考基因组检索、下载)

公众号投稿联系:陈同 (chentong_biology@163.com)NCBI Taxonomy (分类学) 是一个精心策划的。最全1000+植物核基因组数据库IMP。NCBI 网站打不开或打开得慢,可多次。增强搜索和链接到其它 NCBI 数据。NCBI 数据集 (物种)分类浏览页。组织了公共序列数据库中的数据。高颜值免费 SCI 在线绘图。标准化的生物体(物种)名称。NCBI (物种)分类库。点击图片直达文字对应教程。(物种)分类系统,其。

2026-05-19 21:00:00 72

转载 J Ethnopharmacol|海军军医大学航海中药学团队为“仙草”铁皮石斛延缓衰老提供本草新证

如果用一句话概括这篇论文,它并不是说“铁皮石斛可以让人长寿”,而是更谨慎地指出:在酵母和果蝇模型中,铁皮石斛相关成分和组分显示出延长寿命、改善健康寿命和缓解高糖代谢压力的潜力;在果蝇模型中,DOP显著延长雌性寿命、提升爬行能力,并缓解高糖饮食引起的寿命缩短和高血糖,同时降低饮食应激下AKT磷酸化并增强FOXO相关反应。作者提出铁皮石斛的现代研究价值,不只在于寻找某个“神奇成分”,更在于理解它如何参与机体稳态的调节:在营养过载时减轻失衡,在细胞压力下增强维护,在不同组分之间展现互补而复杂的作用图景。

2026-05-17 21:01:14 81

转载 【第二轮会议通知】第三届菌物药物与合成生物学会议

稿件应包括题目(三号黑体居中),作者(四号宋体居中),作者单位(小五号宋体居中,含单位、城市名和邮政编码并用空格分开)、正文(小四号宋体)、参考文献(小五号宋体)单倍行距。会议邮件命名:参会方式(口头报告/学生专场报告)-姓名-单位。诚挚欢迎全国各地从事菌物化学、药用真菌学、合成生物学、生物技术相关领域的学者和企业代表参加此次盛会,促进学术交流与合作,共同推动菌物化学与药用真菌研究的创新发展,助力人类健康与可持续发展。会议设口头报告及学生专场报告。万一、李峻志、陆博、祁建钊、王娜、王琰、王璐、祁鹏、耿政。

2026-05-17 21:01:14 99

转载 微生物组-宏基因组分析专题研讨会 (2026.时间待定,线下+线上)

福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、单物种转录组、单菌基因组的线上/线下同时开课。,在大家的Windows笔记本上可以轻松实现扩增子、宏基因组领域统计、可视化的绝大多数分析,第三节课带你轻松在自己的本本上搭建数据表统计分析与可视化平台,基于目前最主流的Win10进行优化和测试,但这些只是入门,在培训时,我们将结合发表的高水平文章,进一步讲解16种常用分析图的原理和使用范围,让你不仅读懂图,更知道如何应用于自己的研究,并亲自轻松完成绘图。

2026-05-16 21:01:32 42

转载 iMeta短视频 | 德国Engler组-tidyplots: 简化代码的数据可视化工具

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!

2026-05-15 21:02:16 60

转载 2026 年5月 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战

为满足广大读者进一步学习的需求,易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划,筹备和专家研讨,现组织和开展临床基因组学专题培训课程,以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术,手把手带您快速入门,节约宝贵的时间,助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具,绘制常用生信相关图形,包括:热图 (变异水平),maftools图 (基因水平),基因的结构、变异位置及结构域标记 (棒棒糖图),基因组Circos图,IGV基因组浏览器,PPI网络图,基因功能的富集结果图。

2026-05-15 21:02:16 56

转载 iMetaOmics | 暨大马文军/刘涛组-解析肠道菌群在大气污染物和气象因素与代谢综合征关联中的中介作用

P点击蓝字 关注我们肠道菌群在大气污染物和气象因素与代谢综合征关联中的中介作用iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊:iMetaOmics● 英文题目:The mediating roles of gut microbiota in the associations of air pollution and meteorological factors with metabolic syndrome● 中文题目:肠道菌群在大气污染物

2026-05-15 21:02:16 30

转载 Nat Commun:张宇/张卫东/洪鑫/方学贤团队-拟天然产物库的构建并从中发现新型铁死亡抑制剂

插入反应中传统分子内途径需高温等苛刻条件、易生成吲哚啉与吲哚混合物,不利于复杂骨架精准构建及功能分子发现等问题,研究团队发展了光催化驱动的可切换合成平台。基于构建包含新型吲哚与二氢吲哚衍生物的类天然产物库,经全面药理学研究,四环吲哚生物碱。插入结合的可切换合成体系,通过简单调控反应条件,能高选择性地分别制备吲哚和二氢吲哚,并从中发现了具有强效铁死亡抑制活性的新型化合物。插入可直接合成二氢吲哚,但传统方法因条件苛刻,往往生成难以控制的二氢吲哚与吲哚混合物。最全1000+植物核基因组数据库IMP。

2026-05-13 21:02:47 40

转载 iMeta期刊投稿以及转子刊操作教程

2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!稿件提交成功后,系统页面会显示对应投稿状态(Submitted)。

2026-05-11 21:01:01 57

转载 Gut | 唐林泉/刘永鑫等揭示鼻咽癌特异性肠道菌群特征实现高效诊断与预后预测

除局部微生物外,日益增多的证据表明,肠道微生物组在调节人体免疫系统中发挥关键作用,既可调节宿主对病毒感染的易感性,也可激发宿主免疫应答以实现抗病毒防御。● 聚焦微生物组方法开发、功能挖掘和科学传播,以第一或通讯(含共同)在Nature Biotechnology/Microbiology、Gut、Advanced Science等发文50+篇,合作在Science、Cell、Cell Host & Microbe等发文40+篇,累计被引34000+次,入选全球前2%科学家榜单、全球高被引科学家。

2026-05-10 21:02:27 54

转载 iMeta | 清华长庚董家鸿组-解析肝细胞癌免疫微环境中的毛细血管-mCAF互作

点击蓝字 关注我们空间多组学揭示NOTCH3介导的毛细血管-间质成纤维细胞互作驱动肝细胞癌免疫逃逸iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 英文题目: Spatial Multi-Omics Identifies a NOTCH3-Mediated Capillary–mCAF Crosstalk Driving Immune Exclusion in Hepatocellular Carcinoma● 中文题目

2026-05-08 21:01:15 41

转载 Nature Methods:清华李梢团队基于宏微观跨层次关联规律,建立中西医影像-分子网络关系推断的统一AI模型

该模型基于自监督学习框架,从跨层次数据中自主挖掘病理影像与分子特征间的复杂关联,首次实现了多尺度病理形态与多层次分子图谱的跨模态统一嵌入,同时兼顾了模型的可解释性与泛化性,解决了传统多模态模型“性能与可解释性不可兼得”、“泛化能力弱难以适配临床大队列”的两难问题。尤为突出的是,模型凭借嵌入的宏微观跨层次网络模块化先验,即便仅用少量空间转录组样本训练,也能生成适用于大规模临床数据的多模态共嵌入空间与整合模型,这为克服中医药领域常见的。这一规律的发现,为中西医复杂体系可解析、可计算奠定了进一步的理论基础。

2026-05-08 21:01:15 61

转载 iMeta | 丁侃/邵成浩/李川/李美霞等解析瘤内霍氏肠杆菌介导胰腺癌吉西他滨耐药新机制

结果表明,头孢吡肟本身不具有直接抗肿瘤活性(表S12,图S13A–C),但与吉西他滨联用后可显著降低瘤内细菌负荷,并在体内恢复吉西他滨的抗肿瘤效果(图2J–L,图S14A–C)。值得注意的是,头孢吡肟联合低剂量吉西他滨(75 mg/kg)取得的抗肿瘤效果与高剂量吉西他滨(150 mg/kg)相当(图2J–L),提示通过靶向瘤内细菌有望实现化疗剂量优化并减轻毒副作用。在异种移植瘤小鼠模型中,瘤内定植A64的肿瘤对吉西他滨治疗反应明显下降,其肿瘤负荷显著高于无菌对照组(图S6,图1K–N)。

2026-05-07 21:02:31 38

转载 Cell | 叶凯团队揭示生命复杂性跃升的基因组高阶“构架”法则——动植物演化路线的根本分异

动物在演化中弱化了“全局折叠”的刚性约束,从而为“棋盘格局”这一实现精细调控的“软件架构”腾出发展空间,以支撑高度分化的细胞类型和复杂行为。本研究不仅揭示了驱动生命复杂性演化的三维基因组法则,更展示了一种前沿的交叉学科研究范式:将生命体视为一个动态的、自组织的复杂系统,并运用系统建模、信号处理和人工智能等方法,对其核心“架构”进行逆向解析。发育同样经历了一个从强“全局折叠”向强“棋盘格局” 的架构转换,且这一转换恰与细胞从全能性向多能性、再向特异功能分化的关键时期同步。物种数据中,提取出普适的演化规律?

2026-05-07 21:02:31 48

转载 2025年实时影响因子: 全球期刊(26.5.2更新)

2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!对科研人而言,实时影响因子的价值不止于排名参考,无论是投稿时筛选匹配期刊、追踪领域内高影响力成果,还是把握学科发展热点,都能从中获取关键指引。相继被PubMed、ESCI、DOAJ、Crossref和EZB等数据库收录,目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊,欢迎投稿!期刊开展系统性分析。

2026-05-06 21:02:16 119

转载 会议通知(第一轮) | 中国药理学会2026年药理学与交叉学科学术会议

为促进学术交流,对接国内外顶尖专家与决策者,在这一领域竞争中占据先机,2026年6月12日-15日,中国药理学会北美分会携手中国药理学会内分泌与代谢药理专业委员会(筹),将在江西·南昌·绿地铂瑞酒店隆重举办:“中国药理学会 2026 年药理学与交叉学科学术会议”。预计吸引 300-500 名参会者,汇聚诺贝尔奖得主,两院院士,北美及海外华人药理学家,国内外内分泌代谢、神经药理、肿瘤药理等多领域顶级专家、中青年骨干医生及科研人员、研究生等。中国药理学会北美分会、中国药理学会内分泌与代谢药理专委会(筹)

2026-05-06 21:02:16 77

转载 iMeta | 魏云巍/赵立平-两种稳定的肠道微生物群体预测肝肿瘤类别和治疗反应

点击蓝字 关注我们两种稳定的肠道微生物群体预测肝肿瘤类别和治疗反应iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 英文题目: Two stable gut microbiome guilds predict liver tumor class and treatment responses● 中文题目: 两种稳定的肠道微生物群体预测肝肿瘤类别和治疗反应● 原文链接:https://onlinelibrary.wiley

2026-05-05 21:00:54 68

转载 iMeta | 湖南农科院柏连阳院士团队评述纳米农药未来发展

点击蓝字 关注我们纳米农药的未来展望:设计、功效、机制与环境管理视角iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 英文题目: Navigating the future of nano-pesticides: A perspective on design, efficacy, mechanisms, and environmental stewardship● 中文题目: 纳米农药的未来展望:设计、功效、机制与环境

2026-05-04 21:01:47 84

转载 iMeta短视频 | 易扩增子(EasyAmplicon):易用、可重复的微生物组扩增子分析流程

主要单位:中国农业科学院深圳农业基因组研究所、首都医科大学附属复兴医院、兰州大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源中心、华北电力大学、中国科学院微生物研究所、浙江大学附属金华医院、西北农业科技大学资源与环境学院、浙江大学口腔医院、香港大学、泰国皇太后大学、日本东京大学、德国马普植物育种研究所、爱尔兰科克大学、荷兰格罗宁根大学、新加。李小方、郑茂盛、周欣、陈亮、钱旭波、席娇、卢洪叶、曹慧荦、马晓亚、边遍、张鹏帆、吴季秋、甘人友、贾保磊、孙林阳、鞠志成、高云云。iMetaOmics封面。

2026-05-03 21:01:49 62

转载 Nat Commun|吴华君/徐明团队开发跨尺度三维基因组预测深度学习框架Hi-Compass

中实现了空间分辨的染色质互作预测,刻画了组织空间位置与细胞类型特异性三维基因组结构的对应关系。数据集,解析了不同免疫细胞亚群与发育阶段细胞类型特异性的染色质互作图谱。的提出将有力推动三维基因组学在发育、免疫、神经及疾病研究中的广泛应用,并为非编码遗传变异的功能解读提供。图谱的产出对样本量、测序深度和实验成本均有较高要求,尤其在单细胞与空间尺度上,、单细胞和空间组学中差异极大的测序深度,作者在训练阶段引入多种测序深度的。)未充分考虑单细胞与空间数据中固有的稀疏性和测序深度的高度异质性。

2026-05-03 21:01:49 51

转载 重磅发布!2026 全球前十万科学家学术竞争力榜单

不断总结经验、优化技术、微调规则,提升数据精度、夯实数据基础、提高评价系统的可靠性,并通过为一些典型用户提供精准数据服务得到的反馈来增强数据清洗能力,优化评价体系。不断总结经验、优化技术、微调规则,提升数据精度、夯实数据基础、提高评价系统的可靠性,并通过为一些典型用户提供精准数据服务得到的反馈来增强数据清洗能力,优化评价体系。年,同舟云学术发布了全球前十万科学家学术竞争力排行榜,得到了广大学者的广泛关注,反响极大。年,同舟云学术发布了全球前十万科学家学术竞争力排行榜,得到了广大学者的广泛关注,反响极大。

2026-05-02 21:02:17 49

转载 “生物狂人”文特尔去世,他不是英雄,也不是诺奖得主,但书写了更多的传奇

他不是传统意义上的英雄楷模,也不是诺奖得主,但他在基因专利、人类基因组竞赛、合成生物学每一步都加速了整个行业。他构思出一个更激进的方案——全基因组霰弹枪测序:打碎基因组成为数百万个随机碎片,用超级计算机拼图组装,最后还原基因组。月,他与团队在预印本上发表文章,宣布了一项“起死回生”实验:将合成基因组移植入“死亡细菌的死细胞”,成功复活并激活了该生物。年起,他的团队开始着手设计和合成一套完整的人工基因组,目标不是编辑,而是从头用化学合成。他的父亲是一位被驱逐出摩门教会的教徒,因酗酒和过度吸烟,在。

2026-04-30 22:28:36 52

转载 iMetaMed | 重庆医科大学令狐华组-解析吡哆醛杀伤卵巢癌的分子机制

点击蓝字 关注我们吡哆醛通过重编程过氧化物酶体过氧化氢代谢诱导卵巢癌致死性氧化应激iMetaMed主页:https://onlinelibrary.wiley.com/journal/3066988x研究论文● 期刊: iMetaMed● 英文题目: Pyridoxal Reprograms Peroxisomal Hydrogen Peroxide Metabolism to Induce Lethal Oxidative Stress in Ovarian Cancer● 中文题目: 吡哆醛通过重编程过

2026-04-29 21:01:17 47

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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