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原创 生信宝典:生物信息学习系列教程、视频、资源

欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需...

2018-01-31 10:02:40 10496 3

转载 iMeta | 武汉大学汪晖/陈廖斌组:解析母体肠道菌群稳态、表观遗传调控机制与子代骨质疏松症易感之间的三元关系

点击蓝字 关注我们母体肠道微生物源性大豆苷元可预防孕期强的松暴露所致雌性子代骨质疏松症iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70037● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70037● 2025年4月28日,武汉大学汪晖、陈廖斌等在iMeta在线发表了题为“Maternal gut mi

2025-05-19 21:02:42 2

转载 官宣!iMeta子刊iMetaMed(定位IF>15)上线了!

(宏)系列期刊是由宏科学(iMeta Science)、数千名华人科学家和威立合作出版的开放获取(Open Access)期刊,目的是发表原创研究、方法以促进生物医药(含生物技术、微生物组、生物信息学等)前沿交叉学科发展,期刊特色包括双语全文和视频、可重复分析、图片打磨、青年编委、60万用户的社交媒体宣传等。目标是打造中国版Cell系列,主刊iMeta定位IF>30,在未来5~8年间创办10本IF>10的iMeta子刊,己创刊iMetaOmics、iMetaMed。编 委:H指数 > 30。

2025-05-18 21:02:28 11

转载 官宣!iMeta子刊iMetaMed(定位IF>15)上线了!

(宏)系列期刊是由宏科学(iMeta Science)、数千名华人科学家和威立合作出版的开放获取(Open Access)期刊,目的是发表原创研究、方法以促进生物医药(含生物技术、微生物组、生物信息学等)前沿交叉学科发展,期刊特色包括双语全文和视频、可重复分析、图片打磨、青年编委、60万用户的社交媒体宣传等。目标是打造中国版Cell系列,主刊iMeta定位IF>30,在未来5~8年间创办10本IF>10的iMeta子刊,己创刊iMetaOmics、iMetaMed。编 委:H指数 > 30。

2025-05-18 21:02:28 3

转载 中国植物学会第二十届全国药用植物及植物药学术研讨会第一轮通知

为了全面贯彻党的二十大和二十届二中、三中全会精神,加快构建现代化产业体系,形成传承创新并重、布局结构合理、装备制造先进、质量安全可靠、竞争能力强的中医药产业高质量发展格局,更好增进人民健康福祉和服务中国式现代化。、邱明华、张文生、龙春林、陈贵林、刘平怀、斯金平、魏道智、程永现、刘春生。届全国药用植物与植物药学术研讨会,湖北、题目、作者、单位、通讯。磊、韩晓伟、郝小龙、洪本科、胡佳栋、胡永乐、黄金泉、黄。敏、欧金梅、尚小飞、沈晨佳、石亚娜、宋慧鹏、宋。大会特邀报告、专题报告、研究生论坛、墙报交流等。

2025-05-17 21:00:50 24

转载 2024年实时影响因子: 中国期刊(25.5.2更新)

2024年6月获得首个影响因子23.8,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,是定位IF>10的高水平综合期刊,欢迎投稿!期刊以及中国主办或中国人主编的高影响力期刊进行了2024年影响因子计算。56.1,将创造历史,成为中国乃至亚洲首本破50的期刊,同时有望超越CNS的影响因子。

2025-05-17 21:00:50 208

转载 STCM | 海军军医大学张磊团队从解码到设计创制理想药用植物的可行之道

再者,有效成分是药用植物区别于其他植物的首要特性,对于有效成分明确的药用植物,高含量亦是理想特性,如黄花蒿中的青蒿素、灯盏花中的灯盏乙素、丹参中的丹酚酸与丹参酮等,均需达到一定含量标准才能满足治疗需求。特别强调,理想药材在满足具体特性需求的同时,还应符合国家与地方标准,并满足监管要求。通过药用植物生物化学、分子遗传、生理及信号传导等领域的研究,以MAPK级联信号通路为分子杠杆,进行道地药材生长障碍的共性机制解析,建立从实验室到田间的关键模块工程化改造,开展模式物种向高附加值道地药材的应用实践。

2025-05-16 21:01:43 16

转载 家系图 - 遗传评估与临床检测信息家系符号

全网正版 | 遗传病/肿瘤基因组与外显子组数据分析实战-5月16号。c. (临床)测试结果,应放在括号内,或在图例中定义。家系图 - 妊娠、流产和妊娠终止相关家系符号。— 对于连锁研究,单倍型信息写在个体下方。感兴趣的单倍型应写在左侧,并适当突出显示。— 重复序列、三核苷酸及扩展数,先用。家系图 - 家系命名法及其常见符号。valuation),表示家系的。b. 若有多个评估,使用下标。家系图 - 辅助生殖相关符号。遗传评估与检测信息家系符号。家系图 - 家系线的定义。已知,则在括号中标识。

2025-05-15 21:01:34 23

转载 iMetaOmics | 吕农华/祝荫/Graham-发现幽门螺杆菌40周年:临床根除治疗中进行优化的“减法”

目前最有效的胃酸抑制剂伏诺拉生的引入证明,在中国和日本的一些地区,高治愈率是可能的。2022年2月正式创刊!然而,一些常用的经验疗法(如序贯疗法、联合疗法或混合疗法)往往会导致至少一种不必要的抗生素的加入,这并不能提高疗效,反而会导致全球抗生素耐药性的上升,最终使治愈率显著下降。我们之前的荟萃分析表明,与伏诺拉生三联疗法相比,伏诺拉生和阿莫西林(VA)二联疗法的根除率更高,而且简化了治疗过程,提高了患者的依从性(即在VA二联疗法中加入克拉霉素并不能提高大多数患者的疗效,反而会导致开出不需要的抗生素处方)。

2025-05-15 21:01:34 43

转载 Nature | 中国农科院农业基因组所、英国约翰·英纳斯中心等合作首次在分子层面全面揭示孟德尔豌豆七大性状变异背后的遗传基础

通过近三百次杂交实验,超过28,000株豌豆后代的表型记录——包括超过14,000颗种子的精确计数和分析,孟德尔发现一个惊人的规律:每一对性状都以鲜明的“显性/隐性”二态分离的方式进行遗传,杂合子中短暂“消失”的性状,会在后代中以可预见的比例重现。以“遗传因子”起笔,走向“基因”的今天。团队在中国南北种植近700个核心豌豆品系,解码了孟德尔七大对立性状的分子本质,打开了160年前“遗传因子”的黑箱子,用真切的分子证据和清晰的因果机制回应了孟德尔留下的百年谜题,也回应了今天对孟德尔的质疑。

2025-05-14 21:01:53 62

转载 iMeta | 广东医科大学李雪萌组-解析百岁老人肠道菌群相关的色氨酸代谢物及其在健康长寿中的功能

点击蓝字 关注我们百岁老人血清代谢组和微生物组分析揭示色氨酸相关代谢物对健康长寿的促进作用iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 23.8)● 原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imt2.70025● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70025● 2025年4月20日,广东医科大学李雪萌、罗辉、戚怡、林颢等在iMeta在线发表了题为“S

2025-05-14 21:01:53 50

转载 山东农大主办,国际学术期刊 WheatOmics创刊发布!

内容涵盖农学、生理学、遗传学、育种、生物技术、基因组编辑、微生物组、功能研究、人工智能以及更多完全或部分整合“组学”领域的稿件,将有力促进科学和技术的创新和应用,解析具有挑战性的生物学问题,改良小麦族和其他模式作物的生产力,保障全球粮食安全。WheatOmics国际期刊的创办,是解码生命奥秘的时代应答,也是顺应时代需求、服务国家战略的重要举措,将成为全球小麦科研领域的里程碑事件,为推动全球小麦研究合作、促进学术创新、提升我国在小麦研究领域的国际话语权作出重要贡献。WheatOmics创刊研讨会合影留念。

2025-05-13 21:01:32 26

转载 TCMChat:一种用于传统中医药的生成式AI大模型 - 浙大&天津中医药大学等

在阅读理解测试中,TCMChat的BLEU、Meteor、ROUGE-1、ROUGE-2、ROUGE-L和BertScore分别为0.584、0.737、0.771、0.734、0.766和0.886,均优于其他模型。在ADMET预测测试中,TCMChat在回归任务中的MAE为2.73,RMSE为10.26,在分类任务中的准确率为0.818,ROC-AUC为0.830,显著优于其他模型。TCMChat的开发和应用为传统中医药的现代化提供了高质量的知识和用户友好的对话工具,推动了中医药领域的技术创新和发展。

2025-05-12 21:00:56 205

转载 连载 | 基因组如何进化?(1)

通过在这种比较中,纳入大量基因组已被测序的物种的基因组,如大鼠、鸡、鱼、狗和黑猩猩,以及小鼠和人类,可以提高这种方法的威力。这一非凡的发现,使科学家们得出结论,我们对脊椎动物细胞生物学的了解比我们想象的要少得多。当然,有巨大的新发现机会,我们应该期待更多的惊喜。,正在彻底改变我们对进化过程的看法,不仅揭示了生物之间家族关系的惊人丰富信息,还揭示了进化过程中的分子机制。但是,即使在研究最深入的物种中,这些高度保守的序列中的大多数的功能仍然未。年的重大发现是,许多基因的实际核苷酸序列在多大程度上是保守的。

2025-05-09 21:00:45 156

转载 文献速递 | Science最新文章目录 2025.4.25

已破解其中4个性状的基因。如今,在一项迄今为止规模最大的豌豆基因组研究中,程时锋及其团队在《自然》杂志上发表论文,揭示了。对牛样本的原始读序数据进行了处理,并相对于本研究中系统发育群的最近共同祖先,确定了高频和低频的单核苷酸变异 (oncatenated)基因组中推断而来的:推断的日期显示在最近共同祖先的结点上,这些日期与 (A)中使用。由于生物的基因突变、进化,是时时刻刻在发生的,这类文章会很稳定地一直有。计算了平均等位基因频率,确定了突变在共识基因序列中的存在情况,并统计了在低频率上检测到的变异。

2025-05-09 21:00:45 69

转载 iMeta高被引论文 | 高颜值高被引绘图网站ImageGP 2.0在线发表

点击蓝字 关注我们ImageGP 2.0:用于生物医学研究的强大数据可视化与可重复性分析工具方法论文● 期刊:iMeta(IF 23.8)● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.239● 2024年9月12日,中国中医科学院黄璐琦、陈同和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队在iMeta在线联合发表了题为“ImageGP 2 for enhanced data visualization and reproducible analysis in biomedical re

2025-05-08 15:25:19 62

转载 会议日程 | 第十二届“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛--第二轮会议通知

论坛由中国科学院数学与系统科学研究院/国家数学与交叉科学中心、中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会、中国生物信息学会(筹)主办,中国运筹学学会计算系统生物学分会、中国生物信息学会(筹)人工智能与生命科学分会、中国科学院青年创新促进会和北京生物信息学研究会协办。今年五月,我们将举办第12届“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛,特别邀请生物信息学领域的知名专家与优秀中青年学者参加会议,共同聚焦生物信息学前沿,展望学科发展的未来。,鼓励大家注册参会。

2025-05-08 15:25:19 18

转载 (15年持续更新迭代)WashU表观基因组浏览器2025更新:自定义基因组+性能提升

王艇教授长期领导大型国际项目例如ENCODE,Roadmap,4DN,TaRGET以及当前最新的人类泛基因组计划(Human Pangenome Project),Multi-Omics for Health and Disease (MOHD*) 和IGVF(Impact of Genetics Variation on Function)。技术的持续发展,本次2025更新对浏览器代码库进行全面重构,旨在提升性能、模块化与易用性,扩大基因组数据可视化的应用范围。本文部分文字内容由DeepSeek生成。

2025-05-06 21:01:34 100

转载 做科研,什么最重要!

这些问题决定了还有哪些实验要做,哪些数要收,这里就再一次需要样板图:在没有数据的情况下,先把整篇文章几个图,每个图里几个小图,每张小图放什么内容,是照片,是折线图,还是热力图......有了样板图规划,行文思路清晰,收集数据将其填充起来即可。更重要的事情还是,你的假说是否足够重要、足够有趣,是否能对同行的研究产生影响,以及,基于这个假说,你是不是能讲出来一个引人入胜、有理有据的创新故事。先找问题,再提出假说,并初步验证假说,找出需要做的关键实验,这些才是课题开始时需要做的事情,而不是直接投进实验里。

2025-05-05 21:01:46 25

转载 2025年两院院士增选工作启动!恢复高考以来你的高校有多少本科院士校友?

中科大和南大作为我国老牌的华五院校,出现在全国第五和第六的位次其实并不令人奇怪,倒是以20人排在第七的山东大学,以及19人排在第八的兰州大学的排名,会让人比较出乎意料。毕竟这两所高校在目前985高校的竞争格局当中,是比较不起眼的,但是在历史的积累过程中,确实是有其独到之处的,这两所高校和吉林大学一样,在院士的培养方面,也是应该受到大家更多的尊敬的!但是在我国目前的高等教育体系之下,一位院士的产生,其实是经历了漫漫的求学之路的,每位院士的本硕博,甚至是高中、初中的就读学校,都会引起社会各界的关注!

2025-05-04 21:01:48 62

转载 iMeta | 南京农业大学韦中组开发多病原生物污染高通量快检平台

点击蓝字 关注我们MBPD:践行一体化健康的多种病原细菌检测流程iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.82● 2023年1月31日,南京农业大学韦中团队在iMeta在线发表了题为“MBPD: A multiple bacterial pathogen detection pipeline for One Health practices”的文章。● 本研究提出了一个多病原细菌检测系统(MBPD)

2025-05-01 21:03:03 282

转载 2024年度中医药十大学术进展发布 | STCM 主编、编委、青年编委获批 4 项

团队对千金藤、北豆根等中药材中的苄基异喹啉类生物碱开展了系统研究,基于本草基因组学研究体系对其抗病毒活性成分进行筛选,解析了其生物合成途径,结合体内外实验阐释了其重塑细胞抗病毒免疫代谢、增强人体抗病毒免疫应答的科学原理,发现了广谱有效、活性明确、安全性高的抗病毒候选药物汉防己甲素、千金藤素等。的新发现、新规律、新观点、新方法、新技术、新产品等,体现本年度研究成果在完善中医药传承创新发展机制,推动中医药事业和产业高质量发展的价值。通过基础研究和网络整合分析,阐释了防上游因素、治当前病变、控下游传变的。

2025-04-28 21:00:52 47

转载 重磅!国家科学技术奖励:鼓励主要论著优先在国内学术刊物上发表

六是规定国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科学技术进步奖候选者及其候选项目在受理和初评后进行公示,异议受理期相应调整为公示期间。《实施细则》在推动落实《国家科学技术奖励条例》(以下简称《条例》),规范国家科技奖励工作方面发挥了重要作用。一是建立健全国家科学技术奖励工作保密管理制度。一是强调国家科学技术奖坚持国家战略导向,坚持“四个面向”,与国家重大战略需要和中长期科技发展规划紧密结合。强调国家科学技术奖励工作坚持党中央集中统一领导,遵循党和国家功勋荣誉表彰奖励工作的基本原则,接受纪检监察监督和社会监督。

2025-04-26 21:02:48 58

转载 Cell | 3 月份文章发表目录 (2025.3.6~2025.3.20)

感染蝙蝠的merbecovirus HKU5-CoV谱系2可使用人ACE2作为细胞进入受体。不同的错配修复复合体基因设定神经元CAG重复扩展速率,驱动HD小鼠的选择性发病机制。针对具有溢出风险的ACE2使用型MERS相关冠状病毒的全球监测与对策。ACE2使用型冠状病毒刺突蛋白的早期融合中间体作为抗病毒靶点。COOL1基因的自然变异增强玉米的高纬度低温耐受性。MERS相关冠状病毒中ACE2使用的多重独立获得。有感兴趣的文章,可在易生信微信群中,发起文章互助。

2025-04-24 21:03:18 59

原创 Nature method: 生物研究中的语言模型入门指南

在迁移学习方法(左)中,预训练模型可选择性调整(如扩展模型结构),并通过进一步训练(微调)解决其初始未涵盖的特定任务。例如,部分模型可能针对特定蛋白质家族的数据进行训练,或采用类似自然语言模型的顺序预测方式预测氨基酸,而非随机遮蔽。在与语言模型的示例对话中,用户向模型提问(绿色文本框),模型则以回答(蓝色文本框或白色代码片段)响应。此外,自然语言模型可通过整合图像或基因序列等多模态数据进行增强,形成多模态模型,从而深入解析不同形式的生物实体。除输出结果外,蛋白质语言模型还可生成蛋白质的嵌入表示。

2025-04-23 21:03:14 1070

转载 第十二届“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛--会议通知

论坛由中国科学院数学与系统科学研究院/国家数学与交叉科学中心、中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会、中国生物信息学会(筹)主办,中国运筹学学会计算系统生物学分会、中国生物信息学会(筹)人工智能与生命科学分会、中国科学院青年创新促进会和北京生物信息学研究会协办。今年五月,我们将举办第12届“数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者论坛,特别邀请生物信息学领域的知名专家与优秀中青年学者参加会议,共同聚焦生物信息学前沿,展望学科发展的未来。,鼓励大家注册参会。

2025-04-22 21:01:14 134

转载 基本概念 | 深度量化基因组、变异与突变速率

根头发的直径约0.05毫米,把它纵向平均剖成5万根,每根的厚度约1纳米;因此,人类基因组的运行知识,包括对健康个体中基因组变异规模的认识,对基因组医学的实践至关重要。R/Rtools/RStudio和基因组流行病学R包(phybreak/BORIS)的安装。Aneuploidy (e.g. trisomy 21) - 非整倍性 (如21三体。估计,人类基因组中,每世代每碱基的新突变 (New mutation)速率约为。他们的任务是鉴定致病性基因组变异,并解释其对患者及其家人的影响。

2025-04-22 21:01:14 110

转载 Cell | 4 月份文章发表目录 (2025.4.3~2025.4.15)

赖氨酸vitcylation是维生素C衍生的蛋白质修饰,可增强STAT1介导的免疫反应》《婴儿肠道共生菌短双歧杆菌的基因组资源揭示定植与宿主-微生物互作的遗传决定因素》《全脑免疫受体图谱揭示IL-17E及其受体IL-17RB的神经调节作用》《国际空间站的微生物与化学环境受使用模式驱动,具有独特性与极端性》《视觉皮层中的运动与前庭信号实现自我运动与外部视觉运动的区分》《HIF调控多种翻译的内源性逆转录病毒:对癌症免疫治疗的启示》《作物根系细菌与病毒基因组揭示未被探索的物种与微生物组模式》

2025-04-21 21:01:27 57

转载 Nat. Genet. | 华南农大发表国际大科学计划FarmGTEx项目白皮书

同时,还能帮助研究人员理解农业动物基因调控与环境条件变化之间的关系,以研究动物在高温环境中的基因调控模式为例,可识别出适应高温的基因变异,辅助培育适应特定环境的品种品系。通过公共RNA测序和全基因组测序数据,目前已构建了牛、猪和鸡的多组织分子QTL(主要为eQTL和sQTL)图谱,并正在其他畜禽物种(如绵羊、山羊、马、骆驼、兔子、鸭子)中进行相关研究。整合全球农业动物的基因组-转录组数据资源,建立农业动物的多组织遗传调控效应图谱,探究农业动物基因表达的遗传决定问题。

2025-04-20 21:01:57 416

转载 Science软文 | 我的危机博士生涯

但每当濒临绝望,我便想起博士生涯第一场危机 (疫情)教会我的:建立共同体,持续传播科学价值。如今,我即将在另一个危机时刻毕业,希望能从第一次危机中学到的经验中汲取力量。焦虑与孤独萦绕着我,但我选择沉浸于严谨而迷人的神经科学中寻求慰藉。我开始构想着一种兼顾创新研究与科普事业的职业生涯:获得博士学位后,我将竭尽所能,避免新冠疫情期间的混乱重演。任何能让我与非科学家对话的事,我都愿意尝试。在新公寓里,远离亲友的陪伴,唯有车流声和灌木丛中的鸟鸣与我作伴。而如今,我将成为其中一员,进入我的首选项目深造。

2025-04-19 21:02:40 82

转载 系统生物学系列讲座:薛宇 - AI赋能蛋白质化学修饰的计算解析DeepSeek 思维链推理

高颜值免费 SCI 在线绘图。最全植物基因组数据库IMP。点击图片直达文字对应教程。

2025-04-18 21:02:01 51

转载 Hortic Res│中国中医科学院黄璐琦/袁媛综述道地药材“形质合一”科学内涵研究前瞻方向:细胞生物力学调控植物形态发生和代谢

尽管上述研究揭示了人参属植物细胞壁与人参皂苷生物合成调控的微妙平衡,但尚无研究直接量化植物在细胞壁重塑过程中细胞力学特性的变化,也尚未阐明调节人参属植物根系力学特征(如细胞壁力学相关的质地、纹理等)是否会影响人参皂苷的合成、积累或空间分布特异性。)的感知和响应能力,包括细胞受到的外部力(如细胞分裂引起的细胞间压力以及细胞膨胀或伸长过程遇到的机械阻力)和内部力(如细胞生长或渗透作用引起的细胞膨胀压变化),以及由细胞力学性质变化引发的细胞力学结构的重构。近期一系列研究进展揭示了植物细胞独特的力学特性形成机制。

2025-04-18 21:02:01 76

转载 iMeta | 德国Engler组-tidyplots为科学家提供简化代码的数据可视化工具

在定义这些函数时,这会导致相当大的代码重复,这不仅增加了源代码的数量,更重要的是,损害了代码的可维护性。例如,tidyplots的函数工厂ff_bar()接受一个统计汇总函数(如mean、median或sum)作为输入,并输出制造的函数add_mean_bar()、add_median_bar()和add_sum_bar()。然而,ggplot2和tidyplots之间的一个主要区别是,ggplot2函数以使用+运算符添加的名词为特征,而tidyplots函数以使用管道运算符在管道中组合的动词为特征。

2025-04-17 21:02:07 80

转载 Nature | 最新发文速递 (2025.3.6-2025.3.27)

我们分析了来自欧洲、东亚、非裔美国人和拉丁裔祖先的参与者的数据(n=158,036例双相情感障碍患者,280万对照组),结合临床、社区和自我报告的样本。一些分析表明,双相情感障碍的病理生理学中涉及特定的细胞类型,包括GABA能中间神经元和中棘神经元。,比之前的发现增加了四倍,并在东亚队列中确定了一种血统特异性关联。美国公司开始掀起“去DEI”的反觉醒浪潮,如丰田美国、沃尔玛、福特、Meta、麦当劳、莫尔森库尔斯酿酒、迪尔、Lowe's、大型研究组的学员,在学术界的表现往往比小型组的学员好。

2025-04-16 21:03:31 100

转载 帮师弟招聘 - 药明康德小核酸药物数据分析员

分子生物学、生物信息学、遗传学、细胞生物学等相关专业硕士及以上学历,或者在二代测序数据分析方向有分析经验的优秀本科生,需要熟悉非编码RNA的产生和功能、了解ASO、siRNA以及microRNA的作用机制 对于核酸化学部分知识有所了解。作为药明康德体外生物学部ID & Oligo团队的核心成员,他/她需要具备小核酸背景知识,理解并熟悉小核酸药物的作用机制和过程,同时需要熟悉生物信息学知识和湿实验知识来支持解读相关结果,为小核酸业务发展提供支持。高颜值免费 SCI 在线绘图。点击图片直达文字对应教程。

2025-04-15 21:01:27 57

转载 Cell Genomics: 西南大学王翊课题组发布新一代基因组浏览器用以整合单细胞和空间多模态数据可视化

SGS 支持snRNA、Visium、slide-seq、setro-seq、scATAC、scMethylC、sc-eQTL、scHiC等多模态数据可视化。SGS还提供3D转录组数据可视化功能,支持表面模型交互式可视化,用户可以实时交互探索3D数据,调整网格模型的透明度、点的大小和透明度,查看基因表达的异质性。支持 GFF、VCF、BED、BW、GWAS、MethylC、HiC、Longrange、Biginteract 等多种格式的基因组数据可视化。

2025-04-15 21:01:27 86

转载 Nature | 最新发文速递 (2025.4.3和 2025.4.10)

Nature》隶属于英国自然出版集团,涵盖自然科学全领域,并设有专门的生命科学板块;《Nature》隶属于英国自然出版集团,涵盖自然科学全领域,并设有专门的生命科学板块;热带作物育种国家重点实验室深圳分院,岭南现代农业广东实验室,农业农村部基因组分析实验室,中国农业科学院深圳农业基因组研究所,等。Circos图显示了TPA Nichols参考基因组的基因组特征,以及包含此处提出的五个古代基因组特有元数据的其它轨道 (T。ead)支持,并在排除推定的重组位置后,删除了数据集中缺失数据超过25%的位置。

2025-04-13 21:02:11 210

转载 Science | 最新一期文章目录 (2025年3~4月)

禁止续聘资深科学家的政策震动美国国立卫生研究院(NIH)通过FABP5-mTORC1信号直接感知膳食α-6亚油酸。G四链体停滞的真核复制体结构揭示DNA螺旋式寸进转移。2016年全球停用Sabin口服2型脊髓灰质炎疫苗。有感兴趣的文章,可在易生信微信群中,发起文章互助。无芯轴制造大弹簧指数与冲程人工肌肉的多领域应用。单分子水平解析翻译机器组成与调控的亚细胞图谱。阳光驱动淡水与海水中一氧化二氮的非生物形成。地球古植物群在15个化石遗址中的生动重现。通过C=C双键解构催化复杂烯烃转化为氧腈。

2025-04-12 21:02:47 172

转载 中国中医科学院杨洪军团队招聘专项博士后

申请人需具有中药学、中西医结合、分子生物学、生物信息学、化学、材料学、医学等相关博士学位,具备质谱分析、多组学研究、生物信息学、人工智能研究经历者优先考虑。学术基础扎实,创新能力强,具有一定的研究积累,参与科研项目并发表过高水平科研论文,具备良好的英语听说读写能力,有较大发展潜力的优秀博士,以第一作者发表。申请人需具有分析化学、中药学、分子生物学、生物信息学等相关博士学位,具备质谱分析、多组学研究、生物信息学、统计学、人工智能研究经历者优先考虑。)多类器官芯片在线传感技术、自动化装置、仿生材料的开发;

2025-04-12 21:02:47 91

转载 iMetaOmics | 2024年亮点论文合集

本研究收集了全球脊椎动物的16S rRNA和宏基因组测序样本,系统评估了全球脊椎动物的肠道微生物多样性及其影响因素,全面揭示了陆地脊椎动物肠道微生物与其同域土壤生物环境样本之间常见的抗生素抗性基因组及其潜在移动性。本研究总结了人类精液的糖蛋白组,目前对男性生殖系统及相关疾病中糖基化的认识,糖蛋白质组学方法的进展,以及最新糖蛋白质组学技术在男性生殖中的潜在应用。本研究针对二倍体棉种的泛基因组构建及综合分析,为理解二倍体棉种扩张过程中的动态基因组变异提供了洞见,并能促进现代棉花育种的有效性。

2025-04-11 21:00:50 57

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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