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原创 【一只羊做生信】bulk普通转录组上游分析一文搞定

转录组是指。

2024-03-14 15:05:23 1116 1

原创 大哥你做科研 做它有啥用啊|2024元旦快乐

而我站在远处,看着他的样子,和旁边的朋友说:“希望我到他的年纪,还能保持有所热爱”。我一直不是很理解,大家基本上都是换个材料,换个方法,诶就是创新点了,哪有那么多创新点,哪有那么多意义,或许能让我毕业,世界上多了一个“啥也不会”的硕博生,就是我这个工作的意义。

2023-12-28 12:11:14 527

原创 【单细胞转录组标准分析】上线CCtalk、网易云课堂

按照实际分析顺序——**标准分析流程介绍(单样本)、多样本整合分析、差异分析、功能注释、添加celltype标签(及分样本/分组信息)、中间穿插着常见的可视化图。但实际去看他们的课程表,从Linux、R、绘图、Python、Seurat、轨迹分析...两三天的时间里看似什么都教了,听完真的能会多少呢?在分析单细胞数据时,同一类型的细胞往往来自于不同的细胞周期阶段,这可能对下游聚类分析,细胞类型注释产生混淆。本节详细介绍了复杂热图的画法,在添加细胞/样本/分组标签后能添加多层注释条,并添加上想展示的基因名。

2023-12-27 14:26:18 756

原创 读研读博,你还需考虑以下几个问题

课题组氛围如何(每周会聚餐吗),课题组有多少人(人多的大组个人出头的几率可能不会那么大,以及资源不一定会分配给你),然后找到课题组的论文,研究方向是否适合你(研究生和博士的方向不一致的话,也需要承担很大的心理压力以及学习时间),是否推荐来这个组(比较本课题组是最了解的,如果对方说快跑,一定得挺劝!),如果不推荐,是否有推荐的课题组/导师?包括但不限于宿舍几个人,是否有上床下桌/单人床,是否有阳台,是否有独卫(不光是上厕所,如果是公共洗漱池还要忍受噪音问题),是否有阳台可以晾衣服,厕所是否能洗澡!

2023-12-19 17:19:31 240 2

原创 【R语言】使用ggpubr包绘制折线图

ggpubr包是一个用于数据可视化的R语言包。它建立在ggplot2包的基础上,使得数据可视化更加简单和灵活。它提供了一系列函数和工具,用于创建高质量的图形和图表。支持各种类型的图形,包括散点图、线图、柱状图、箱线图、饼图等。使用ggpubr包,可以轻松地自定义图形的外观,包括颜色、字体、标签、图例等。此外,ggpubr包还提供了一些统计分析和数据处理的功能,如计算和可视化统计指标、绘制显著性标记、添加回归线和置信区间等。

2023-11-24 16:00:41 523 1

原创 【单细胞转录组】基因调控网络分析基本方法-背景介绍

基因表达的调控是通过基因调控系统实现的,这是一个复杂的系统,它是由基因、蛋白质、小分子信号和其他分子组成的,这些分子相互作用,并通过转录因子、miRNA等介导,影响基因表达。

2023-11-21 09:58:13 375

原创 【付费系列】单细胞转录组分析基础分析系列上架CCtalk-手把手教你做整合注释

但实际去看他们的课程表,从Linux、R、绘图、Python、Seurat、轨迹分析...两三天的时间里看似什么都教了,听完真的能会多少呢?打好基础,这个可能就需要几个月的时间。这个视频录制于去年刚接触单细胞转录组分析的时候,按照Seurat官网介绍了单样本分析的流程,数据可从10x官网下载。在分析单细胞数据时,同一类型的细胞往往来自于不同的细胞周期阶段,这可能对下游聚类分析,细胞类型注释产生混淆。本节详细介绍了复杂热图的画法,在添加细胞/样本/分组标签后能添加多层注释条,并添加上想展示的基因名。

2023-11-18 15:15:17 263 1

原创 【付费系列】手把手教你做分子标记相关课题|从引物设计到数据分析

遗传标记(Genetic marker)是研究遗传多样性的有效手段,在遗传学研究 中,遗传标记主要应用于连锁分析、基因定位、遗传连锁图谱的构建、 种质资源鉴定与分类等研究中。通常将 DNA 分子标记技术分为基于 Southern 杂交为基础的分子标记技术(如 RFLP、染色体原位杂交等)、基于PCR 的分子标记标记技术(如 RAPD、SCAR、AFLP、SRAP、SSR、ISSR、InDel 等)和基于 DNA 序列和芯 片的分子标记技术(如基于叶绿体 DNA 的分子标记、SNP 等)三类。

2023-11-15 14:36:13 610

R语言使用ggpubr包绘制折线图

R语言使用ggpubr包绘制折线图

2023-11-24

gb7714修改版 zotero样式修改

解决使用zotero插入参考文献时中英文混排 英文作者出现“等”

2022-04-20

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