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原创 区分一下cluster、MPP、SMP和SSMP
最近学习GA库,发现应当对多种计算机架构进行区分,故查阅资料,总结如下MPP(Massive Parallel Processing),每个现在有多种架构需要区分MPP (Massive Parallel Processing)SMP(Symmetrical Multi-Processing)NUMA (Non-uniform memory access)SSMP(Scalable shared-memory multiprocessing)DSM(distributed shared m.
2021-03-27 18:58:56 5352 1
原创 在DGX-A100上编译NWCHEM 的MPI+CUDA版本
1. 安装OpenBlas这是nwchem编译需要使用的库,从官网上下载源代码。 git clone https://github.com/xianyi/OpenBLAS.git #编译 make #安装到指定路径 make install PREFIX=/home/jrf/tools/openblas2. 安装OPENMPI网上搜索openmpi4.1.0稳定版本 链接解压,并进入解压文件夹mkdir build && cd buildconfigure 设置安装
2021-03-06 22:06:23 459
原创 lscpu的查看方法
这是dgx A100工作站,以这个机器举例:CPU(S): 逻辑核心数Thread(s) per core : 每个物理cpu核包含几个线程,即逻辑核sockets : CPU的物理插槽数Core(s) per socket : 每个插槽上的物理CPU 核数NUMA node(s): 节点数。逻辑CPU核的组合形式,多个CPU组合形成一个numa节点,节点之间的通信速度低于节点内部的通信速度。NUMA node0 CPU(s): node0包含哪些逻辑CPU。这里node 0包含的逻辑
2021-03-04 20:08:37 1274 5
原创 使用conda安装openmpi编译nwchem
1 遇到如下错误:找不到libpthread.so.0configure:20418: checking whether FLIBS needs -lgcc_sconfigure:20443: cc -o conftest -m64 -Wall -O3 -funroll-loops -ffast-math -fopenmp -g -I. -I/home/apps/jinrf/nwchem-conda/nwchem/src/include -I/home/apps/jinrf/nwchem-cond
2021-03-02 10:16:38 1813 2
原创 anaconda 在集群上配置openmpi
1 首先安装openmpi所需要的编译器所需要的编译器有:x86_64-conda-linux-gnu-gccx86_64-conda-linux-gnu-g++x86_64-conda-linux-gnu-gfortran安装指令分别为conda install -c conda-forge gcc_linux-64 conda install -c conda-forge gxx_linux-64conda install -c conda-forge gfortran_linux-
2021-03-02 08:52:27 4010
空空如也
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