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原创 如何向PDB文件添加双键

18号原子需要与19号进行双键链接,那么久在PDB文件中CONECT 18 和CONECT 19分别在加一次18和 19然后再通过Atomic Blender(勾选Bonds)就可以成功添加双键。在用PDB文件进行分子绘图的时候(制作OBJ),发现像Atomic blender插件和PDB本身并不支持双键,需要对PDB文件进行修改,参照的该yt链接。即,在PDB文件中对需要添加双键的原子进行编辑,如下图所示。

2023-09-21 17:29:20 489

原创 AmberTools23的安装

e. 配置环境 即 在 用户根目录下 修改 .bashrc文件,添加 export PATH=/home/user/miniconda/bin:$PATH 其中 User换成用户名,并最好核实一下安装路径。5、安装跑完就可以了,平时要用的话,首先要 激活环境 conda activate AmberTools23 然后就可以开始命令计算了。2、利用终端对*.sh文件进行可执行授权 (在文件目录下执行 chmod +x ./*.sh,星号换成文件名)c. 确认安装路径,或者按需修改。

2023-06-15 17:14:56 3560 1

原创 关于GMS3(Digitalmicrograph)μm微米显示乱码的处理方法

由于该软件对中文编码系统支持不太好,我平时都放的um,答辩时被评委老师提出来说了“该μm就写μm”。定稿前修改论文的时候就在想这个事儿,结果方法被我试出来了。方法如下:1、先按照网上教程对SEM/TEM图片进行尺码测量,测量线别删除,然后点击calibrate 调出像素和单位匹配的对话框,里面的乱码没办法解决,但是可以解决最终的显示问题2、按照需求先点一个你需要的但显示不出来的单位,如衸或者?(分别代表μm和埃)3、然后点确定,现在不会显示单位4、调出标尺(自行百度)5、右键点击标尺

2022-05-18 21:38:28 2923

原创 高效添加origin配色盘

首先找个喜欢的渐变色或者色彩集合这里以这个网站的颜色为例uiGradients - Beautiful colored gradientshttps://uigradients.com/#KyeMeh截图保存一张然后用PS打开,并用裁剪工具,裁掉多余部分,随后在PS中 文件--> 导出 --->存储为web所用格式,然后将预设调成PNG-8 128 防色,随后将颜色调为 256,在颜色表的下拉菜单中,选择按明亮排序(看自己喜好),随后再在颜色表的下拉菜单中存储颜色表。随后打开or..

2021-12-27 18:32:48 5703 1

原创 关于毕业论文公式题注等问题

最近在写毕业论文,遇到一个公式引用的问题,学校要求章必须要是大写数字 一、,而公式里的题注必须是小写数字(1-1),word 没有那么智能的把你的题注统一换成小写,那么就要使用到域。首先 教程 如链接所示http://blog.sina.com.cn/s/blog_c2c66a9f0102y8it.htmlhttp://blog.sina.com.cn/s/blog_c2c66a9f0102y8it.html然后修改完域代码后,再按一下F9就可以了。还是很智能,写公式的时候如果遇到居中的问题,.

2021-12-22 13:27:31 403

原创 修改树莓派的CoD(即蓝牙识别类型)

树莓派通过蓝牙连接手机后,一般被识别为耳机,有时候就会挤掉我的本身的蓝牙耳机。需要通过hciconfig修改掉蓝牙的 CoD(Classes of Devices)首先利用http://www.question-defense.com/tools/class-of-device-bluetooth-cod-list-in-binary-and-hex勾选需要的功能,用计算出的cod码替换掉以下命令的xxxxxxsudo hciconfig hci0 class xxxxxx然后重..

2021-07-27 18:41:27 850

原创 关于pybluez 树莓派 配置过程的坑

主要是要记录,在利用pybluez对树莓派调试前,必须在命令行利用bluetoothctl 与手机(例如我的华为p30)进行配对连接 如这篇文章https://blog.csdn.net/qq_34548075/article/details/107062005所描述的命令如果只利用pybluez 的rfcomm_server.py在后台,直接通过手机蓝牙端连接树莓派,是无法连接树莓派的(PC好像可以直接连接),怀疑是Android的安全机制作怪。必须进行 trust - pair -co..

2021-07-24 18:15:44 391 1

原创 关于Matepadpro使用 termux的坑

当我用vnc 链接以后,随便点一下,马上卡死,原因很简单,华为本身的后台管理的问题,通过平板管家-应用启动管理中关闭自动管理,并允许termux,vnc后台运行即可

2021-07-15 16:27:14 1336

原创 python包 pyGAPS 可用于拟合吸附等温线

上次自己写lamgmuir吸附曲线的时候,我就在想,应该至少会有一个包可以用于计算吸附脱附曲线,果然找到了pyGAPS,搜了一下中文博客貌似没有介绍这个的,于是打算写个博客,汉化的同时,也可以做备忘。首先不用多说,安装用 pippip install pygaps同时它依赖于numpy,scipy,pandas,matplotlib,CoolProp四个库(官方推荐了Anaconda,才发现有这个东西)(基础的有机会在写)目前让我眼前一亮的是model_iso...

2021-04-22 11:34:16 937

原创 记录一下在树莓派4内安装pyqt5的相关命令(尤其pyuic5命令不可用时

记不太清了,重要的包括以下命令sudo apt-get install python3-pyqt5 pyqt5-devpyqt5-dev-tools其余的设置pyquic快捷方式的可以参考:(21条消息) 树莓派3B Qt designer+Pyqt5+pycharm超声测距(9)_诺有缸的高飞鸟的博客-CSDN博客(21条消息) PyCharm中配置与PyQT5相关的External tools_tb_youth的博客-CSDN博客(记这个主要是因为按照其他教程安装完成后,pyui.

2021-03-03 00:53:43 1118

原创 华为用实体键盘时切换中英文快捷键备忘

在实体键盘下,按shift+空格可以切换中英文

2021-02-08 01:01:06 2318

原创 Ubuntu 18 中启动vscode 没有反应的解决办法

arm架构中(树莓派4b),ubuntu 18中 安装vscode后打开vscode没有任何反应,无法正常打开,然后用日志模式后code --verbose报错信息为Xlib: extension "XInputExtension" missing on display ":1".Xlib: extension "XInputExtension" missing on display ":1".[12192:1109/190657.768585:ERROR:electron_bro.

2021-01-30 21:16:54 7702 4

原创 OPENWRT或旁路由如果不能正常使用opkg,正确上网等的一种解决方法

家里有个n1,我刷了个openwrt做旁路由,主路由是 AC2100,莫名其妙的无法正常使用某些功能,例如opkg updae,正确上网也不行。按照之前的教训,防火墙的设置影响较大,我用的防火墙规则是自带的lan规则,如下图所示,并不满足作为旁路由的转发条件,即从lan口进入旁路由,再从旁路由出到lan口,回到主路由。于是,新建一个规则就可以了,如图:看网上介绍,与相关设置的介绍较少,然后推荐一个旁路由设置帖子,介绍的挺好https://www.right.com.cn/forum/fo..

2021-01-29 01:59:09 11045 2

原创 2021-01-06

在设置华硕主板的远程唤醒时发现一个事,如果远程唤醒后关机,再尝试唤醒失败时,关闭win10系统内的快速启动就可以避免这个问题

2021-01-06 12:35:13 72

原创 2021-01-05

numpy.linalg.LinAlgError: SVD did not converge在使用peakutils.baseline时,有时候会遇到报错 ,如上numpy.linalg.LinAlgError: SVD did not converge,经过排查后发现是 y 的索引的问题,必须保证输入的 y 值 索引从0开始...

2021-01-05 12:33:07 633 1

原创 关于树莓派4b安装kernel-headers报错处理方法

最近在调试respeaker,用的是树莓派4b,用官网的install.sh一直无法安装headers文件,去找了下respeaker官方的源,用上貌似没啥效果,一直报错E: 没有源可以用来下载 1.20200819-1 版本的 raspberrypi-kernel:armhfdebian package raspberrypi-kernel_1.20200819-1_armhf.deb already installed.--2020-11-26 11:14:33-- http://rasp.

2020-11-26 11:31:43 2184

原创 pixel xl9.0卡在网络验证的解决方法

家里路由器不支持挂代理,用的电脑挂代理开热点还是不行,怀疑9.0的系统问题,于是找到这个方法,刷回7.1版本。然后开机挂代理就行了,然后再升回9.0,美滋滋...

2019-02-03 02:07:05 5119 1

原创 Android https post 访问服务器出现javax.net.ssl.SSLPeerUnverifiedException: Hostname ***.****.**not verified

完整的logcat为08-16 14:40:23.087 4134-4593/zzy.resdig W/System.err: javax.net.ssl.SSLPeerUnverifiedException: Hostname 111.231.78.78 not verified: certificate: sha1/HN022fQJMYP5/M4TTHZqnG2Nqmc=...

2018-08-16 14:43:51 5495

原创 Android toolbar中title始终无法居中的原因

我看过网上的各种方法。我也是从textview入手,就是无法居中。这是源码。<android.support.v7.widget.Toolbar android:id="@+id/toolbar" android:layout_width="match_parent" android:layout_height="wrap_content" android:m...

2018-03-21 21:42:14 4316

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