python 按自己的理解尝试实现fn算法

贪心算法FN具体步骤如下所述:

(1)去掉网络中所有的边,网络的每个节点都单独作为一个社区;

(2)网络中的每个连通部分作为一个社区,将还未加入网络的边分别重新加回网络,如果加入网络的边连接了两个不同的社区,即合并了两个社区,则计算形成的新的社区划分的模块度的增量。选择使模块度增长最大或者减小最少的两个社区进行合并;

(3)如果网络的社区数大于1,则返回步骤 (2) 继续迭代,否则转到步骤 (4);

(4)遍历每种社区划分对应的模块度的值,选取模块度最大的社区划分作为网络的最优划分。

 

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
import sys
sys.path.append('./')

class FN:
    def __init__(self,G):
        self.G = G                                     
        self.G_copy = G.copy()
        self.edges = [n for n in self.G.edges]                  #把网络中的所有边保存在edges中
        #print(self.edges)
        self.G.remove_edges_from(self.edges)                    #将网络G中的所有图删除
        self.temp_q = {}                                        #存放每一轮的加入边后ÿ
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