【conefor2.6】操作补充

先感谢这个大哥@Q一件事(他在这里发了【confer安装与连接度的计算】大家可以在网站里搜搜)和我的师姐耐心的指导。希望能帮到大家。


1、在使用插件前要先确定,GIS右下角的坐标显示是米还是经纬度,我们要用的是【米】,可以在视图-数据框属性-常规-单位里面调整,还有插件界面输入廊道距离那个框下面,显示的一定要是meters才能运行(如下图)。

 (操作手册里的图图,我的操作和上图不一样的地方是我在output options版块里只勾选了ASCII)

2、我在查阅相关文献的时候发现,有些研究区在运行插件之前都会进行生态源地选择,有的是选面积前30,有的是面积大于50KM2(举例),是看自己研究需求的。我也去嗑了这个插件的使用手册,手册里面的建议是【请注意,如果shapefiles较大(即面要素数量增加),处理速度会变慢。此外,高度复杂的要素在计算它们之间的距离时会降低计算时间。折点多的面比折点少的面需要更长的分析时间。通过这种扩展,减少描述多边形边界的顶点总数的一些先前处理(特别是移除冗余顶点,如果有一些的话)可能有利于距离计算的速度】,这里是手册里的原话哈(我自己拿软件翻译的,可能不准确,在官网可以下载)。

我之前还天真的猜想,conefor还有个2.2的版本,本着低版本可能会更加稳定的原则,去找了2.2的手册,发现2.2只适配AcrGIS9.xx,有需要的家人们可以在conefor的官网找到这个版本。


3、我用这个插件运算过3个研究区,一个是小县城,一个是某省会,一个是我的研究区(由两个地级市组成)。运算下来的体验是:研究区越小,要分析的要素越少,运算时间越快。县城我用了大概2.5小时,省会至今没有运算出来,我的研究区现在卡到我人崩溃了,我从常规的面积前30的源地,换到面积大于30km2的源地,再换到面积大于50的源地,都还没算出来。按师姐的说法就是:等,这个阶段你只能等,守着电脑慢慢等。是的等待我的是一个又一个的错误报告。下一步我打算按照操作手册的建议去运行一个程序,不行的话我只能去网吧搞研究了,再不行只能弃用这个研究方法。

4、大家在运算的时候,除了更换研究区大小,也可以选择更换距离阈值,师姐建议我从1试到10000,我偷懒用2500算出来了县城的廊道,但是其余两个研究区都还没有算出来,屡屡停留在40%,甚至算了四天三夜还没算完。

5、如果大家有什么能加快运行速度的方法请一定告诉我,真的不想再浪费掉很多很多时间了。

希望我的笔记能帮到大家

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2022.6.8更新

俺迫于电脑拉胯,换了研究区,从之前的两个地级市,换到了三个小县城,用这个插件的速度也刷刷往上飞,跟同学说几句话的功夫就算完了。

还有一个原因我觉得可能是GIS版本的问题,我原来用的是10.5,后面整个GIS模型出了问题,我重装了10.6,整体感觉不仅插件用快,连其他操作都快了,所以大家也可以试试换个GIS。

软件安装包Conefor is a software package that allows quantifying the importance of habitat areas and links for the maintenance or improvement of connectivity, as well as evaluating the impacts on connectivity of habitat and landscape changes. Conefor is conceived as a tool for spatial ecology analyses and for decision-making support in conservation planning, through the identification and prioritization of critical sites for habitat and landscape connectivity. Previous versions of Conefor were known as Conefor Sensinode. Conefor includes new connectivity indices (integral index of connectivity, probability of connectivity) that have been shown to present an improved performance compared to other existing indices and to be particularly suited for landscape conservation planning and change monitoring applications (Pascual-Hortal & Saura 2006, Saura & Pascual-Hortal 2007, Saura & Rubio 2010, Saura et al. 2011). These indices are based on spatial graphs (networks) and on the concept of measuring habitat availability (reachability) at the landscape scale. This concept consists in considering that an habitat patch is connected to itself, measuring the connected habitat resources existing within the patches (intrapatch connectivity) jointly with the resources made available by (or reachable through) the connections with other habitat patches (interpatch connectivity). In this way, connectivity is conceived (and measured) as the property of the landscape that determines the amount of reachable habitat in the landscape, no matter if such reachable habitat comes from big and/or high quality habitat patches themselves (intrapatch connectivity), from strong connections between different patches (interpatch connectivity) or, more frequently, from a combination of both.
Conefor 2.6是一个用于分析复杂生态网络的软件工具。以下是使用Conefor 2.6的基本操作步骤: 1. 打开Conefor 2.6:在计算机上打开Conefor 2.6软件程序。 2. 导入数据:从生态网络数据文件中导入数据。数据文件通常是以.csv或.xls格式保存的。选择适当的文件并将其导入Conefor 2.6。 3. 设置参数:在Conefor 2.6中设置分析参数。可以指定用于分析的节点和链接属性,设置链接阈值以确定链接的存在或缺失,并选择适当的网络指标。 4. 运行分析:点击运行按钮开始执行分析。Conefor 2.6将计算各种生态网络指标,如连接度、中介中心性、模块化等。 5. 查看结果:在分析完成后,可以查看分析结果。分析结果通常以图表或表格的形式呈现,可显示各种生态网络指标的计算结果。 6. 解释结果:根据分析结果解释生态网络的特征和属性。通过对结果进行解释,可以更好地理解生态网络的结构和功能。 7. 导出结果:根据需要,可以将分析结果导出到其他文件格式,例如.csv或.xls文件,以后续分析或可视化使用。 8. 保存项目:在分析完成并导出结果后,建议将项目保存下来,以便今后再次打开并进行进一步的分析。 Conefor 2.6是一个功能强大的生态网络分析工具,可以帮助研究人员理解和研究复杂生态系统中的相互作用模式和结构。以上是使用Conefor 2.6的基本操作方法的简要概述。
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