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Linux软件安装
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CentOS 7 非 root 用户编译安装 Python 3.10
本文详细介绍在 CentOS 7 上非 root 用户编译安装 Python 3.10,以能使用 bz2、ctypes、ssl 三个 Python 模块为示例,供有需要的朋友参考。文中的代码可以复制下来保存为 bash 脚本文件,如 build_py310.sh,在当前用户下,直接 bash build_py310.sh 执行,即会在当前用户家目录下建立 build_py310 编译文件夹进行编译,并且所有文件安装在家目录下的 py310 文件夹中。原创 2023-08-07 10:08:41 · 302 阅读 · 0 评论 -
JAVA 生物信息软件 Flux Simulator、Astalavista、Flux Capacitor 源码临时修复及编译
今天分享一套依赖破坏的开源 JAVA 生物信息软件 Barna 项目的临时修复及编译。这套软件包括:Flux Simulator、Astalavista、Flux Capacitor,主页地址:https://confluence.sammeth.net/。这套软件由于太久未更新,无法编译通过,因为其依赖的网络上的各种包和文件链接失效。并且,当前已经无法从原仓库下载源码了。于是,我将原来下载的源码和修复上传到 github。借此软件的修复,小结一下 JAVA Gradle 编译软件依赖包的修复。原创 2022-08-23 15:06:36 · 563 阅读 · 0 评论 -
Linux 上非 root 用户 Conda 编译安装 ISCE2(含 RelaxIV 、GPU 加速等全部可选项,2023年4月8日更新)
今天演示一下 Linux 上非 root 用户 Conda 编译安装 ISCE2(含 RelaxIV、GPU 加速等全部可选项)。本文的演示环境是 Nvidia A100 GPU 云服务器、Ubuntu 18.04 Linux、Miniconda3 版本 4.13.0、ISCE2 git 仓库最新版本。视频演示分为 ISCE2 编译安装和简单测试两部分。视频文本:学习日记 https://www.learndiary.com/2022/08/linux-conda-isce2/.........原创 2022-08-10 18:24:48 · 1154 阅读 · 4 评论 -
Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 MetaboAnalystR 演示
前些天演示了一下 Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 CellMix( https://www.learndiary.com/2022/05/linux-conda-cellmix/ ),今天演示 Conda 安装一款比较新的生物信息 R 软件 MetaboAnalystR 3.2.0。这款软件于2017年底发布于 github 上面,现在最新的版本是3.2,仍在持续更新中。本文演示环境是 Deepin 20.6 Linux、Miniconda3 版本 4.13.0...原创 2022-07-06 14:19:02 · 1324 阅读 · 0 评论 -
Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 CellMix 演示
今天演示一下 Linux 下非 root 用户 Conda 安装生物信息 R 软件包 CellMix,CellMix 是一款 9 年前就停止更新的老旧生物信息 R 软件包,但是却有人仍然需要使用它。由于年代久远,官网上的安装方法在现在的较新的 R 版本环境下已经失效,给安装带来相当的难度。本文的演示环境是位于腾讯云广州区的 Debian 10 Linux 云服务器、Miniconda3 版本 4.12.0、R 4.0.2、CellMix 1.6.2。...原创 2022-05-29 11:47:47 · 759 阅读 · 0 评论