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生命的编码
文章平均质量分 90
以科技之弦,奏响生命之曲
李乾文
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深度学习 GNN图神经网络(四)线性回归之ESOL数据集水溶性预测
本文旨在使用化合物分子的SMILES字符串进行数据模型训练,对其水溶性的值进行预测。之前的文章《深度学习 GNN图神经网络(三)模型思想及文献分类案例实战》引用的Cora数据集只有一张图,属于图神经网络的节点分类问题。本文介绍的是多图批量训练的线性回归问题,在文章最后也讨论了图分类问题。原创 2023-04-28 02:10:42 · 2637 阅读 · 1 评论 -
如何将化学分子SMILES字符串转化为Pytorch图数据结构——ESOL分子水溶性数据集解析
在用Pytorch图神经网络对化学分子进行数据分析的时候,经常使用现有的数据集。看到自动处理完毕的数据结构,里面的特征值让我们一脸懵逼,不知道代表的是什么含义。本文将带大家分析这些数据结构的来龙去脉。原创 2023-04-27 17:33:16 · 3809 阅读 · 0 评论 -
生命的编码-业余玩家怎么读懂AlphaFold的重要意义
生命的编码1、前言2、生命结构2.1 生命系统的结构层次2.2 九大系统2.3 人体器官2.4 组织2.5 细胞2.6 DNA2.7 肽链2.8 蛋白质折叠3、相关工具4、人造生命体的探讨1、前言本文尝试从原子层面介绍了基础生命构造原理,并探讨人造生命的可行性。原创 2021-07-25 14:53:39 · 1989 阅读 · 1 评论