在CentOS 7服务器上安装oggm，并映射到本地浏览器运行（本地虚拟机同理）

OGGM简介

官网：https://oggm.org/

（ChatGPT翻译）OGGM是一个面向冰川的开源建模框架。该模型考虑了冰川几何形状（包括供水分支），并包括显式的冰动力模块和冰川脱落参数化。它可以在完全自动化和可扩展的工作流程中模拟世界上（几乎）任何冰川的过去和未来的质量平衡、体积和几何形状。我们完全依赖公开可用的数据进行校准和验证。OGGM是模块化的，支持新颖的建模工作流程：它喜欢被重新组合和重复使用！

安装常见问题

官网所给的简易安装方法不奏效

问题描述

OGGM有很多依赖包，各个依赖包之间的环境较为复杂。如果采用官网的安装顺序，会出现复杂的依赖包无法解决环境的问题。

解决方法

使用本文推荐的安装顺序，不依靠官网推荐的简易安装方法

附：官网的environment.yml

name: oggm_env
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - numpy
  - scipy
  - pandas
  - shapely
  - matplotlib
  - Pillow
  - netcdf4
  - scikit-image
  - configobj
  - xarray
  - pytest
  - dask
  - bottleneck
  - pyproj
  - cartopy
  - geopandas
  - rasterio
  - rioxarray
  - seaborn
  - pytables
  - salem
  - motionless
  - pip
  - pip:
    - joblib
    - progressbar2
    - oggm

无法下载Demo

问题描述

在 import salem 的时候，会出现无法下载Demo的问题，这是国内网络无法正常访问GitHub所致。

解决方法

在浏览器中下载相关Demo后复制到对应文件夹上。搜索相关依赖包的安装步骤替换即可，下面提供了一个在python 3.11平台测试成功的资源供参考，详细步骤不再赘述。

安装salem时无法下载Demo数据可以用于替换的文件

正确安装顺序

1. 新建一个环境并激活

conda create -n oggm python=3.11 -y

conda activate oggm

2. 安装geopandas

conda install -c conda-forge geopandas -y

3. 安装rasterio，rioxarray，netcdf4，h5netcdf

conda install -c conda-forge rasterio -y

conda install -c conda-forge rioxarray -y

conda install -c conda-forge netcdf4 -y

conda install -c conda-forge h5netcdf -y

4. 安装salem

conda install -c conda-forge salem -y

5. 安装seaborn

conda install -c conda-forge seaborn -y

6. 安装scikit-image

conda install -c conda-forge scikit-image -y

7. 安装dask

conda install -c conda-forge dask -y

8. 安装cartopy

conda install -c conda-forge cartopy -y

9. 安装motionless，bottleneck，configobj，pytables，pytest

conda install -c conda-forge motionless -y

conda install -c conda-forge bottleneck -y

conda install -c conda-forge configobj -y

conda install -c conda-forge pytables -y

conda install -c conda-forge pytest -y

10. 安装progressbar2

pip install progressbar2

11. 安装oggm

pip install oggm

12. 测试

pytest.oggm  --disable-warnings

出现如下字样则表示安装成功

映射到本地浏览器

1. 安装jupyter notebook 相关依赖包

conda install ipykernel -y

python -m ipykernel install --user --name oggm --display-name oggm

conda install -c conda-forge  jupyter_contrib_nbextensions -y

jupyter contrib nbextension install --user

注意：如果是第一次使用，请参考远程访问服务器上的jupyter notebook

2. 打开jupyter

jupyter notebook

Enjoy