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原创 关于将LigandMPNN模型封装至AiCE方法的一些复盘
需要注意的是,不同于proteinMPNN中num_seq_per_target参数指定生成序列数量,LigandMPNN内指定参数生成序列数量需要靠两个参数共同制定,即batch_size与number_of_batches,例如博主给出的示例中,生成序列数量为10x100=1000,在实际工作中,若想提升生成序列数量至10000,将number_of_batches数值改为1000即可。值得注意的是,LigandMPNN给出的采样温度(temperature)的默认值为0.05。
2025-07-31 20:22:39
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原创 关于配置AiCE( High-fitness mutation prediction tool)的一些复盘
关于AiCE环境配置中可能遇到的一些问题及其解决方案
2025-07-18 10:31:07
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空空如也
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