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原创 并行磁共振成像——SENSE 敏感度编码成像

SENSE 并行磁共振成像

2022-08-05 20:55:16 3333 2

原创 FSL——FLIRT使用配准与降采样 registration and resample

FLIRT命令配准与降采样

2022-04-08 16:02:49 3100

原创 Keras 多GPU mult_gup_model 报错 cannot import name ‘multi_gpu_model’ from ‘keras.utils’

keras 多GPU训练报错及解决方法

2022-03-22 15:06:43 7186 5

原创 VNC 和 Anaconda 的环境变量冲突

之前安装了 anaconda 之后顺利配置了路径之后,并没有出现任何问题,直到 VNC 出现的卡死的状态,后来我按照其他博主的分享使用 kill -9 命令关闭了进程,由于当时的进程较混乱,误以为的关闭错误,后来重新配置了一个账户,使anaconda的环境变量生效后,还是出现了 VNC 不能使用的问题,后来查找发现是因为 anaconda 路径会和 VNC 的路径冲突解决办法,为了能使用 VNC 我修改了 bashrc 文件,删除了 anaconda 的路径,使得路径的冲突得到的解决simple b

2021-08-22 15:55:11 1428

原创 视网膜血管分割方法整理

针对DRIVE数据集进行血管分割的方法参考,使用了UNet,匹配滤波以及形态学三种方法。

2021-07-16 18:59:31 8136

原创 ResNet 皮肤癌分类tricks总结

使用ResNet对于皮肤癌分类的尝试,介绍了多种trick更好的训练网络。小学生的尝试,请大家多多指教。

2021-07-16 11:13:49 908

原创 弥散成像模拟软件camino的安装

想要安装camino,但是在我站并没有找到合适的参考,所以把自己安装过程写下来了,欢迎同行交流,也欢迎大家给我点个赞

2021-04-07 20:17:03 270 1

原创 数据可视化基础概念

数据可视化的基本概念,数据类型的分类,以及常见的图表方式

2021-04-04 22:15:40 264

原创 MRI图像处理——图片不均的校正

对于MRI图像磁场的不均性进行处理的几种方法介绍

2021-03-24 20:48:40 3640

原创 医学图像处理——基本概念(色彩、直方图、CT值)

对于图像处理的知识已经有太多的前辈们写过精彩的博文了,我呢只是将自己的学习路线记录下来,对于我学习到的知识进行整理和归纳,欢迎同好交流,更欢迎大家批评指正。

2021-03-17 21:05:12 3238

原创 Pytorch学习——tensor的生成、构造、组织、计算、统计

PytorchPytorch 是 Python 接口语言、可以使用GPU加速、构造动态神经网络(更灵活)、python优先Tensor的生成tensor的常见生成方式和性质tensor = torch.Tensor([[2,3],[4,5],[6,7]]) #生成tensorE = torch.from_numpy #使用numpy生成tensortorch_e = torch.from_numpyprint(format(tensor)) #3*2print(tensor.reshape(

2021-03-13 16:05:29 966

原创 FSL——FDT数据统计处理TBSS

TBSSTBSS - Tract-Based Spatial Statistics使用磁共振扩散成像通过测量白质束中水的各向异性扩散来提供有关大脑中解剖学连接性的信息。 分数各向异性(FA)是最常从扩散数据中得出的量度之一,它可以量化局部区域结构的定向强度。 为了定位与发育,退化和疾病相关的大脑变化,许多影像学研究开始在三维像素统计分析中使用FA图像。 但是,使用标准配准算法会影响最佳分析。 对于如何以允许从后续体素分析得出有效结论的方式对齐来自多个对象的FA图像的问题,还没有令人满意的解决方案。 此外

2021-03-09 20:04:50 4261 2

原创 FSL中FDT的相关操作——数据转换、EDDY、DTIFIT、BEDPOSTX、Registration

脑纤维束数据处理与定量分析使用FSL对弥散成像数据进行处理,在FSL的官网上给出了指导,笔者参考官网的指导整理了处理数据的流程如下处理流程数据格式转换(需要手动完成)检查弥散数据(详细的过程在后面)使用topup进行磁化率引起的失真校正(场图估计)使用BET进行剥脑操作使用eddy进行涡流失真校正,同时校正涡流和对象运动,它还可以使用由充值估算的场图,并校正磁化率引起的失真(操作时间过长,单线程CPU可能需要数小时或是数天,多线程会减少时间,使用GPU加速会快很多)经过eddy之后,所有

2021-03-07 13:54:42 6770

原创 SQL学习——窗口函数

主要解决滑动窗口对于均值和加和的计算,以及多种排序技巧

2021-03-03 20:47:33 497 2

原创 SQL学习——集合运算

表的加减法在标准 SQL 中, 分别对检索结果使用 UNION, INTERSECT, EXCEPT 来将检索结果进行并,交和差运算图1.常见的集合运算表的加法–UNIONUNION的具体用法SELECT product_id, product_name FROM product UNIONSELECT product_id, product_name FROM product2;UNION 等集合运算符通常都会除去重复的记录.UNION 与 OR 谓词两种关系可以通过代码相

2021-03-01 16:13:57 489

原创 SQL学习——复杂查询方法

复杂查询方法视图定义视图是基于真实表的一张虚拟的表,其数据来源均建立在真实表的基础上。视图是一个虚拟的表,不同于直接操作数据表,视图是依据SELECT语句来创建的(会在下面具体介绍),操作视图时会根据创建视图的SELECT语句生成一张虚拟表,然后在这张虚拟表上做SQL操作视图与表的区别—“是否保存了实际的数据”。视图并不是数据库真实存储的数据表,它可以看作是一个窗口,通过这个窗口我们可以看到数据库表中真实存在的数据。优点通过定义视图可以将频繁使用的SELECT语句保存以提高效率。通过定义视

2021-02-27 18:03:29 608

原创 SQL学习——基础查询与排序

DMLDML(Data Manipulation Language,数据操纵语言) 用来查询或者变更表中的记录。DML 包含以下几种指令。SELECT :查询表中的数据INSERT :向表中插入新数据UPDATE :更新表中的数据DELETE :删除表中的数据SELECT选取一列SELECT <列名>, FROM <表名>;结合where语句使用SELECT <列名>, …… FROM <表名> WHERE <条件表达

2021-02-26 15:29:43 128

原创 SQL学习——初识数据库&数据定义语言

初始数据库DataBaseDataBase的种类层次数据库(Hierarchical Database,HDB)关系数据库(Relational Database,RDB)关系数据库管理系统(Relational Database Management System,RDBMS)最常见的系统结构就是客户端 / 服务器类型(C/S类型)这种结构DDLDDL(Data Definition Language,数据定义语言) 用来创建或者删除存储数据用的数据库以及数据库中的表等对象。DDL

2021-02-25 23:29:27 140

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