原标题:生物在线小工具汇总(请收藏)
转载自安诺基因公众号
一直在寻找生物在线工具的小伙伴们福利来啦,小编整理了多款在线小工具,小伙伴们赶紧收藏起来~~~
Promoter Scan
功能:启动子预测
网址:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan
ORF Finder
功能:ORF预测
网址:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
tRNAScan-SE
功能:tRNA预测
网址:
http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/
NCBI-BLAST
功能:序列比对
网址:
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
MUSCLE
功能:运行速度比较快的多序列比对
网址:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#
Clustal Omega
功能:DNA、RNA、蛋白的多序列比对
网址:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/
ClustalW2
功能:应用较广泛的多序列比对
网址:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/
T-Coffee
功能:准确度高,速度慢的多序列比对
网址:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/
SimiTriX-SimiTetra
功能:多序列比对相似性展示
网址:
http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php
Venn图
功能:绘制Venn图
网址1:
http://www.biovenn.nl/index.php
网址2:
http://bioinformatics.psb.ugent.be/cgi-bin/liste/Venn/calculate_venn.htpl
网址3:
http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
WEGO
功能:绘制GO注释结果图
网址:
http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl
CIRCOS
功能:绘制圈图
网址:
http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/
CIRCexplorer
功能:进行circRNA分析
网址:
http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/
iPath
功能:进行可视化通路图在线分析
网址:
http://pathways.embl.de/
Genome Scope
功能:进行基因组杂合度评估
网址:
http://qb.cshl.edu/genomescope/
UCSC
功能:进行基因组可视化
网址:
http://genome.ucsc.edu/index.html
IBS
功能:进行序列结构示意图绘制
网址:
http://ibs.biocuckoo.org/online.php
以上是小编汇总的生物在线工具,功能、网址都已备好,赶紧收藏,有了它再也不用愁找不到对应的小工具啦~