【转】生物在线小工具汇总

 

原标题：生物在线小工具汇总（请收藏）

转载自安诺基因公众号

一直在寻找生物在线工具的小伙伴们福利来啦，小编整理了多款在线小工具，小伙伴们赶紧收藏起来~~~

Promoter Scan

功能：启动子预测

网址：https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan

ORF Finder

功能：ORF预测

网址：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

tRNAScan-SE

功能：tRNA预测

网址：

http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/

NCBI-BLAST

功能：序列比对

网址：

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

MUSCLE

功能：运行速度比较快的多序列比对

网址：

http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#

Clustal Omega

功能：DNA、RNA、蛋白的多序列比对

网址：

http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/

ClustalW2

功能：应用较广泛的多序列比对

网址：

http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

T-Coffee

功能：准确度高,速度慢的多序列比对

网址：

http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/

SimiTriX-SimiTetra

功能：多序列比对相似性展示

网址：

http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php

Venn图

功能：绘制Venn图

网址1：

http://www.biovenn.nl/index.php

网址2：

http://bioinformatics.psb.ugent.be/cgi-bin/liste/Venn/calculate_venn.htpl

网址3：

http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

WEGO

功能：绘制GO注释结果图

网址：

http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl

CIRCOS

功能：绘制圈图

网址：

http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

CIRCexplorer

功能：进行circRNA分析

网址：

http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/

iPath

功能：进行可视化通路图在线分析

网址：

http://pathways.embl.de/

Genome Scope

功能：进行基因组杂合度评估

网址：

http://qb.cshl.edu/genomescope/

UCSC

功能：进行基因组可视化

网址：

http://genome.ucsc.edu/index.html

IBS

功能：进行序列结构示意图绘制

网址：

http://ibs.biocuckoo.org/online.php

以上是小编汇总的生物在线工具，功能、网址都已备好，赶紧收藏，有了它再也不用愁找不到对应的小工具啦~