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原创 linux和windows下python读取文件的路径的不同

在python开发中,我们时常需要利用python对文件进行一些打开,读取,关闭等操作。例如,在windows下,我们利用python中的vcf库对文件进行读取时,我们会这样写file_name = 'F:/vcfdata/CHROM_1_test.vcf'`vcf_reader = vcf.Reader(filename = file_name )这个时候,在windows场景下python可以通过这个路径来读取F盘中vcf data文件夹下的这个叫做CHROM_1_TEST.vcf的文件但

2021-03-03 23:18:29 1734 1

原创 关于vcf文件的读取

vcf文件是生物信息学对SNP和indel进行数据分析不可绕开的一种文件格式,但是作为一种不常见的文件格式,我们时常需要对编写代码来对其进行读取。class Record(object): ''' One line information in vcf file ''' def __init__(self, line): info = line.split("\t") self.line = line self.CHROM =

2021-01-18 15:54:34 3667 1

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