求助GO分析报错

最新推荐文章于 2024-03-05 12:54:18 发布

流觞oline

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文章标签： java javascript 服务器学习

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_47256318/article/details/129676164

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在使用Rstudio进行基因本体（GO）富集分析并尝试绘制柱状图和气泡图时，遇到了objectffi_standalone_check_number_1.0.7notfound的错误。该错误表明某个必需的包或函数可能未被正确加载或已更新导致不兼容。要解决这个问题，用户可能需要检查并更新相关依赖，或者重新安装引起问题的包。

摘要由CSDN通过智能技术生成

Rstudio GO分析
ego <- enrichGO(gene = DEG$ENTREZID,
                OrgDb = org.Hs.eg.db, 
                ont = "all",
                pAdjustMethod = "BH",
                minGSSize = 1,
                pvalueCutoff =0.05, 
                qvalueCutoff =0.05,
                readable = TRUE)

ego_res <- ego@result
save(ego,ego_res,file = "GO_FGL1_DEG.Rdata")

#3. 可视化
##3.1 柱状图
barplot(ego, showCategory = 20,color = "pvalue")
##3.2 气泡图
dotplot(ego, showCategory = 20)



在跑这一步画图的时候会出现这个东西————————————————————————————————————————————


> barplot(ego, showCategory = 20,color = "pvalue")
Error in .standalone_types_check_dot_call(ffi_standalone_check_number_1.0.7,  : 
  object 'ffi_standalone_check_number_1.0.7' not found

这个昨天还好用来。

现在该怎么解决啊，求大神指教