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RSS订阅原创 SingleR包更新与安装方法总结！！！
摘要：本文记录了R语言SingleR包安装过程中的报错及解决方法。用户在使用过程中发现版本问题，尝试通过BiocManager指定版本（3.20）安装时出现编译错误。最终采用二进制安装方式成功更新：BiocManager::install("SingleR",type="binary",version="3.20",force=TRUE)。文章总结了三种安装方法：（1）GitHub源码安装；（2）BiocManager二进制安装；（3）本地二进制安
2025-07-21 17:32:50
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原创 SingleR包本地安装——解决报错版
摘要：本文记录了在R中安装SingleR包时遇到的编译错误及解决过程。主要问题包括依赖包rhdf5filters、sparseMatrixStats等编译失败，提示g++工具链缺失。通过配置环境变量、尝试二进制安装（BiocManager::install(type="binary")）以及逐个安装缺失依赖包，最终成功完成SingleR的本地安装。虽然具体解决步骤不明确，但通过组合方案解决了多级依赖包的安装问题。
2025-07-21 17:02:33
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原创 R语言数据预处理——重复基因处理。
( gene_name )的情况，而在转换时经常会出现多个ensembl_id对应与一个gene symbol的情形，此时就出现了重复的gene symbol。重复的gene symbol当然是不能作为基因表达矩阵行名的，此时就需要我们去除重复的gene symbol。2.按重复基因表达值中位数去重——aggregate函数。4.按重复基因表达值最大值去重——aggregate函数。3.按重复基因表达值均值去重——aggregate函数。为便于验证，先随便造一个基因名有重复的表达谱数据。
2025-05-21 14:19:32
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原创 错误: 函数‘gsva’标签‘param = “matrix“’找不到继承方法
【代码】错误: 函数‘gsva’标签‘param = “matrix“’找不到继承方法。
2025-05-20 21:05:30
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空空如也
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