步骤
1. 基因扩增
hit-up
hit
hit-down
2. 重组质粒构建
双酶切:
hit-up片段、pFW5质粒双酶切,37度6h,酶切产物进行DNA回收纯化,测DNA浓度
T4 DNA ligase连接:
pFW5质粒 + hit-up ——— 连接 ——— 转入DH5a spe100ug/ml ——— 挑单菌落 (#20: pFW5-hit up)
同样方法:将hit-down转入pFW5-hit up质粒,构建hit基因缺陷重组质粒(#141: pFW5-hit up-hit down)
在pFW5 载体的两个多克隆位点区(MCS⁃I 和 MCS⁃II) 前后,设计了pFW5(PCR)两对引物(pFW5⁃F/pFW5⁃ R1 和 pFW5⁃F1/pFW5⁃R),对 20#、141#及对照空质粒 pFW5 进行 PCR 扩增双酶切鉴定,挑选出正确大小的质粒送检测序。测序结果在 NCBI 上进行Blast对比拼接。
3. 变异链球菌hit基因缺陷菌株的构建
选取变异链球菌 ATCC25175 标准株单克隆菌斑接种入 BHI 液体培养基,培养至对数生长中期,
抽取 100 μL 菌液接种至 2 mL BHI 液体培养基,继续培养 2 h,取 300 μL 上述菌液加入 2.4 μL 浓度为1 mg/mL 的感受态刺激肽 CSP 溶液,轻轻混匀,孵 育0.5 h。
将单酶切线性化纯化后的 hit⁃Up⁃pFW5⁃Down质粒 4 μg 加入到上述菌液中,轻轻摇晃培养 3 h 后将菌液涂布于 Spe(+ 0.1 mg/mL)抗性的 BHI 培养板培养 48 h。选取阳性单克隆菌斑,用 CTAB 法提取基因组,送检测序。
4. 变异链球菌hit基因缺陷菌株遗传稳定性
将构建成功的变异链球菌 hit 基因缺陷菌株提高壮观霉素质量分数(1 mg/mL)后多次传代,提取
基因组DNA,再次送检测序
5. 变异链球菌hit基因缺陷菌株生长曲线测定
①甘油菌种经BHI 固体培养基划线活化后,挑选单克隆菌斑接种于BHI液体培养基,厌氧培养约
20 h;取部分种子菌液,用无抗 BHI 培养基稀释到0.5 麦氏比浊浓度,然后稀释 100 倍为工作菌液[(1~2)×106 CFU/mL]。
② 取 96 孔细胞培养板,其中每孔加入 180 μL 无抗 BHI 培养基和 20 μL 工作菌液,厌氧培养,监测其在 48 h 内 OD600 值变化。设置三组平行实验,变异链球菌 ATCC25175
标准株进行生长对照。生长速率计算方法:生长速率=[(OD600)t⁃(OD600)0]/t。