botorch是一个基于PyTorch的贝叶斯优化库,它提供了一个灵活的模型抽象层,可以用来表示不同的概率模型。
在botorch中,model.posterior是一个方法,它接受一组设计点作为输入,返回一个Posterior对象,表示模型输出在这些设计点上的后验概率分布。
后验概率分布可以是显式的或隐式的,只要它能够通过rsample方法生成样本。例如,后验概率分布可以是一个多元正态分布,也可以是一个通过神经网络映射的基础分布。
使用model.posterior的步骤如下:
1. 创建一个Model对象,可以是botorch提供的预定义模型,如SingleTaskGP、FixedNoiseGP等,也可以是自定义的模型,只要它实现了Model接口。
2. 用一组训练数据(输入和输出)拟合Model对象,可以使用botorch.fit.fit_gpytorch_model或自定义的优化方法。
3. 用一组测试数据(输入)调用model.posterior方法,得到一个Posterior对象。
4. 用Posterior对象的方法,如mean、variance、rsample等,获取后验概率分布的属性或生成样本。
下面是一个简单的示例:
import torch
from botorch.models import SingleTaskGP
from botorch.fit import fit_gpytorch_model
from gpytorch.mlls import ExactMarginalLogLikelihood
# 定义训练数据,假设观测到了一个正弦函数
train_X = torch.linspace(0, 1, 10).view(-1, 1)
train_Y = torch.sin(train_X * (2 * math.pi))
# 创建并拟合一个单任务高斯过程模型
model = SingleTaskGP(train_X, train_Y)
mll = ExactMarginalLogLikelihood(model.likelihood, model)
fit_gpytorch_model(mll)
# 定义测试数据
test_X = torch.linspace(0, 1, 50).view(-1, 1)
# 调用model.posterior方法,得到一个Posterior对象
posterior = model.posterior(test_X)
# 获取后验均值和方差
post_mean = posterior.mean
post_var = posterior.variance