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RSS订阅原创 cellranger安装以及使用
接受cellranger count的输出数据，将同一组的不同测序样本的表达矩阵整合在一起，比如tumor组原来有4个样本，PBMC组有两个样本，现在可以使用aggr生成最后的tumor和PBMC两个矩阵，并且进行标准化去掉测序深度的影响。但是由于病毒基因组太小了，且注释结果只有CDS没有exon，所以曲线救国，将CDS整体替换为exon，也不进行过滤了，直接下一步。虽然安装完毕，但是现在要运行cellranger的话需要在终端输入cellranger的整个路径。自动执行这个命令，需要将“
2024-04-24 16:16:09
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原创 FindConservedMarkers报错Error in h(simpleError(msg, call)) : error in evaluating the argument ‘x‘ i
前期更新了seurat包至v5，是不兼容的，需要用回4.x 的版本才行，需要指定包版本。试图再安装一个V4版本，但不知道为什么library不能指定加载位置。
2024-04-22 20:54:16
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1
空空如也
空空如也
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