2024年VASP6(2),2024年最新Linux运维小程序开发实例

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三、安装资源包

1、安装依赖:

打开终端,执行命令:

sudo apt update
sudo apt upgrade
sudo apt install build-essential
sudo apt install gfortran

2、安装Base_Toolkit:

在终端打开终端,执行命令:

sh l_BaseKit_p_2023.2.0.49397.sh 

会自动打开安装界面,如下:

勾选协议,点击customise自定义:

为了节约安装空间我们只勾选Math Kernel Library:

继续安装:

继续点击安装按钮:

进入安装界面:

安装完成:3、安装HPC_Kit

执行代码:

sh ./l_HPCKit_p_2023.2.0.49440.sh

开始安装,同意协议,点击自定义:

仅安装后面三个库:

重复以上步骤,继续安装:

安装完成点击finish

安装完成后进行测试,是否安装成功。

安装完成后/home目录下会出现一个Intel文件夹,进入intel/openapi打开终端,执行命令:

source ./setvars.sh

注:每次调用intel驱动都需要使用此命令,结果如下:

4、安装vasp

将文件传输到虚拟机后,我是将vasp6.3.2安装文件放在vasp文件夹下的,在vasp目录下打开终端执行解压命令:

tar -zxvf vasp.6.3.2.tgz

在解压后进入vasp6.3.2文件夹,打开终端执行:

cp arch/makefile.include.intel makefile.include

执行gedit命令对makefile.include文件进行编辑:

删除MKLROOT=后面的值,因为intel声明环境变量的时候就已经声明位置了,修改后图如下,保存退出。

在已安装的Intel目录下打开终端,执行指令。也可以手动进入该目录:intel/oneapi/mkl/2023.2.0/interfaces/fftw3xf

cd oneapi/mkl/2023.2.0/interfaces/fftw3xf

使用source命令激活源,这里是我自己的路径,需要对照自己的路径进行修改(也就是intel/oneapi/setvars.sh文件),可以直接进入openmpi目录下右键setvars.sh文件拷贝文件地址:

sudo source /home/yao/intel/oneapi/setvars.sh

在fftw3xf目录下执行命令:

make libintel64

开始安装vasp,大概需要一个小时:

等待make完成即完成安装。

四、测试vasp

将我之前分享的文件vasp-test.tar.bz2复制到虚拟机,执行解压命令:

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