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原创计算医学图像Dice相似系数

要注意DSC空列表和DSC函数重名，会报错，TypeError: 'list' object is not callable，要给空列表修改一个名字。使用Dice公式，批量计算dice系数。

2024-07-10 15:16:09 391

原创医学图像nii格式文件和pkl文件互相转化

img_data, affine = pickle.load(f) # 同时加载图像数据和affine矩阵。nii文件转pkl，根据以下代码可以完成。pkl转为nii格式，报错。请问这个该如何解决啊？

2024-07-08 20:56:59 265

大于可成对图像的数量（即100 > 12），那么在每个epoch中，一些图像对将会被重复使用多次。具体来说，每个epoch将会进行100次迭代，但由于只有12对图像，所以每对图像会被使用 10012≈8.3312100≈8.33 次，这意味着在某些迭代中，同一对图像可能会被使用两次。train_set如果有24张图像，每次都是输入成对的图像，可以组成12对，各自作为fixed和moving。原来是因为在本地运行时，数据集填的是绝对路径，上传到服务器之后就找不到这个路径了，所以我修改为相对路径。

2024-07-05 15:20:33 786

原创 ViT-V-Net配准网络代码

网络框架如上图所示，Transformer 模块的网络结构如下图所示。在开源代码models.py中，展示了网络的pytorch实践。一共包括四部分。Transformer，DecoderCup，RegistrationHead和SpatialTransformer。分别对应于实际网络架构的【CNN编码器和Transformer编码器】，【整个解码过程】，【生成flow的连接部分的卷积】，【空间变换网络】。

2024-07-04 11:45:12 227