Rstan下载安装攻略

官方网址：

1) https://mc-stan.org/users/interfaces/（Stan首页）

2) https://github.com/stan-dev/rstan/wiki/RStan-Getting-Started（界面如下：可以按照安装步骤一步一步进行）

步骤一：下Rtools（Win系统）：

Rtools用于编译C++文件。

下载链接：

https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/rtools43/rtools.html（可能需要连外网才能进去，没试WiFi因为很慢）

或者参考知乎，使用清华镜像网址进行下载：（知乎链接）https://zhuanlan.zhihu.com/p/346947595（清华下载链接）https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/Rtools/

下载完毕需要安装，会提示文件不安全，忽略。安装时，与R GUI安装在一个磁盘（可能也不一定，但尝试与Rstudio安装在同一磁盘时，Rstudio显示我并没下载Rtools。最好是三者都放一起，我是因为内存不够了才分开）。我的R GUI版本是4.3.1，所以我安装了rtools43。

安装好后在Rstudio输入

install.packages("jsonlite", type = "source")

检查是否安装成功。如果输出很多内容并且没有报错，也没有显示没安装rtools，即表示成功！（这一步如果显示Rtools不存在，可以尝试重启电脑，再验证是否安装成功。）

 （成功的界面）

步骤二：下Rstan：

Rstan用于统计建模。

如果之前没下过，在Rstudio输入

install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies = TRUE)

这一行代码，运行。否则，先输入

remove.packages("rstan")

if(file.exists(".RData")) file.remove(".RData")

将原来版本删除。

我在这一环节出现好多问题：

1是报错，并提示尝试删除D:\R-4.3.1\library\00LOCK文件。这里需要找到该文件，并手动删除。

2是rstan的依赖包都能下载成功，唯独rstan下载不了，显示下载了又移除了，然后存在不该存在的一个临时文件夹中。这一问题的出现，直接让我卸载掉了Rstudio，又重新安装了一个，不过这次安装在另一个磁盘，因为原来的内存不多了。用新下的Rstudio重新运行这一行代码，rstan是安装成功了，rtools又显示没安装！！！于是删掉原来的rtools，按原步骤重来了一次。这次都能成功了。

3我一开始输入的是官网给出的

Sys.setenv(DOWNLOAD_STATIC_LIBV8 = 1) # only necessary for Linux without the nodejs library / headers

 

 

install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies = TRUE)

这两行代码，后来发现第一行没太有必要，反而可能出现问题？（不是特别确定。总之可以多尝试。）

步骤三：验证Rstan安装成功：

输入

example(stan_model, package = "rstan", run.dontrun = TRUE)

结果出现R Session Aborted的问题，如图：

无奈之下，把R GUI和Rtools又卸载掉，重新下回，并与Rsudio安装在同一磁盘。重新验证Rtools是否安装成功，又显示Rtools不存在。准备把Rtools删掉，重新下载（胡乱猜测是安装顺序的问题），但是卸载时显示Rtools被占用，但我已经把该关的都关了。无奈重启电脑。然后继续删，继续下。再验证，还不行，然后重启电脑，再验证，居然又行了？！（所以猜测安好Rtools后要重启电脑。）之后开始验证rstan。好在，终于成功了！！！（开始不行时或许是有包冲突或版本不合适的问题，所以重下R GUI，之前有的包就没有了。）

 （连发三图，分享喜悦）

总结：

处理bug心得总结：

1) 安装完Rtools之后重启电脑，再检验其是否安装成功。如果不行，尝试下面的2和3，再进行该步骤。

2) 把R GUI、Rstudio、Rtools放在同一磁盘下。

3) 按R GUI→Rstudio→Rtools顺序下载并安装。

科研心得体会：

上述操作从上午十点左右一直进行到下午四点半，最后rstan加载成功，忍不住感叹一句谢天谢地，不过心里还是默默对自己的姻缘进行了诅咒，希望不要灵验（笑哭）。像今天这样的经历，应该是每个科研人都会经历的了——废寝忘食琢磨将一个小问题克服！然后品尝自己解决Bug之后成功带来的短暂喜悦，之后忍不住记录并分享这段经历与感受。最后，希望每一位科研人都能顺利解决想要解决的霸哥！！！