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原创 记录:在恒源云服务器上进行的,使用nnUNetv2做食管癌淋巴结分割任务

训练时也有可能造成内存或cpu爆炸,可以在nnUNet_preprocessed/nnUNet_xxx(这里的xxx为2d or 3d_fullres or 3d_lowres)中imagesTr中的.npy文件,无脑删除就行.export nnUNet_n_proc_DA="num"(num可以选择2 or 4 or 6 or 8,数字越小处理越慢,数字越大内存爆的风险越大)2d\3d_fullres\对于部分数据集来说还有3d_lowres, 3d_cascade_fullres。

2024-08-30 21:34:28 1563

原创 torch.cuda.OutOfMemoryError: CUDA out of memory.

3.修改代码,把一些没那么重要的任务交给cpu去做。需要修改代码中的.to(device)和.cuda(),把他们.cpu()去吧,注意要把需要放在一起处理的数据放在同意设备上(cpu或cuda)。2.显存占用大的任务一般都是处理图像数据。将图像降采样试试,可以试试将图像尺寸调整到(128,128,128)或者更小,如果是深度学习的话记得调整模型的输入通道。1.把batch调小一点,可以直接尝试将batch调到2。5.换张显存大的显卡吧,别为难你的小显卡了。4.租个服务器,把任务放到服务器上面跑。

2024-08-30 21:31:51 2355 1

原创 .seg.nrrd2nii.gz

说明:123123.seg.nrrd----->123123.nii.gz。需要修改输入input_path和输出路径output_path。该代码会保留文件的原名称。

2024-08-30 21:11:11 259

原创 .nii.gz数据平均池化缩放,降低图像内存占用

【代码】.nii.gz文件平均池化缩放。

2024-08-30 21:09:36 417

原创 关于一些激活函数的效果以及对输出的影响。

非线性且计算简单,能有效减轻梯度小时问题,但在训练中可能会遇到“死亡ReLU”问题,即神经元一直输出0,梯度也为0。输出范围在(0,1)之间,可以解释为概率,梯度在0和1附近会变得非常小,容易导致梯度消失问题。在深层网络中可能导致训练变得困难,容易导致梯度消失问题!类似ReLU,但允许负值输出(使用小的斜率代替0)。适合深度网络,提供了一种避免梯度消失问题的解决方案。输出一个概率分布,适用于多方呢类任务的输出层。输出值在(0,1)之间,且所有输出值的和为1。中心化,输出以0为中心,能改善梯度消失问题。

2024-08-30 21:06:24 383

原创 嵌套扁平化

`````

2024-08-30 21:04:14 563

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