使用conda安装生信软件Trinity一直不成功,如何解决?

安装生信软件Trinity

使用conda创建一个新环境

conda create -n Trinity

conda activate Trinity

安装Trinity运行需要的依赖软件

conda install jellyfish bowtie2 salmon samtools

下载Trinity软件包

wget -c https://github.com/trinityrnaseq/trinityrnaseq/releases/download/Trinity-v2.15.1/trinityrnaseq-v2.15.1.FULL_with_extendedTestData.tar.gz

tar -zxvf trinityrnaseq-v2.15.1.FULL_with_extendedTestData.tar.gz

cd trinityrnaseq-v2.15.1

make

测试运行是否成功

cd ./sample_data/test_Trinity_Assembly

vim ~/.bashrc

export TRINITY_HOME=具体位置/trinityrnaseq-v2.15.1

source ~/.bashrc

bash runMe.sh

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