数学建模助力干细胞研究，配体纳米簇如何影响干细胞命运_- 《基于细胞自动机的神经干细胞增殖与分化的数学建模-CSDN博客

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大家好！今天来了解一篇关于对干细胞行为的可逆调控的研究——《Modularity-based mathematical modeling of ligand inter-nanocluster connectivity for unraveling reversible stem cell regulation》发表于《Nature Communications》。这项研究利用图论对细胞外基质（ECM）模拟配体簇间连接性进行数学建模，通过调节磁性纳米阻滞剂的各向异性和远程循环提升，实现对干细胞行为的可逆调控，为组织再生中细胞-材料相互作用的动态调控提供了新途径。

*本文只做阅读笔记分享*

一、研究背景

1、细胞外基质（ECM）的重要性及相关研究现状

ECM的重塑对细胞行为的调控具有关键意义，例如骨骨折时需要通过调节干细胞的机械转导和分化来重建组织结构，肌腱中的纤维状胶原网络不断连接和断开以调节生理机械功能和病理过程。然而，目前由于缺乏对其复杂动态结构的设计和建模，尚未能实现对ECM调节细胞行为的有效调控及深入理解。在大脑组织中，虽然尝试了对网络互连性进行映射，但没有对其结构进行主动调节或建模。

2、图论在研究中的应用潜力

图论可用于计算由互连构建块组成的材料的复杂纳米结构以及各种细胞类型的互连网络，例如Louvain算法可通过最大化模块性来确定簇的最优划分，从而有助于量化网络中簇的互连性。这为研究材料簇间连接性对细胞行为的影响提供了理论基础和分析工具。

3、配体配置研究及现有研究的不足

近年来，研究人员开发了具有不同配体配置的材料，并探索了配体密度、间距、微图案化、多价性和聚类等参数对细胞行为的影响。例如，已发现纤维状配体之间的桥接、整合素结合配体（如精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸，RGD）以及配体的形状和模式等因素均可调节细胞行为。但是，此前的研究无法调节配体的连接性，并且在动态建模以及分析配体阻断对调节配体互连性方面存在不足。