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原创 基于多组学集成的癌症亚型分类

随着高通量测序技术的快速发展,许多大型基因组学测序项目逐渐完善,例如癌症基因组图谱,国际癌症基因组联合会,主要提供基因组学数据和临床数据,海量多类型数据的快速积累,为了解癌症机制的形成和发展提供了机遇。针对不同类型的癌症多组学数据,找到在癌症发生、发展和转移过程中具有显著作用的驱动突变,对这些驱动突变进行实验分析,了解其对生物信号通路或者生物学过程产生的影响具有重要意义。传统的通过统计方法识别出有着高突变率的基因,现在针对癌症数据高异质性和其他因素造成的影响对传统方法进行改进。

2023-02-11 22:36:00 927

原创 Matlab绘图

一、二维绘图1.基本绘图命令plot(x,y)fplot绘制一元函数ezplot符号函数subplot 分割窗口polarplot极坐标yyaxis 创建具有两个y轴的图形figure创建图形窗口set设定图形窗口的属性get查询属性close关闭图形窗口clf清空图形窗口clf('reset')除了清楚窗口外,将该图形除了Position,units,PaperPosition和PaperUnits外的所有属性重置为默认二、三维绘图1.基本绘图

2023-02-06 16:19:24 178

原创 matlab符号运算

符号运算相较于数值运算精度更高。两者可以相互互换,调用eval(符号表达式)或者sym(数值表达式)。在精度设置上,符号表达式和数值表达式分别使用函数digits和函数vpa来进行精度设置:创建符号变量syms a b c f

2023-02-05 20:31:31 187

原创 MATLAB矩阵运算

1.矩阵元素修改补充 :C=[A B],同行;C=[A;B],同列;删除:A(m,:)=[],m行; A(:,n)=[],n列2.矩阵变维reshape(X,m,n):将已知矩阵变维成m行n列的矩阵。3.矩阵变向4.矩阵抽取5.常用函数6.奇异值分解(SVD)svd分解指的是将m×n矩阵A表示为3个矩阵乘积形式:USVᵀ

2023-02-05 19:48:22 235

原创 MATLAB矩阵

一、矩阵创建直接按行输入法创建数值矩阵,按此方法创建时,应注意以下几点:1.输入矩阵时要以[]为标识符号;2.同行元素由空格或逗号隔开,行与行之间用分号和回车分隔;3.矩阵大小不需要预先定义;4.矩阵元素可以是运算表达式;除了按行输入法之外,还可以利用M文件生成法和文本文件生成法等。1.利用M文件创建M文件是一种在matlab下可运行的文本文件,分为命令式和函数式。在此处为命令式,在matlab命令行窗口输入M文件名,所要输入的大型矩阵即可被输入到内存里。2.利用文本文件

2023-02-05 19:20:37 1687

原创 MATLAB中的特殊变量

matlab中的特殊变量包括单元型变量和结构型变量。特点是允许用户将不同但是相关的数据类型集成一个单一的变量。1、单元型变量的创建(1)赋值语句直接定义定义时使用{},中间用逗号隔开;(2)对单元元素逐个赋值cell(N)生成一个n×n阶置空的单元数组;cell(M,N)或者cell([M,N])生成一个m×n阶置空单元数组;cell(M,N,P...)类似于前者;cell(size(A))生成和A同形式的单元型置空矩阵。2、结构型变量函数struct创建,调用

2023-02-04 18:13:04 841

原创 MATLAB多项式创建和四则运算

一、向量点积运算dot(a,b)返回向量a和b的点积。a,b必须同维;dot(a,b,dim)返回向量a和b在dim维的点积。二、向量叉积运算cross(a,b)返回向量a和b的叉积。需要说明的是,a和b必须是3维的向量;cross(a,b,dim)返回向量a和b在dim维的叉积。a和b必须同维数,size(a,dim)和size(b,dim)的结果必须为3。三、多项式构建直接输入法poly2sym(p),p为系数向量。四、多项式四则运算四则运算为系数四则运算,向量大

2023-02-04 15:38:48 459

原创 MATLAB函数计算和向量生成计算

除了简单四则函数外,matlab还包含复数运算、三角运算和指数运算等运算。matlab提供的复数函数包括以下9种:Abs:模Angle:复数相角Complex:构造复数Conj:复数共轭Imag:复数虚部real:复数实部unwrap:调整矩阵元素相位isreal:是否为实数矩阵cplxpair:把复数矩阵排列成复共轭对向量创建:(1)冒号法:x=下限:增量:上限,当不写增量时默认增量为1(2)直接构造:x=[1 2 3];(3)利用函数

2023-02-02 12:58:31 454

原创 MATLAB数据类型

matlab中数据存储和计算均以双精度(64位八字节来存储一个浮点数)进行。默认情况下,整数以整数表示,实数以保留小数点后4位精度近似表示。format调用格式:format short 5位定点表示 format long 15位定点表示format short e 5位浮点表示format long e 15位浮点表示format short g 在5位定点和5位浮点中选择最好的格式表示,matlab自动选择format long g 在15位定点和15位浮点中选择最

2023-02-01 15:03:35 1339

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