生信用R包存档

1. flowCore

flowCore 是 Bioconductor 中的一个 R 包,用于处理流式细胞术(Flow Cytometry)和质谱流式细胞术(CyTOF)的 .fcs 数据。它提供了数据导入、转换、过滤、gating(分选)、聚类和可视化功能。

功能作用示例代码
读取 .fcs 文件加载流式细胞数据read.FCS("data.fcs")
提取细胞信息获取流式数据矩阵exprs(fcs_data)
转换数据对数变换、归一化logTransform(fcs_data)
Gating(门控分析)选定感兴趣的细胞群rectangleGate()
可视化绘制流式细胞图表plot(fcs_data)

https://github.com/RGLab/flowCore

2. CytoNorm

用来标准化细胞术数据。

https://github.com/saeyslab/CytoNorm

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