20、有机染料和可见荧光蛋白作为荧光报告物

有机染料和可见荧光蛋白作为荧光报告物

1. 有机染料概述

在荧光传感和成像技术中,有机染料是最常用的荧光团。它们不仅易于获取且价格低廉,更重要的是具有广泛的应用灵活性。与其他荧光发射体相比,有机染料的响应方式更为丰富,包括各向异性的可检测变化以及激发和发射光谱的显著位移。这些染料还能发生基态和激发态反应,产生新的发射带,从而实现方便且灵敏的λ比率检测。

过去,有机染料合成领域受彩色摄影和染料激光技术的需求推动。随着电子数码摄影和固态激光器的发展,这些领域逐渐失去了吸引力,而分子探针和传感器技术成为了有机染料的主要应用领域。新合成的染料数量呈指数级增长,因此我们将重点关注其对传感应用至关重要的一般特性,并介绍几类常用的染料。

有机染料可分为用于标记和用于报告两类。此外,还有在特定应用领域效率极高的染料,如磷光、双光子、光开关和近红外发射染料。下面将简要介绍活细胞内荧光蛋白中自发形成的有机荧光团及其合成类似物。

2. 荧光有机分子及其特性

2.1 有机染料的一般特性

荧光合成有机产品数量众多,研究人员可以根据光谱特性和化学反应性轻松选择合适的染料。早在20世纪90年代,研究人员就对当时存在的各种荧光染料进行了系统记录,为传感和成像领域的发展奠定了坚实基础。在同一荧光团家族中,合成了多种类似物。通过电子供体和电子受体取代,可以调节光谱特性,并赋予它们不同的特异性和共价标记反应性。

有机染料通常尺寸小于1nm,其特点是存在形成离散能态的离域π电子。光量子的吸收和发射是这些能态之间的电子跃迁。它们的吸收和发射波长涵盖整个可见光范围并延伸至近红外。π电子数量的增加和分子片段之间电子共轭的增强通常会使荧光光

复杂几何的多球近似MATLAB类及多球模型的比较 MATLAB类Approxi提供了一个框架,用于使用具有迭代缩放的聚集球体模型来近似解剖体积模型,以适应目标体积模型比较。专为骨科、生力学计算几何应用而开发。 MATLAB class for multi-sphere approximation of complex geometries and comparison of multi-sphere models 主要特点: 球体模型生成 1.多球体模型生成:与Sihaeri的聚集球体算法的接口 2.音量缩放 基于体素的球体模型参考几何体的交集。 迭代缩放球体模型以匹配目标体积。 3.模型比较:不同模型体素占用率的频率分析(多个评分指标) 4.几何分析:原始曲面模型球体模型之间的顶点到最近邻距离映射(带颜色编码结果)。 如何使用: 1.代码结构:Approxi类可以集成到相应的主脚本中。代码的关键部分被提取到单独的函数中以供重用。 2.导入:将STL(或网格)导入MATLAB,并确保所需的函数,如DEM clusteredSphere(populateSpheres)inpolyhedron,已添加到MATLAB路径中 3.生成多球体模型:使用DEM clusteredSphere方法从输入网格创建多球体模型 4.运行体积交点:计算多球体模型参考几何体之间的基于体素的交点,并调整多球体模型以匹配目标体积 5.比较可视化模型:比较多个多球体模型的体素频率,并计算多球体模型与原始表面模型之间的距离,以进行2D/3D可视化 使用案例: 骨科力学体积建模 复杂结构的多球模型形状近似 基于体素拟合度量的模型选择 基于距离的患者特定几何形状近似值分析 优点: 复杂几何的多球体模型 可扩展模型(基于体素)-自动调整到目标体积 可视化就绪输出(距离图)
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