本文将介绍如何使用LSL(Lab Streaming Layer)库从实时生物电信号(EEG)流中读取数据,并将其保存为EDF(European Data Format)格式。通过这种方法,我们可以方便地记录和分析EEG数据,为脑机接口研究和其他相关领域提供有力支持。
-
LSL简介: LSL是一个用于实时数据传输和接收的开源库,广泛应用于神经科学和生物医学领域。它提供了一个标准化的接口,使得不同设备和软件之间可以实现数据的无缝交流。在本文中,我们将使用LSL来接收实时的EEG数据流。
-
准备工作: 在开始之前,您需要进行以下准备工作:
- 连接EEG设备:将EEG设备与计算机连接,并确保其正常工作。
- 安装必要的依赖项:确保您的计算机上已安装所需的Python依赖项,包括numpy和pyedflib、pylsl。
接下来,我们将编写Python代码来实现从LSL流中读取EEG数据并保存为EDF格式。以下是一段示例代码:
import time
import numpy as np
from pyedflib import highlevel
from pylsl import resolve_byprop, StreamInlet
save_time_interval = 30
def sampling_data():
global running, data
start_time = time.time()
while time.time() - start_time < save_time_interval:
try:
print(time.time())
sample, timestamp = stream_inlet.pull_sample()
print(sample)
for i, d in enumerate(sample):
data[i].append(d * 1e6)
except Exception as e:
print(e)
stream_inlet.close_stream()
if __name__ == '__main__':
running = True
# ch_names = [str(_) for _ in list(range(64))]
ch_names = ['Fp1', 'Fp2', 'F3', 'F4', 'C3', 'C4', 'P3', 'P4']
streams = resolve_byprop("type", "EEG", timeout=1)
if streams:
print(streams)
stream_inlet = StreamInlet(streams[0])
save_path = "./test.edf"
data = [[] for _ in ch_names]
sampling_data()
signal_headers = highlevel.make_signal_headers(ch_names, dimension='uV', sample_frequency=500,
physical_min=-250000, physical_max=250000)
header = highlevel.make_header(patientname="", gender="")
highlevel.write_edf(save_path, np.array(data), signal_headers, header)
print("保存edf文件结束:{}".format(save_path))
else:
print("未找到lsl流")