windows下如何解决PHP调用的外部程序超时阻塞问题

我近期做一个东东，大致构架是：
访问者通过web提交c程序，服务端调用编译器编译并且在编译完成后运行编译后的程序，将运行结果传回访问者浏览器。
且不考虑安全性，因为访问者可以都认为是可以信赖的，命令行编译器最终要返回的，但是对于临时编译的程序，尽管用户是可以信赖的，但是不排除因为不完善而出现死锁，php调用后启动的进程无法返回而超时，此进程一直存在直到服务器重启，久而久之，服务器端资源就要耗尽。

考虑到php本身执行的时候没有提供多线程和进程管理功能（可能是我没有看到这方面的资料），使用不管是exec，还是popen等，主程序一旦阻塞就无法自拔，所以必须预留一个线程在必要时管理启动的进程.而我又不想对服务器配置做改动。于是想到自己写一个程序管理启动的进程，php间接通过这个程序调用编译后的客户程序,实现对客户程序超时的控制。
下面是测试用的php程序。
<?
//filename: test1.php
$cmd="test.exe 24 154";// input you command here

$cmd="process.exe 5000 ".$cmd;
$descriptorspec = array(
   0 => array("pipe", "r"),  // stdin is a pipe that the child will read from
   1 => array("pipe", "w"),  // stdout is a pipe that the child will write to
   2 => array("file", "erro