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RSS订阅原创 GEO上无法下载gpl文件 如何改symbol
#由于前面获得了一个标准的表达矩阵expr4 下面就开始分析注：行名为基因名，列名为样本名则为标准的表达矩阵
2021-12-08 20:54:19
10038
3
原创 GEO探针转换为symbol
用首先下载GEO数据 有的下载会有几个对象 有的就只有一个 但是不影响 因为GSE就是数据的集合，这几个不同的对象只是测序平台不同而已 这里选择第二个对象gset = getGEO('GSE12417', destdir=".",getGPL = F)e2=gset[[2]] #取下载geo数据list中的第一个对象 可以看见它测序用哪一个GPL平台 #也可以取其他的对象，反正记住对应的测序GPL平台expr=e2@assayData[["exprs"]] #
2021-12-08 14:08:48
5177
空空如也
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