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原创 基于python的非加权分组平均法构造简单系统发生树(DNA)

基于python的非加权分组平均法构造简单系统发生树(DNA)能实现什么一、实现步骤1.算法思想描述2.代码实现过程二、使用步骤1.引入库2.读入数据总结 能实现什么 1.完成用户自定义输入DNA序列个数及序列中碱基排列 2.根据用户输入的序列构造系统发生树,该树结构存储于列表中 3.使用matplotlib将树结构可视化 一、实现步骤 1.算法思想描述 找出所有序列中距离(这里的距离是由两序列中碱基不同的个数决定的,有多少个不同的碱基距离就为多少)最小的两条合并成为一个新的节点,重新计算其与其他序列的.

2020-10-12 09:55:25 985 1

原创 基于python的全局与局部序列比对的实现(DNA)

提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档 全局与局部序列比对的实现(DNA)程序能实现什么一、实现步骤1.用户输入步骤2.代码实现步骤二、实验结果截图1.全局比对2.局部比对总结 程序能实现什么 a.完成gap值的自定义输入以及两条需比对序列的输入 b.完成得分矩阵的计算及输出 c.输出序列比对结果 d.使用matplotlib对得分矩阵路径的绘制 一、实现步骤 1.用户输入步骤 a.输入自定义的gap值 b.输入需要比对的碱基序列1(A,T,C,G)换行表示输入完成 b.输入

2020-10-05 13:29:44 5247 11

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