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RSS订阅原创 R语言| 中介效应分析，Mediation包和BruceR包，循环Process函数
目录Brief summary中介效应的检验分析方法Mediation包Brief summary网上关于中介效应的资料挺多的，这里就不对原理进行过多解释。简单来说，我们分析自变量 X 对因变量 Y 产生的影响，如果变量 X 通过影响变量 M 来影响变量 Y ，那么这个变量 M 就是中介变量。例如租客 (X) 通过中介公司 (M) 找到合适的房子 (Y)，中介公司就在其中扮演了中介变量的角色，中介变量发挥的作用就称为中介效应了。对于该分析我个人有一个认知，就是X和Y必须有关联。这个关联可以是数
2022-04-24 16:15:16
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原创 Microsoft365 PowerPoint找不到设计灵感design ideas、历史版本记录、自动保存不见了
这次没写R语言的东西hhh。这篇文是我刚刚遇到的问题，其实比较少见或者小白，但还是想分享一下in case也有遇到同样问题的朋友。虽然上学的时候学校提供的免费office；上班的时候有公司提供的免费office，但我的所有资料、信息都在个人的账户上，已经是一名重度one drive依赖患者。而且付费的账户还是有那么些‘高级功能’是学校or商业版没有的。比如PowerPoint的设计灵感一般来说设计灵感都在开始/设计那一栏的末尾，最近换了公司新电脑发现不见了，以为是版本或者设置问题。按照谷歌的
2022-04-19 14:42:39
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原创 R语言|clusterprofile超几何分布富集分析 GO,KEGG富集分析，循环Fisher‘s test
超几何分布富集分析 GO,KEGG富集分析，循环Fisher‘s testID转换GOKEGG把KEGG里的geneid转回名称（readable table）超几何分布以及生成data frame生成用来循环fisher的table循环Fisher's test这几天真的被这个超几何富集分析做的头大。原来单纯用找到的显著基因分析出来的pathway不一定是准确的，或者说不一定是具有显著性的。详细的原理推荐下面两个链接https://www.jianshu.com/p/3d01a66e235bhtt
2021-12-24 17:52:26
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原创 R语言|替换数据，某列中换成别的值
R语言|替换数据，更换指定列的数据或注释在差异分析的时候经常需要考虑对照组，二分类的情况。把case和control换成0，1之类的。excel用Ctrl+F再替换虽ok，但数据集太大或者linux系统时并不方便两行简单的代码就可以实现替换：df$Group[df$Group == 'Case']<- 0 #将Group列所有case换成0df$Group[df$Group == 'Control']<- 1 #将Group列所有control换成1更简单的：df$Group<
2021-09-23 16:50:08
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原创 R语言|根据列名提取/筛选列的两种方法
R根据列名提取/筛选列A little thought刚入行的生信小白，还有很多R语使用不熟练。打算把常用的有用的记录在blog，以后就不用再重新百度谷歌了。也希望可以帮助到正在寻找答案的uu们当列太多想进行筛选的时候用index不是很方便，根据列名会更方便一点1. grepldf= read.csv('~/PD/normalization/ne/ne_0922.csv') #导入文件df2<- df[,grepl("UserID|NEFL|CCL27|GPNMB|GGT5|DPEP1"
2021-09-23 10:44:46
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空空如也
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