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原创 使用小鼠数据进行GSEA分析

使用小鼠数据进行GSEA分析Molecular Signatures Database (MSigDB) 是一个由Broad研究所创建和维护的重要资源。MSigDB包含了各种各样的资源，并且与多个物种有关，其中主要是人类相关的数据集。目前许多工作是利用小鼠模型研究人类疾病。MSigDB的数据集不能直接使用，需要经过基因映射到小鼠同源基因。最近的工作刚好需要处理这个事情，于是整理了目前的处理方式。利用GSEA工具分析需要的输入数据包括：表达矩阵（GCT，TXT）表型文件（CLS）数据集文件（GM