是谁,把InnoDB表上的DML搞慢的?

0、导读

突然发现MySQL服务器上InnoDB表的DML线程频繁被阻塞,TPS下降比较厉害,是什么原因导致?

1、问题

我的朋友小明(又是悲催的小明),发现有个MySQL数据库最近DML明显变慢了,执行SHOW PROCESSLIST总能看到DML线程状态,TPS下降也挺厉害的,不知道什么原因。

接到小明的求助,我第一反应是,可能有几个原因:

  1. 服务器的性能不足;

  2. InnoDB buffer pool size分配不够;

  3. 表DDL设计不合理,例如没有基于索引的SQL请求,或者InnoDB表没有使用自增列做主键,或索引太多;

  4. MySQL中有些SQL效率太低,影响整体性能;

  5. 当前有其他进程负载较大,影响到mysqld进程的性能;


那么到底是什么原因导致InnoDB表上的DML操作很慢呢,下面一起来一步步排查吧。

2、排查

2.1、查看整体负载

先执行top看系统负载,看看高不高,并确认瓶颈是否在mysqld进程:

可以看到,系统负载不算高,mysqld进程的CPU消耗比较大,疑似索引可能存在问题。

从top的结果也没看到有其他进程在和mysqld进程抢占资源,消耗cpu或内存等资源。

另外mysqld进程占用的内存不小,按理不应该是InnoDB buffer pool分配不足的原因了。不过,我们也注意到used很大,但buffers+cached不大,疑似发生内存泄露。

2.1、查看MySQL内部SQL请求

接下来我们看看MySQL内部的一些SQL请求,是否存在索引设计不当导致SQL效率太差的情况。

并没有耗时特别久的SELECT请求,排除这个因素。

同时也排除了因为表DDL设计不合理导致DML太慢的因素,这个的背景知识详见 [MySQL FAQ]系列 — 为什么InnoDB表要建议用自增列做主键

排查到这里,似乎无解了?

等等,我们再来检查InnoDB status看看:

从上面这些信息里我们注意到几个重要信息:

  • un-Purge太大了,足有46万(History list length 462312,太大了);

  • 个别事务启动太久一直没提交(TRANSACTION 8682844862, ACTIVE 3235 sec,将近1个小时);

  • 个别事务里生成的undo太多(undo log entries 14365,一个事务里1万多undo,要死人的节奏);

  • buffer pool中的脏页不算多(Modified db pages  134050,约2GB,相对于总共90G的buffer pool才占2.2%,也还好);


基本可以怀疑是因为unpurge list太大,导致DML被阻塞了,看看InnoDB的几个选项确认下:


上面这2个配置选项的意思是:

1、当InnoDB检测到当前unpurge list大于10万时,就会阻塞所有的DML请求;

2、每次DML请求被阻塞延时至少是  ((purge_lag/innodb_max_purge_lag)×10)–5 毫秒,最大阻塞延时是1000毫秒(1秒)。在上面的例子中,最少被阻塞 (462312/430000)*10-5=5.7514 毫秒,最久1秒;


这就能很好解释为什么InnoDB表上的DML请求总是那么慢了。

但是,为什么unpurge会这么大呢,继续追根刨底。

我们先来看下 information_schema.innodb_trx 视图,这个视图记录了当前所有活跃事务列表:


共有3个活跃事务,其中最早的一个是04:39:02开始的,而当前时间是05:32:25,两者相差了将近1个小时。可见,是因为有个较早的事务,一直没有提交/回滚,导致这个unpurge的列表越来越大在InnoDB中,执行purge工作前要先判断哪些数据(主要是Undo Log,被标记为删除的数据,以及二级索引中被删除的记录)可以被删除

在本例中,因为有个事务长时间没提交,它有可能需要读取这些旧数据,所以是不能被purge的,直到确认没有任何事务需要读取这些旧数据时,才能将它们清除。

3、解决方案

至此,我们知道为啥DML会很慢的原因了,解决起来就简单了:

  • 及时提交长时间的事务,例如本例中应该及时提交线程ID为4886791的事务,实在找不到是哪个业务连接的话,就只能直接把这个线程给kill了。我在最近的几次大会上分享时,也提到应该及时杀掉长时间不活跃的连接,因为它们是有可能存在未提交的事务的。这个是治本的办法;

  • 设置autocommit=1,尤其应该检查一些gui客户端,例如MySQL Workbench、Navicat,它们极有可能在连接MySQL时采用autocommit=0的模式,应该调整过来。这个也算是治本的办法之一;

  • 在避免undo log暴涨的前提下,可以适当调大 innodb_max_purge_lag 值以允许存在更大的unpurge列表,还应适当调低 innodb_max_purge_lag_delay 值,降低每次DML被阻塞的耗时。这个是治标的办法,不太建议;


延伸阅读:

找到MySQL服务器发生SWAP罪魁祸首

附视频及ppt:在线分享《从案例说InnoDB的基本优化》总结

FAQ系列 | 如何避免ibdata1文件大小暴涨

[MySQL FAQ]系列 — 从MyISAM转到InnoDB需要注意什么

[MySQL FAQ]系列 — 为什么InnoDB表要建议用自增列做主键


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