NeoBilly的专栏

原创 倒数日

php -r ' error_reporting(0); $nowSecInt = time(); $deadLineSecInt = mktime(12,0,0,7,12,2014);$days = ($deadLineSecInt - $nowSecInt) / (24*3600); print $days . "\n";'距离毕业还有145天

原创 中期报告数目统计

for org in celegans chicken  cow dm human mouse tair yeast zebrafish; doecho $org;hgsql -e 'select count(id) from '${org}'_gene;' ncrnadonefor org in  human mouse; doecho

原创 NONCODE class code file

for org in dm celegans chicken cow human mouse tair yeast zebrafish;dohgsql -e 'select * from '$org'_gene_class into outfile "/data/tmp/NONCODEv4_GeneClass/'$org'_gene_class"' ncrna ;hgs

原创 相识天数计算器

php -r '$timeNum0 = mktime(12,0,0,4,18,2011); $timeNum1 = time(); $days = ($timeNum1 - $timeNum0) / (24 * 60 * 60); echo intval($days) + 1; 'php -r '$timeNum0 = mktime(12,0,0,4,18,2011); $timeNum1 =

原创 创建gtf下载

搞错俩， 麻利的改回来cat id.v4_xloc  | perl -ne '@t = split(/\t/, $_); chomp @t;  $nId = "NONHSAG" . substr("000000", 0 , 6 - length($t[0]."") ) . $t[0]; print $t[1] . "\t" . $nId . "\n";' | perl /leo

原创 创建gtf下载数据

cat id.v4_xloc  | perl -ne '@t = split(/\t/, $_); chomp @t;  $nId = "NONHSAG" . substr("000000", 0 , 6 - length($t[0]."") ) . $t[0]; print $t[1] . "\t" . $nId . "\n";' | perl /leofs/noncode/NONCODEv4/

原创 NONCODE 入库

head bed.v4.ncrna head -2 v4.stats | tail -1 | perl -ne '@t= split(/\s/, $_); chomp @t; for($i = 6; $i for org in bosTau6 galGal3 tair10 dm3 ce10 danRer7 sacCer3docd $orghead -2

原创 ncRNA num

less draw.shfor((i=1; i < 20; i ++))do echo "ping 192.168.1."$i; donecd /leofs/noncode/NONCODEv4 rm -rf CNCI_tmp/nohup perl CNCI.pl -f cow.fa -p 50 -l libsvm-3.0 -o result_cow -b &ps aux | gr

原创 noncode

cat  cnci.result.file | cut -f 1 | sed -e 's/>//' > cnci.1.tconscat cnci.result.file  | perl -ne '@t = split(/\t/,$_); $t[0] =~ />(.*)/; $tid = $1; $t[2]  =~ /score: (.*)/; $score = $1; print $t

原创 文件 级别的并行 画图

fpkmTable=$1pNum=$2cat $fpkmTable | awk '{print $0 >> "'$fpkmTable'"NR%'$pNum';}'####CAT THE HEADERfor (( i = 0; i cat header  $fpkmTable""$i > $fpkmTable"."$idone####START THE PROGR

原创 we

wc -l bed.v4.lnc v4.bed.rmCoding.cnci ls fpkm | perl -ne 'chomp ; if($. != 1){ print "\t";} print $_;' > headerfor dir in `ls fpkm|head -1`; do  awk -F "\t" 'NR != 1' fpkm/$dir/genes.f

原创 WC bug

原创 打印Djvu文件，导致打印机驱动堵塞，

重新安装网络打印机，解决CUPS 端口 631

原创 修改U盘图标

<br />有的时候就是很无聊啊，比如现在，要搞的东西，突然陷入了一个抉择的时刻，我做不了决定，就等导师来了，这段时间，干什么呢？来搞搞U盘的图标好了。<br />不管怎么整，首先要有一个.ico的文件，我是没找到，决定自己做一个。<br />WIN+R：输入msdev,打开VC，新建一个图标文件，64*64的像素点阵，可以随便设计，我手笨，也就能画个菱形，写个字母之类的，设计好之后，保存为label.ico。<br />将.ico 文件放入U盘下，新建文件Autorun.inf，内容如下<br />[Au

原创 修改U盘图标

[size=medium][color=darkblue]有的时候就是很无聊啊，比如现在，要搞的东西，突然陷入了一个抉择的时刻，我做不了决定，就等导师来了，这段时间，干什么呢？来搞搞U盘的图标好了。不管怎么整，首先要有一个.ico的文件，我是没找到，决定自己做一个。WIN+R：输入msdev,打开VC，新建一个图标文件，64*64的像素点阵，可以随便设计，我手笨，也就能画个菱形，写个字母之...

原创 Perl候选项 不提取到$1

[size=medium][color=blue]今天，处理文本时候，提取信息，出现了一个结构，使得要么是单词A，要么是单词B，这时候，就需要用到或的逻辑，在正则怎么构造呢？这个东西叫做候选项，可以构造如下结构/Jim|Tom|Tim/#匹配三个人名/(Ji|To|Ti)m/#再次匹陪三个人名，提取（）到$1/(?:Ti|To|Ji)m/# 还是匹配三个人名，不提取到$1参考文献：...

原创 Perl候选项 不提取到$1

<br />今天，处理文本时候，提取信息，出现了一个结构，使得要么是单词A，要么是单词B，这时候，就需要用到或的逻辑，在正则怎么构造呢？这个东西叫做候选项，可以构造如下结构<br />/Jim|Tom|Tim/#匹配三个人名<br />/(Ji|To|Ti)m/#再次匹陪三个人名，提取（）到$1<br />/(?:Ti|To|Ji)m/# 还是匹配三个人名，不提取到$1<br />参考文献：<br />  Perl 语言编程（第三版）P217

原创 搭建BBS，Apache + php + MySQL + phpMyAdmin + UCenter

<br />UCenter 的配置      <br />下载Apache,php,MySQL,phpMyAdmin,Ucenter<br />分别解压到D:/<br />建立Apache服务器，解压php,修改php.ini,修改httpd.conf<br />使php能够被apache解析，然后，搭建MySQL,建立了MySQL后，<br />下载phpMyAdmin,解压，放到网站根目录下，在浏览器访问<br />http://localhost:808

原创 网络打印机的配置 WINDOWS XP Ubuntu

<br />在XP下，下载打印机的驱动，解压到某文件夹，打开控制面板，点击打印机和其他硬件，添加打印机，选择网络打印机，点击下一步，输入打印机URL,浏览驱动，选择某个inf即可安装。。。<br />在Ubuntu下，访问CUPS<br />http://localhost:631<br />选择Administration,Add Printer,选择IPP，continue,输入打印机所在URL，根据打印机进行相应配置，即可。。。

原创 搭建BBS，Apache + php + MySQL + phpMyAdmin + UCenter

[size=medium][color=blue]UCenter 的配置 下载Apache,php,MySQL,phpMyAdmin,Ucenter分别解压到D:\建立Apache服务器，解压php,修改php.ini,修改httpd.conf使php能够被apache解析，然后，搭建MySQL,建立了MySQL后，下载phpMyAdmin,解压，放到网站根目录下，在...

原创 网络打印机的配置 WINDOWS XP Ubuntu

[size=medium][color=blue]在XP下，下载打印机的驱动，解压到某文件夹，打开控制面板，点击打印机和其他硬件，添加打印机，选择网络打印机，点击下一步，输入打印机URL,浏览驱动，选择某个inf即可安装。。。在Ubuntu下，访问CUPShttp://localhost:631选择Administration,Add Printer,选择IPP，continue,输入...

原创 方案 差错处理机制

<br />昨天开组会的时候，讨论到一个问题，是我们要做一个web service，当发生错误的时候，怎么处理的问题，<br />比如，网站后台正算着一个进程，突然断电了，或者，有一个进程陷入死循环了，这时候该怎么处理？<br />以下的方案是刘老师给出的：<br />每当一个进程启动时，在log文件中，写入一条记录，记录进程开始，时间和进程名都要，当进程正常结束时，则写入进程结束的记录，这样，每次开机时，网站读取日志，所有只有开始记录，找不到结束记录的进程，均被定义为非正常结束，然后可以进行下一步的异常处

原创 方案 差错处理机制

[size=medium][color=blue]昨天开组会的时候，讨论到一个问题，是我们要做一个web service，当发生错误的时候，怎么处理的问题，比如，网站后台正算着一个进程，突然断电了，或者，有一个进程陷入死循环了，这时候该怎么处理？以下的方案是刘老师给出的：每当一个进程启动时，在log文件中，写入一条记录，记录进程开始，时间和进程名都要，当进程正常结束时，则写入进程结束的...

原创 老外名字中间的点怎么输入 微软拼音 @

<br />今天在做PPT的时候，要输入一老外的名字，叫伯纳德·罗斯纳,这个中间的点怎么输入难住了，上网一查，解决了，方法是：切换到微软拼音输入法，中文方式下输入@,打出来就是点了，能打出来，当然高兴，可是，如果，我是在linux下，我该怎么输入呢，那可装不了微软拼音啊，可以复制粘贴这个点，没有别的办法吗？目前没发现其他方法

原创 老外名字中间的点怎么输入 微软拼音 @

[size=medium][color=blue]今天在做PPT的时候，要输入一老外的名字，叫伯纳德·罗斯纳,这个中间的点怎么输入难住了，上网一查，解决了，方法是：切换到微软拼音输入法，中文方式下输入@,打出来就是点了，能打出来，当然高兴，可是，如果，我是在linux下，我该怎么输入呢，那可装不了微软拼音啊，可以复制粘贴这个点，没有别的办法吗？目前没发现其他方法。[/color][/siz...

原创 Ubuntu下工作与学习 文本启动 图形切换 语言切换 无声音

<br />今天，突然觉得厌倦了Ubuntu的图形界面，想要从文本方式工作，众所周知，从图形界面切换到文本界面，可以使用Ctrl+Alt+F6,从文本界面切换回来Ctrl+Alt+F7,可是这样切换，图形界面所占用的大量资源并没有释放，更进一步，想到要从开机就是文本模式，这我以前在Fedora下搞过，那是在grub的配置文件，稍作修改即可<br />修改grub.conf(menu.lst也行)，在kernel 行的末尾加一个1，就表示文本方式启动，即使不改配置文件，开机进grub的时候，也可以按c

原创 Ubuntu下工作与学习 文本启动 图形切换 语言切换 无声音

[size=medium][color=blue]今天，突然觉得厌倦了Ubuntu的图形界面，想要从文本方式工作，众所周知，从图形界面切换到文本界面，可以使用Ctrl+Alt+F6,从文本界面切换回来Ctrl+Alt+F7,可是这样切换，图形界面所占用的大量资源并没有释放，更进一步，想到要从开机就是文本模式，这我以前在Fedora下搞过，那是在grub的配置文件，稍作修改即可修改grub.co...

原创 Linux学习 设置Shell语言 bg fg 文本方式启动

[size=medium][color=darkblue]1.临时设置shell语言 export LANG="en_US.UTF-8"2.lynx www.google.com 突然想去干别的事 还想回来 Ctrl + z暂停， bg 放后台 干别的， + fg 回来3.Ubuntu 的grub好像升级了，现在/boot/grub下没有grub.conf没有men...

原创 ssh 和 passwd

[size=medium][color=darkblue]ssh [email protected](yes)：******登录上后，修改密码～passwd~(current) UNIX passwd:New UNIX passwd:Retype new UNIX passwd:[/color][/size]

原创 Perl 程序 筛选记录保存文件

[size=medium][color=darkblue]今天早上，有这样的需求，一批文件，12个，每个文件命名规则是promoter_****,这些文件中保存一条条记录，每条记录10个字段，第七个字段，要取出来，如果该字段绝对值小于等于1000，则将该记录取出来，保存到promoterLT1000_****中用vi :setlist观察文件，发现记录字段以^I(\t)分隔，所以只需读出每...

原创 Perl程序 拼接文件

[size=medium][color=darkblue]#!/usr/bin/perlmy $in1 = $ARGV[0];my $in2 = $ARGV[1];my $out = $ARGV[2];die "需要输入文件1" if(!defined($in1));die "需要输入文件2" if(!defined($in2));die "需要输出文件1" if(!def...

原创 Shell学习，vi命令set list

[size=medium][color=darkblue]由于经常要处理一些文本，我们都是假定文件具有某种结构，这时候,为了看清每行的真正结构，set list特别有用#vi :set list注意$是每行的结束符号[/color][/size]...

原创 Shell学习，显示不可见字符

[size=medium][color=darkblue]今天，导师，又展示给俺一招#vi xxx:set listvi 的set list命令可以将不可看见字符打印出来，比如^I是Tab(\t),^M是WIN的换行(\n\r)请注意^I 不是^ I 而是Ctrl + i^M 是Ctrl + V Ctrl + M[/color][/size]...

原创 Shell学习，bg命令

[size=medium][color=darkblue]bg命令的使用当一个任务段时间内无法完成，可以将该任务放入后台执行，使用的命令是bg有一个文件夹，其中保存有31815个文件，每个文件几十k,ls命令都要等好久，而我有一个处理每个文件的脚本，所以，很有必要将脚本放入后台运行#cmd程序已经开始跑了，这时突然想将她放入后台， Ctrl+z该命令将程序stoppe...

原创 Shell学习，vi命令

[color=darkblue][size=medium]今天，导师又教了俺几招，首先是top命令，命令行下输入#top显示当前的进程的活动情况，主要有如下几个字段PID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND按下k,则出现PID to kill:输入要杀死的进程的PID即可下面将是批量处理文件的一般步骤首先，...

原创 Perl PHP R MySQL Hadoop JSP

<br />Perl:简单应用，checked<br />PHP:熟练建站，30days<br />R:熟练运用，30days<br />MySQL:简单运用，30days<br />Hadoop:简单了解，30days<br />JSP:熟练建站，30days

原创 Once i loved a girl

[size=medium][align=center][color=darkblue]time goes slower without youi now just know the worst thingi have done is letting you gowe are neither perfectbut with you the feeling is perfectal...

原创 Perl probeDB的提取

[color=darkblue]开始做毕设了，导师给的题目是做关于siRNA的东西，具体我也不太清楚，总之，按部就班的来就好了。第一步，是要将包含probeDB的31815个网页下载下来，这些网页保存在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects /genome/probe/reports/probereport.cgi?uid=xxx的地址上，而能得到的关于xxx...

原创 百度的搜索结果 部分未做链接，这是为什么？

个人认为可能是技术问题，本身应该都是带着链接的，是不是采用的某种技术出现了这样的BUG,导致部分的查询结果的链接漏掉了，或者采取了过滤，直接就没有加链接……下为截图：

原创 CMD:stop and start service process

>net start mssqlserver>net start sqlserveragent>net start mysql >net start apache2.2>net stop mssqlserver>net stop sqlserveragent>net stop mysql>net stop apache2.2