UltraEdit为什么总是提醒我“希望转换file到DOS格式吗”？

主要是  文件格式区别 的问题
一般来说，你可以选择否，即不转换为DOS格式

如何取消提示

点选 高级 菜单—文件处理 — 选择 DOS/UNIX/MAC 处理 ，在右侧的unix/mac 文件检测/转换下面，勾上 禁用。确定，以后就没有了。

如果你想知道缘由，接着往下看
我们先看看这三个家伙有啥区别。很久以前，人们用老式的电传打字机作为输入设备，它使用
两个字符来另起新行：
 一个字符把滑动架移回首位 (称为回车，<CR)，
另一个字符把纸上移一行(称为换行，<LF)。

当计算机问世后，由于存储器曾经非常昂贵。有些人就认定没必要用两个字符来表示行尾。于是
UNIX 开发者决定他们可以用 <Line Feed 一个字符来表示行尾。
Apple 开发者规定了用 <CR。
开发 MS-DOS (以及微软视窗) 的那些家伙则决定沿用老式的 <CR<LF。
三种行尾格式如下:
unix <LF
dos <CR<LF
mac <CR
这意味着，如果你试图把一个文件从一种系统移到另一种系统，那么你就有换行符方面的麻烦。
如果你的程序将来需要在UNIX/linux，最好是保持 unix的格式。