分子动力学模拟—LAMMPS 数据后处理软件（四）: Lindemann Index

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 Lindemann Index软件的计算结果：

记录一下检索到一篇分子动力学模拟数据后处理的软件 Lindemann Index 。

感谢程序的原作者！

附件下载：

https://github.com/N720720/lindemann

主要功能：

Lindemann is a Python package to calculate the Lindemann index of a LAMMPS trajectory, as well as the progression of the Lindemann index per frame or per atom and frame of temperature ramps for phase transition analysis.

Figure 1 附件下载

Figure 2 安装过程

Figure 3 使用命令

操作选项：

Options:
-t: Calculates the Lindemann-Index for the Trajectory file(s) [default: False]-f: Calculates the Lindemann-Index for each frame. [default: False]-a: Calculates the Lindemann-Index for each atom for each frame. [default: False]-p: Returns a plot Lindemann-Index vs. Frame. [default: False]-l: Saves the individual Lindemann-Index of each Atom in a lammpstrj, so it can be viewed in Ovito. [default: False]-v, --version: Prints the version of the lindemann package.-ti, -timeit: Uses timeit module to show running time [default: False]-m, -mem_use: Calculates the memory use. Run it before you use any of the cli functionality despite the -t flag [default: False]--help: Show this message and exit.

Figure 4 演示效果

Figure 5 计算结果

Figure 6 操作过程

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以上说明过程均没有测试结果是否准确，大家如有需要，需自行验证，慎用慎用！

以上是我们分享的一些经验或者文章的搬运，或有不足，欢迎大家指出。

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