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给大家推荐一个结构轨迹后处理程序 ISAACS,这个后处理软件可以计算径向分布函数、均方位移、键角和结构因子等性质。
大家有需要的话,可以自行学习一下!
文章题目:
ISAACS – interactive structure analysis of amorphous andcrystalline systems
网站链接:
http://isaacs.sourceforge.net/ex.html
http://people.cst.cmich.edu/petko1vg/isaacs/ex.html
ISAACS 是一个用于分析由计算机模拟建立的三维结构模型的结构特征。
计算内容:
一、X射线或中子散射数据
二、径向分布函数 Radial distribution functions g(r)
1. total RDFs for neutrons and X-rays
2. partial RDFs
3. Bathia–Thornton RDFs
三、结构因子Structure factors S(q)
1. totalstructure factors S(q) for neutrons and X-rays
2. Faber–Ziman partial S(q)
3. Ashcroft–Langreth partial S(q)
4. Bathia–Thornton partial S(q)
四、原子键长特性
1. 配位数 coordination numbers
2. 键角 Distribution of bond angles
3. 近原子邻居分布 atomic near neighbor distribution
4. fraction of links betweentetrahedra
5. fraction of tetrahedral units
6. bond-lengthdistribution for the fifirst coordination sphere
五、均方位移 mean square displacement (MSD)
Figure 1
Figure 2
Figure 3
Figure 4
Figure 5
Figure 6
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