【程序分享】bopcalc 程序：一种评估分子动力学模拟中键序参数的高效方法（二）

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分享一篇使用一种评估键序参数的高效程序：bopcalc 。

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主要内容

“ 我们提出了一种新颖、高效的方法来评估键序参数 (BOP)。我们的方法利用球谐函数和 Wigner 符号的特性来减少 BOP 表达式中的项数，并采用归一化关联勒让德多项式和三角函数的同时插值来显着减少算术运算的总数。使用真实的测试用例，我们展示了上述方法与 CPU 缓存友好的数据结构相结合，如何使当前使用的方法性能提高 10 到 50 倍，具体取决于插值网格的大小和使用的机器. 由于所提出的方法是一种近似方法，因此我们证明它引入的错误是良好的、可控的并且对于实际网格大小基本上可以忽略不计。”——取自文章摘要。

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