Purity_y的博客

原创 DpabiSurf数据处理

摘要：本文介绍了DPABISurf处理流程的配置与操作要点。配置方面建议将Docker安装在非C盘，设置存储限制，并注册License。数据处理包含两种空间标准化方案：1)在原始空间计算后标准化；2)先标准化再处理。详细说明了BIDS格式数据的处理流程，包括结构像分割、功能像配准、头动校正及皮层重建。特别介绍了抑郁症研究中海马亚区分割和个体化核团功能连接分析方法。统计部分强调正确选择mask和结果路径，建议保存显著团块并进行后续分析。最后提及了DPABISurf的多种应用，包括计算脑区特征值、空间相似性分析

原创 Dapbi数据处理实操+dynamic

本文探讨了脑功能动态性分析的指标与方法，重点关注单个体素层面的ALFF指标、动态功能连接分析以及稳定性评估。研究比较了不同功能侧面之间的关系，包括滑窗全局fALFF与ReHo的相关性分析。在统计分析方面，详细介绍了质量控制、t检验、方差分析等方法的实施要点，强调多重比较矫正的重要性，推荐使用TFCE方法。同时提供了数据处理实操指南，包括协变量设置、mask生成和结果可视化等步骤。研究还探讨了脑功能稳定性的定义和测量方法，建议在功能研究中避免使用基于AAL的图谱。

原创 【无标题】

需要配置docker，matlab2020a（但我看老师的是2024b)ALFF可以先smooth，Reho不要先平滑。做不做grobal signal有争议。resultsS：是做了smooth的。sym是配到更镜像对称的模板上。转FunRaw T1Raw。

原创 Dpabi

摘要：本文介绍了fMRI数据处理的流程和注意事项。数据整理阶段需规范命名（如T1Raw、FunRaw），注意核对被试信息以避免维度错误。预处理包括Fieldmap校正形变、头动协变量处理等，但需注意ReHo不能平滑处理。皮层分析优于体空间，需使用高配置设备（内存>16G）进行皮层重建。此外还涉及Docker安装、数据共享规范及动物数据处理（猴脑模板差异）等内容。关键点包括：数据整理核对、预处理步骤限制、皮层分析优势及跨物种处理差异。

原创 任务态MRI_4SPM数据预处理

摘要：本文详细介绍了fMRI数据预处理流程，包括使用SPM和DPABI工具进行DICOM格式转换、时间层矫正、头动矫正、配准标准化和平滑处理。重点分析了不同平滑核（FWHM=6/4）对信噪比、空间分辨率和统计检验的影响。文章还提供了批处理代码示例，涵盖结构像和功能像处理的全流程，并详细说明了任务态数据分析中onset时间的计算方法及注意事项。预处理流程涉及灰质分析，包含时间层矫正（参考层选择）、头动矫正、空间标准化等关键步骤，最终生成SPM.mat文件用于后续分析。

原创 任务态MRI_2实验设计类型

TR持续时间：短TR能够生成更多数量的时间点，同时可能增加Power（也是统计检验力），但短TR会降低每个trial的MRI信号。TR数量越多，理论上统计检验力越大，但TR过多会增加扫描成本，收到被试忍耐力的影响，每次扫描大约30min-90min。神经元激活开始，到检测出bold信号改变，用血流动力学函数来表示（HRF）短TR，ISI变短，更高的事件频率，更高相关，POWER降低。G-power：统计检验力1-β大，0.8，先验后验。Event-related设计。氧合血红蛋白\脱氧血红蛋白之比。

原创 任务态MRI_第一课Eprime操作及数据提取

按键反应，按键设置，呈现时间，记录按键；[picture]选陆军：一般呈现500ms，空屏1500ms，每个休息时间不固定（排除共线性，可用excel-rand(0,1)随机生成。算正确率用SPSS拆分文件，拆分正确的，不同session和不同condition的‘一个实验的完整缓解：多少个trial，每隔trial包含缓解。trial重复多次，通过list定义每隔trial的相关信息。正式开始，包含多少个trial。注：被试按键表示已了解指导语，主试按键开始扫描。7.致谢，反馈，退出实验。

原创 Day1-Day5总结

原创 Day5静息态脑电功能连接分析（傻瓜教程含代码）

连接：通道与通道/脑区与脑区之间的关系结构连接：sMRI、dMRI功能连接：fMRI（皮尔逊相关系数）、fNIRS（相关，相干、相位同步等）、EEG（相干、相位同步等）时间分辨率（采样率）、空间分辨率EEG时间分辨率高、空间分辨率低fMRI时间分辨率低、空间分辨率高fNIRS：居中静息态——基于感兴趣的频段任务态——基于感兴趣的时频段电极层面源层面无向连接（相关、相干、相位同步等）有向连接（格兰杰因果）静态连接动态连接本文涉及节点Node-- 通道/脑区。

原创 Day4任务态脑电的时频分析（傻瓜教程含代码）

取频率最小值的倒数，作为窗口的长度。

原创 Day3 频域分析（含数据预处理）（傻瓜教程含代码）

脑电时域分析（含预处理，主要是单因素，方差分析仅提值）

原创 Day2脑电时域分析（含预处理）

得到组平均的数据再画图0如何计算组平均的数据进行绘图横轴是时间范围通过图去判断ERP成分LPP晚期正成分例如接下来以晚期正成分为示例，绘制地形图但我们需要绘制ERP成分，所以需要时间窗。

原创 Day2 脑电预处理批处理

Matlab_EEG_eeglab数据预处理

原创 脑电预处理的具体步骤

6、分段（基线校正，可以考虑只保留反应正确的分段）11、卡极端值（±100，±80，±70）1、原始数据转为set格式。

原创 246脑图谱MNI坐标对应

https://visexmb0v39.feishu.cn/wiki/Nmw3wqFggirkvkkCHkGcZ9Lqnrd?from=from_copylink参考文献：