MCF-7细胞膜包覆PLGA纳米球共载姜黄素和二氢卟吩e6|细胞膜外囊泡包覆的纳米颗粒

最新推荐文章于 2024-07-23 18:36:46 发布
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MCF-7细胞膜包覆PLGA纳米球共载姜黄素和二氢卟吩e6|细胞膜外囊泡包覆的纳米颗粒

规格：2mL;5mL;10mL
主要组成：细胞膜组分（真核或原代细胞）、高分子内核材料、功能因子
制备方法：薄膜包覆法
粒径控制：100-150 nm 
平均电位：~ -20 mV
包载因子：影像分子、免疫分子等功能因子

 细胞膜接枝多肽:
细胞膜脂质接枝NY-ESO-1多肽和GPI片段
CNE-2Z细胞膜接枝蝎毒多肽(antitumor peptide from Buthus matensii Karsch,APMV)
PC12细胞膜修饰东亚钳蝎毒素多肽
荧光染料DiBAC4(3)标记的PC12细胞
细胞膜-RGD多肽
介孔二氧化硅纳米颗粒表面修饰作为肿瘤血管/肿瘤细胞膜靶向配体的RGD多肽
多肽精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸(RGD)修饰细胞膜
载有荧光标记siRNA的Tyr-RGD-PEG-PEI纳米载体
PLGA-Cy5.5-@Fe3O4-RGD靶向双模态分子探针
胰腺癌细胞膜包裹QDs@Gd-RGD纳米探针

axc

齐岳生物科研试剂
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以SRA数据库中DRP003950数据集为练习对象。该数据集使用Tamoxifen处理MCF-7细胞系，分别测定了1到12周处理组和对照组的表达谱。为简单起见，本实验仅要求比较处理一周后MCF-7表达谱的变化情况，使用Hisat2进行序列比对，使用subread包进行基因转录水平定量
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好的，这是一个具体的数据分析任务。根据描述，以下是数据分析的步骤： 1. 下载并准备数据 首先，我们需要从SRA数据库下载DRP003950数据集中1周处理组的fastq文件。在本例中，下载的文件名为SRR1042867.fastq.gz。接着，我们需要下载并准备参考基因组文件，例如，使用Ensembl或NCBI等数据库下载人类基因组fasta文件和基因注释文件（gff3或gtf格式）。在本例中，我们使用GRCh38版本的人类基因组fasta和gff3文件（文件名分别为GRCh38.fasta和GRCh38.gff3）。 2. 序列比对 接下来，我们需要使用Hisat2进行序列比对。首先，我们需要构建索引文件，以便Hisat2在比对时可以快速查找参考基因组的信息。使用以下命令生成索引文件： ``` hisat2-build -p 4 GRCh38.fasta GRCh38_index ``` 其中，-p参数指定使用的线程数，GRCh38.fasta为参考基因组文件，GRCh38_index为生成的索引文件名。 接着，我们可以使用以下命令进行序列比对： ``` hisat2 -p 4 -x GRCh38_index -U SRR1042867.fastq.gz -S SRR1042867.sam ``` 其中，-p参数指定使用的线程数，-x参数指定使用的索引文件，-U参数指定输入的fastq文件，-S参数指定输出的sam文件。 3. 转录本定量 最后，我们需要使用subread包进行基因转录水平定量。我们可以使用以下命令进行转录本定量： ``` featureCounts -T 4 -a GRCh38.gff3 -o counts.txt SRR1042867.sam ``` 其中，-T参数指定使用的线程数，-a参数指定基因注释文件，-o参数指定输出文件名，SRR1042867.sam为上一步Hisat2比对得到的sam文件。 这样，我们就完成了1周处理组MCF-7表达谱的变化情况分析。需要注意的是，这仅仅是一个简单的流程示例，具体的数据分析过程可能因实验设计、数据量、数据质量等因素而有所不同。
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