LCS算法

本文参考(菜鸟小筑

LCS问题即最长公共子序列问题,它要求所求得的字符在所给的字符串中是连续的(例如:输入两个字符串BDCABA和ABCBDAB,字符串BCBA和BDAB都是是它们的最长公共子序列,则输出它们的长度4,并打印任意一个子序列)。


事实上,最长公共子序列问题也有最优子结构性质。

证明LCS的最优子结构:

记:

(字符串X)    Xi=﹤x1,⋯,xi﹥即X序列的前i个字符 (1≤i≤m)(前缀)

(字符串Y)    Yj=﹤y1,⋯,yj﹥即Y序列的前j个字符 (1≤j≤n)(前缀)

假定(最长公共子序列)    Z=﹤z1,⋯,zk﹥ ∈ LCS(X , Y)。


分类讨论:


Xm=Yn(最后一个字符相同):反证法得出,最后一个字符是Z(X和Y的LCS)的最后一个字符(假设位置为k),即Xm=Yn=Zk,不难看出,Zk-1∈LCS(Xm-1,Yn-1),即 Zk = Z(k-1)  + 1,所以问题将转化为求Xm-1与Yn-1的LCS



Xm != Yn(最后一个字符不相同):

1. 当Xm != Zk时候,Zk∈LCS(Xm-1,Yn)

2. 当Yn  != Zk时候,Zk∈LCS(Xm,Yn-1)

所以问题将转化为求 LCS(Xm-1,Yn)和 LCS(Xm,Yn-1)


由于上述当xm≠yn的情况中,求LCS(Xm-1 , Y)的长度与LCS(X , Yn-1)的长度,

这两个问题不是相互独立的:

两者都需要求LCS(Xm-1,Yn-1)的长度。

另外两个序列的LCS中包含了两个序列的前缀的LCS,故问题具有最优子结构性质考虑用动态规划法。


也就是LCS需要求三个方面的东西:

1. LCS(Xm-1,Yn-1) + 1

2. LCS(Xm-1 , Y) 和 LCS(X , Yn-1)

3. max{LCS(Xm-1 , Y) , LCS(X , Yn-1)}


转移方程:

             c[i-1,j-1] + 1                      ( Xm=Yn && i,j > 0 )

c[i,j] =  max{ c[i-1,j]  ,  c[i,j-1] }    (Xm != Yn && i,j > 0)

             0                                         ( i=0 || j=0 )


填写矩阵:


    Procedure LCS_LENGTH(X,Y);  
    begin  
      m:=length[X];  
      n:=length[Y];  
      for i:=1 to m do c[i,0]:=0;  
      for j:=1 to n do c[0,j]:=0;  
      for i:=1 to m do  
        for j:=1 to n do  
          if x[i]=y[j] then  
            begin  
              c[i,j]:=c[i-1,j-1]+1;  
              b[i,j]:="↖";  
            end  
          else if c[i-1,j]≥c[i,j-1] then  
            begin  
              c[i,j]:=c[i-1,j];  
              b[i,j]:="↑";  
            end  
          else  
            begin  
              c[i,j]:=c[i,j-1];  
              b[i,j]:="←"  
            end;  
      return(c,b);  
    end;  

#include<iostream>
using namespace std;

int lcs[100][100]; //记录LCS
char track[100][100]; //矩阵跟踪,用于最后输出 LCS串
char S[100], T[100]; 


void LCS(int slen, int tlen) {
	int i, j;

	//初始化矩阵
	for (i = 0; i <= slen; i++) lcs[i][0] = 0; 
	for (i = 0; i <= tlen; i++) lcs[0][i] = 0;


	for(i=1;i<=slen;i++)
		for (j = 1; j <= tlen; j++) {
			if (S[i] == T[j]) {
				lcs[i][j] = lcs[i - 1][j - 1] + 1;
				track[i][j] = 'Q';  // 左上
			}

			if (S[i] != T[j]) {
				if (lcs[i - 1][j] >= lcs[i][j - 1]) {
					lcs[i][j] = lcs[i - 1][j];
					track[i][j] = 'W'; // 上
				}
				else {
					lcs[i][j] = lcs[i][j - 1];
					track[i][j] = 'A'; // 左
				}
			}
		}
}

void printLcs(int slen,int tlen) {
	int i, j;
	char q[100]; //存储LCS串的栈
	int top = 0; //栈顶
	i = slen;
	j = tlen;
	cout << "length:" << lcs[i][j] << endl;
	cout << "LCS:";
	while (i != 0 && j != 0) {
		if (track[i][j] == 'Q') {
			q[++top] = T[j];
			i--;
			j--;
		}
		else if (track[i][j] == 'A') {
			j--;
		}
		else {
			i--;
		}
	}

	while (top != 0)cout << q[top--]; // 根据矩阵踪到的LCS串是倒序的,需要反过来输出。
}

int main() {
	int n, m, i;
	cin >> n >> m;
	for (i = 1; i <= n; i++)cin >> S[i];
	for (i = 1; i <= m; i++)cin >> T[i];

	LCS(n, m);
	printLcs(n, m);
	return 0;
}






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