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栅格数据实现最优参数地理探测器(OPGD)详细教程!
届时,你已经把所有因变量与自变量的关系都运行出来了,每一对都有一个Q值和P值,根据Q值的大小可以进行后续分析,这里也不对原理做过多解释了,P值主要是用于显著性检验的。此时,在RStudio右下方的“Packages”中,可以看到raster包以及其所依赖的sp包都处于选中的状态,表明二者都已经配置成功,且完成导入。注意了,上面代码的参数还是需要你自己改的,比如离散分割方法,尺度范围等等。你需要到相应的网站去下载你的研究区的自变量和因变量数据的栅格数据(可以是离散的,也可以是连续的)原创 2024-06-17 18:05:40 · 1726 阅读 · 0 评论 -
基于R语言的NDVI的Sen-MK趋势检验
本实验拟分析艾比湖地区2010年至2020年间的NDVI数据,数据从MODIS遥感影像中提取的NDVI值,在GEE遥感云平台上将影像数据下载下来。下载该10年间的数据后,打开RStdio并导入将趋势检验中将使用的R包。R语言计算完slope和Z值后,根据这两个结果就可以进行NDVI趋势制图了。使用栅格计算器将Slope和Z值计算结果相乘,最后得到趋势变化划分。−0.0005≥SNDVI≥0.0005 植被生长稳定。|Zs|≥0.196 通过95%置信度检验,显著。SNDVI≥0.0005 植被改善。原创 2024-01-18 17:04:59 · 1723 阅读 · 0 评论 -
常用植被物候提取方法
2] 刘建文, 周玉科. 站点尺度的青藏高原时序 NDVI 重构方法比较与应用[J]. 地理科学进展, 2018, 37(3): 427-437.(原创 2024-01-16 19:19:54 · 1424 阅读 · 0 评论 -
K-means算法通俗原理及Python与R语言的分别实现
其实,这个过程相对比较简单,给我一组聚类中心,总能根据到聚类中心距离最小原则生成一组聚类方案,然后计算各个类别到聚类中心距离总和是否下降,如果距离总和下降,就继续计算每类数据点平均值(新的聚类中心),对应的聚类方案要好(还是那句话:给我一组聚类中心,总能根据到聚类中心距离最小原则生成一组聚类方案),然后不断计算,直到距离总和下降幅度很小(几乎收敛),或者达到指定计算次数。第一类:2,4,9,10,11,12,13,14。#-------随机产生-----#聚成3类,分别有8,3,5个数据。原创 2023-12-08 00:34:30 · 1367 阅读 · 0 评论 -
利用R语言heatmap.2函数进行聚类并画热图
数据聚类然后展示聚类热图是生物信息中组学数据分析的常用方法,在R语言中有很多函数可以实现,譬如heatmap,kmeans等,除此外还有一个用得比较多的就是heatmap.2。而且通过对cluster树的比较,我们可以从中挑选出最好、最稳定到cluster方法,为后续分析打好基础!下面还是在调控聚类树,但是我没看懂跟上面的参数有啥子区别!X就是一个矩阵,里面是我们需要画热图的数据。Cc也是一个调色板,有11个颜色,也是渐进的。Rc是一个调色板,有32个颜色,渐进的。hv是一个热图对象!原创 2023-12-08 00:33:02 · 1764 阅读 · 0 评论 -
R语言中的机器学习
包提供了有效处理稀疏二元数据的数据结构,而且提供函数执Apriori和Eclat算法挖掘频繁项集、最大频繁项集、闭频繁项集和关联规则(包执行lasso (L1) 和ridge (L2)惩罚回归模型(penalized regression models)(包提供基于boosting的广义相加模型(generalized additive models)的程序(函数用重抽样的方法(交叉验证,bootstrap)估计分类错误率(包用bagging的思想做回归,分类和生存分析,组合多个模型(原创 2023-12-01 12:49:55 · 1175 阅读 · 0 评论 -
R语言可视化【ggplot2】
原文链接:https://blog.csdn.net/weixin_40695088/article/details/123584414文章的文字/图片/代码部分/全部来源网络或学术论文或课件,文章会持续修缮更新,仅供学习使用。目录R语言可视化【ggplot2】一、可视化介绍二、不同情况适用的图形类别比较: 数值关系:数据分布: 时间序列: 局部与整体:举几个例子: 类别比较:柱形图 类别比较:条形图 类别比较:克利夫兰点图 类别比较:南丁格尔玫瑰图 数值关系:散点图 数值关系:气泡图 数值关系:三维散点/转载 2022-11-26 14:58:50 · 2409 阅读 · 0 评论 -
如何在 VSCODE 中高效使用 R 语言 (图文详解)
因为radian 是 python编写,首先我们得先有 python 环境,安装参考:https://zhenglei.blog.csdn.net/article/details/88828229。但是由于现在需求要同时满足 Python,R 和网站要同时开发,为了避免来回切换不同的IDE,重复配置,还有路径一堆麻烦事。选安装目录时候,需要注意没必要安装在C盘,后续安装包会占用资源。建议在其他盘创建目录,然后以R版本号命名的方式安装R。来编写 R,也尝试用过 Pycharm 配置 R 环境。转载 2022-11-19 14:27:36 · 3296 阅读 · 2 评论 -
R及RStudio的安装
说到R语言的安装,再Windows平台上是很简单的。但是再Linux平台上简直就是一场噩梦……尤其是针对最新的R3.4等版本,每一次安装R能够在2小时内弄完,我就觉得是一个成功了。额外提一句,现在Microsoft开发了一种效率更高的R语言,叫做。微软自称它们开发的这一个版本R效率更高,我安装了,不过目前还没怎么看出区别……也可能是自己处理的问题不够复杂。有兴趣的话大家可以去试试。转载 2022-11-04 15:24:25 · 733 阅读 · 0 评论