医疗影像
HxShine
这个作者很懒,什么都没留下…
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1 pydicom使用体验
1 安装 http://pydicom.readthedocs.io/en/stable/getting_started.html windows需要下载exe文件安装,linux直接命令安装即可 2 使用 https://pyscience.wordpress.com/2014/09/08/dicom-in-python-importing-medical-image-data-into-原创 2017-02-16 11:53:42 · 7333 阅读 · 0 评论 -
几种分割loss
1 2d交叉熵(mutil class 分割)定义def cross_entropy2d(input, target, weight=None, size_average=True): # input: (n, c, h, w), target: (n, h, w) n, c, h, w = input.size() # log_p: (n, c, h, w)...原创 2018-04-13 15:45:40 · 17118 阅读 · 4 评论 -
计算精度以及roc曲线
1 敏感性以及特异性定义 https://en.wikipedia.org/wiki/Sensitivity_and_specificity 2 zhang博客讲的挺好的,但是有错误,还是可以参考 http://blog.csdn.net/abcjennifer/article/details/7359370 3 代码以及画roc曲线的图 参考: https://stackoverflo原创 2017-05-26 15:57:05 · 4074 阅读 · 2 评论 -
4 安装gdcm(用于读取压缩的dcm数据)
1 介绍 https://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/Gdcm/Doc0.4/html.user/DoxyInstallation.html 2 安装Swig https://github.com/swig/swiggit clone https://github.com/swig/swig.gitcd swig/./autogen.s原创 2017-04-17 12:09:54 · 27402 阅读 · 1 评论 -
CT值以及窗宽窗位(未完待续)
1 常见人体组织的CT值(HU)常见人体组织的CT值(HU)组织 CT值 组织 CT值骨组织 >400 肝脏 50~70钙值 80~300 脾脏 35~60血块 64~84 胰腺 30~55脑白质原创 2017-04-12 21:18:52 · 34075 阅读 · 0 评论 -
3 vtk读取并显示dicom文件
1 官方代码 http://www.vtk.org/Wiki/VTK/Examples/Cxx/IO/ReadDICOM 2 测试代码#include <vtkSmartPointer.h>#include <vtkImageViewer2.h>#include <vtkDICOMImageReader.h>#include <vtkRenderWindow.h>#include <vt原创 2017-02-15 16:31:37 · 10759 阅读 · 4 评论 -
2 itk安装记录
1 下载源码1 官网 https://itk.org/ 2 百度云盘 链接: http://pan.baidu.com/s/1eSKbpJG 密码: uuxb2 cmake编译及安装步骤基本跟vtk编译安装 http://blog.csdn.net/qq_16949707/article/details/55105071 一致,但是要选择DModule_ItkVtkGlue=ON 不然会原创 2017-02-14 21:21:36 · 1227 阅读 · 0 评论 -
2 MITK测试代码step4
1 官网教程 http://docs.mitk.org/2016.11/Step04Page.html2 Step4.cpp/*===================================================================The Medical Imaging Interaction Toolkit (MITK)Copyright (c) German C原创 2017-03-02 10:37:16 · 1583 阅读 · 2 评论 -
1 MITK编译安装详解
1 介绍官方文档http://docs.mitk.org/2016.11/index.html http://docs.mitk.org/2016.11/Architecture.html#OverviewPage_DesignOverview2 一些有用的链接MITK简介及安装 http://blog.csdn.net/taigw/article/details/49270489 MITK安原创 2017-03-01 15:15:34 · 10087 阅读 · 8 评论 -
1 用dcmtk库解释dicom数据
1 配置 http://www.voidcn.com/blog/zssureqh/article/p-1188605.html2 dicom数据理解 http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/87851323 帮助文档之数据读取参考例子 http://support.dcmtk.org/docs/mod_dcmdata.html4 读取基本数据原创 2017-02-17 16:25:08 · 6021 阅读 · 3 评论 -
1 深度学习图像分割
1 一些比较成熟的深度学习分割paper https://github.com/albarqouni/Deep-Learning-for-Medical-Applications#segmentation2 分割算法回顾这个不错 https://www.leiphone.com/news/201801/vV9tk5kK95g0spUG.html印象深刻的是膨胀卷积或带洞卷积(Dilated Co原创 2018-05-10 14:36:39 · 1801 阅读 · 0 评论