UVa1368——DNA Consensus String

题目的意思是:给你m个等长的DNA序列,求解的Consensus String 的第 i 个是每 i 列出现最多的字符,有相同大小的,按字典序排。

而consensus error是每一列不同的字符数之和。


下面的是AC的代码:

#include <iostream>
#include <cstring>
using namespace std;

char str[50][1005];
int ans[4];
int main()
{
//	freopen("1368.txt", "r", stdin);
	int t, m, n, i, j, k;
	char res[1005];
	cin >> t;
	while(t--)
	{
		cin >> m >> n;
		for(i = 0; i < m; i++)
			cin >> str[i];
		int a, t, c, g;
		k = 0;
		for(i = 0; i < n; i++)
		{
			a = t = c = g = 0;
			for(j = 0; j < m; j++)
			{
				if(str[j][i] == 'A')
					a++;
				else if(str[j][i] == 'T')
					t++;
				else if(str[j][i] == 'C')
					c++;
				else
					g++;
			}
			if(a >= t && a >= c && a >= g)
			{
				res[i] = 'A';
				k += m - a;
			}
			else if(c >= a && c >= t && c >= g)
			{
				res[i] = 'C';
				k += m - c;
			}
			else if(g >= a && g >= c && g >= t)
			{
				res[i] = 'G';
				k += m - g;
			}
			else if(t >= a && t >= c && t >= g)
			{
				res[i] = 'T';
				k += m - t;
			}
		}
		res[n] = '\0';
		cout << res << endl;
		cout << k << endl;
	}
	return 0;
}


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